222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0449 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  596  1e-169  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  72.76 
 
 		 293 aa  441  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0096  mycothiol conjugate amidase Mca  72.76 
 
 		 292 aa  435  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  73.43 
 
 		 294 aa  432  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  75.52 
 
 		 303 aa  428  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  65.73 
 
 		 287 aa  395  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  66.2 
 
 		 287 aa  392  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  67.02 
 
 		 309 aa  389  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  63.92 
 
 		 293 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  63.99 
 
 		 295 aa  385  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  63.1 
 
 		 291 aa  382  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  66.55 
 
 		 328 aa  367  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  62.46 
 
 		 312 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  62.06 
 
 		 288 aa  367  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  62.63 
 
 		 291 aa  365  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  60.56 
 
 		 289 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1101  LmbE family protein  62.84 
 
 		 313 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0911817  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  62.19 
 
 		 299 aa  361  9e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  62.37 
 
 		 290 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  62.37 
 
 		 290 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  62.37 
 
 		 290 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  67.14 
 
 		 303 aa  359  4e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  61.27 
 
 		 295 aa  351  8e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  58.89 
 
 		 316 aa  349  3e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  64.38 
 
 		 300 aa  349  4e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0942  mycothiol conjugate amidase Mca  61.32 
 
 		 295 aa  349  4e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  60.63 
 
 		 288 aa  342  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  65.53 
 
 		 298 aa  340  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  58.6 
 
 		 291 aa  329  3e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  61.67 
 
 		 290 aa  326  3e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1241  mycothiol conjugate amidase Mca  58.08 
 
 		 301 aa  323  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000367029 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1169  LmbE family protein  58.84 
 
 		 301 aa  317  2e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.805763  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  56.36 
 
 		 359 aa  314  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2633  mycothiol conjugate amidase Mca  55.4 
 
 		 293 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342297  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  53.66 
 
 		 303 aa  299  4e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05100  uncharacterized LmbE-like protein  50 
 
 		 330 aa  276  4e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34779  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1609  LmbE family protein  40.77 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  35.27 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  37.84 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  37.79 
 
 		 294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  39.46 
 
 		 286 aa  152  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  37.06 
 
 		 302 aa  152  8e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  35.22 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  36.15 
 
 		 307 aa  146  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1157  LmbE family protein  34.98 
 
 		 302 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103463  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3908  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidedeacetylase  38.36 
 
 		 282 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  35.05 
 
 		 302 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  36.58 
 
 		 314 aa  136  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  36.51 
 
 		 361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  33.79 
 
 		 299 aa  132  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1131  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  35.55 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  35.69 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  32.45 
 
 		 309 aa  125  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  33.9 
 
 		 276 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  33.67 
 
 		 271 aa  123  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  34.78 
 
 		 308 aa  122  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3763  LmbE family protein  34.45 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  35.12 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  33 
 
 		 283 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  33.78 
 
 		 296 aa  112  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194637 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  30.93 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  31.37 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  34.13 
 
 		 268 aa  108  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  33.55 
 
 		 284 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6362  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  30.72 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.797199  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1146  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  35.83 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0802505  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1717  LmbE family protein  32.05 
 
 		 265 aa  106  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264749  normal  0.141737 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  33.11 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  31.36 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4264  LmbE family protein  31.31 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  30.39 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4034  LmbE-like protein  30.99 
 
 		 308 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4109  LmbE family protein  30.99 
 
 		 308 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  31.45 
 
 		 299 aa  96.7  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  35.23 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  36.84 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11195  N-acetyl-1-D-myo-inosityl-2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside deacetylase mshB  36.92 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  36.53 
 
 		 306 aa  90.1  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2744  LmbE family protein  26.97 
 
 		 253 aa  90.1  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  35.44 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  30.22 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11830  uncharacterized LmbE-like protein  36.14 
 
 		 268 aa  86.3  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  33.33 
 
 		 463 aa  83.6  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  27.33 
 
 		 484 aa  80.9  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26080  uncharacterized LmbE-like protein  32.4 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  27.09 
 
 		 283 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7629  conserved hypothetical protein LmbE  37.82 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4309  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  39.76 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.414925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0963  LmbE family protein  32.2 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.871469  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0794  LmbE family protein  28.33 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  27 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3329  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  27.51 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  28.95 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  30.68 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2961  LmbE family protein  27.84 
 
 		 843 aa  70.1  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0537053  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  30.11 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  32.78 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  26.36 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1378  LmbE family protein  29 
 
 		 811 aa  68.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.455016 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3334  hypothetical protein  31 
 
 		 930 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896794  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>