187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1084 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  100 
 
 		 294 aa  591  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  65.05 
 
 		 292 aa  374  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  63.36 
 
 		 323 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  60.2 
 
 		 308 aa  339  4e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1157  LmbE family protein  59.27 
 
 		 302 aa  324  1e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103463  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  58.28 
 
 		 302 aa  323  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  56.61 
 
 		 305 aa  322  3e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  61.01 
 
 		 302 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  56.51 
 
 		 296 aa  318  7e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3763  LmbE family protein  59.18 
 
 		 314 aa  318  9e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1131  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  58.11 
 
 		 297 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  55.56 
 
 		 286 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  54.39 
 
 		 314 aa  300  2e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  51.86 
 
 		 307 aa  285  8e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  54.13 
 
 		 304 aa  280  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3908  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidedeacetylase  54.17 
 
 		 282 aa  275  5e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  54.11 
 
 		 284 aa  265  7e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  53.42 
 
 		 284 aa  257  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1146  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  54 
 
 		 297 aa  249  6e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0802505  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  50.7 
 
 		 268 aa  248  8e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  48.83 
 
 		 283 aa  243  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4034  LmbE-like protein  50.68 
 
 		 308 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4109  LmbE family protein  50.68 
 
 		 308 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4264  LmbE family protein  50.17 
 
 		 308 aa  238  8e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  48.86 
 
 		 361 aa  219  5e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6362  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  45.45 
 
 		 355 aa  215  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.797199  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11195  N-acetyl-1-D-myo-inosityl-2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside deacetylase mshB  48.32 
 
 		 303 aa  211  9e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  40.14 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3329  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  45.42 
 
 		 283 aa  189  7e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  41.58 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  43.05 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  41.38 
 
 		 303 aa  172  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  39.6 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  40.8 
 
 		 312 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  41.75 
 
 		 295 aa  168  9e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  39.6 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  41.69 
 
 		 309 aa  165  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  40.26 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  41.98 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  37.8 
 
 		 276 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  39.86 
 
 		 287 aa  162  6e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  39.59 
 
 		 291 aa  162  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  38.64 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1101  LmbE family protein  43.58 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0911817  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  39.53 
 
 		 287 aa  158  9e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  39.04 
 
 		 359 aa  158  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4309  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  44.96 
 
 		 293 aa  156  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.414925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1609  LmbE family protein  39.1 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0942  mycothiol conjugate amidase Mca  41.44 
 
 		 295 aa  155  6e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  39.66 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  37.93 
 
 		 299 aa  155  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  39.52 
 
 		 289 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  41.72 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0096  mycothiol conjugate amidase Mca  38.46 
 
 		 292 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  36.79 
 
 		 290 aa  153  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  37.5 
 
 		 288 aa  152  8e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  37.88 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  37.88 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  37.88 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  37.5 
 
 		 298 aa  149  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  37.37 
 
 		 291 aa  149  6e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  37.87 
 
 		 328 aa  148  8e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  38.1 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  34.49 
 
 		 277 aa  146  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  37.67 
 
 		 290 aa  145  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2633  mycothiol conjugate amidase Mca  38.64 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342297  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  35.33 
 
 		 300 aa  142  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  34.01 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  36.93 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1241  mycothiol conjugate amidase Mca  37.16 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000367029 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05100  uncharacterized LmbE-like protein  36.31 
 
 		 330 aa  133  3.9999999999999996e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34779  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1717  LmbE family protein  35.56 
 
 		 265 aa  132  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264749  normal  0.141737 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  37.97 
 
 		 306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  35.96 
 
 		 484 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1169  LmbE family protein  36.45 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.805763  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  36.29 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  34.71 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26080  uncharacterized LmbE-like protein  35 
 
 		 369 aa  118  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  33.85 
 
 		 463 aa  118  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  31.16 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  30.61 
 
 		 271 aa  112  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0794  LmbE family protein  32.59 
 
 		 331 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7629  conserved hypothetical protein LmbE  34.56 
 
 		 263 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  34.07 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2744  LmbE family protein  33.33 
 
 		 253 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11830  uncharacterized LmbE-like protein  38.04 
 
 		 268 aa  102  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  33.33 
 
 		 274 aa  102  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  37.13 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0963  LmbE family protein  38.76 
 
 		 408 aa  97.1  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.871469  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  30.6 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4220  conserved hypothetical protein LmbE  34.43 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270991  hitchhiker  0.000751351 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0008  LmbE family protein  29.52 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00173009  normal  0.123538 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  31.72 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25150  uncharacterized LmbE-like protein  32.08 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1564  LmbE family protein  31.85 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  28.02 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  29.26 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  30.4 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2066  LmbE family protein  35.42 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.788335  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  31.71 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>