201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3561 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  100 
 
 		 276 aa  555  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  71.22 
 
 		 271 aa  354  7.999999999999999e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  55.88 
 
 		 277 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  41.84 
 
 		 292 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  38.91 
 
 		 288 aa  176  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  43.8 
 
 		 286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  40.7 
 
 		 308 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  37.67 
 
 		 323 aa  159  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1717  LmbE family protein  40.5 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264749  normal  0.141737 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  39.12 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  37.8 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  39.36 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  40.74 
 
 		 302 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3763  LmbE family protein  38.3 
 
 		 314 aa  155  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1131  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  37.88 
 
 		 297 aa  152  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  39.44 
 
 		 283 aa  152  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  40.57 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3908  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidedeacetylase  39.1 
 
 		 282 aa  143  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  38.06 
 
 		 291 aa  142  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4034  LmbE-like protein  40.24 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4109  LmbE family protein  40.24 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  37.34 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194637 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  36.61 
 
 		 272 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4264  LmbE family protein  41.74 
 
 		 308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1157  LmbE family protein  40.39 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103463  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  35.96 
 
 		 291 aa  135  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  36.64 
 
 		 290 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  36.64 
 
 		 290 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  36.64 
 
 		 290 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  37.88 
 
 		 287 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  33.68 
 
 		 309 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  35.96 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  36.95 
 
 		 303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2633  mycothiol conjugate amidase Mca  33.45 
 
 		 293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342297  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  38.14 
 
 		 312 aa  132  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  36.1 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  35.29 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  35.39 
 
 		 361 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  34.68 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  36.95 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  35.4 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  34.51 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  34.83 
 
 		 303 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  39.22 
 
 		 284 aa  129  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  34.14 
 
 		 304 aa  129  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1146  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  36.18 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0802505  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0096  mycothiol conjugate amidase Mca  33.66 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  37.14 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0942  mycothiol conjugate amidase Mca  35.05 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  34.24 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  34.58 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  32.76 
 
 		 307 aa  127  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  34.35 
 
 		 300 aa  126  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  38.74 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  35.12 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  36.39 
 
 		 287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05100  uncharacterized LmbE-like protein  34.82 
 
 		 330 aa  126  5e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34779  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  34.46 
 
 		 293 aa  125  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  33.1 
 
 		 311 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  37.55 
 
 		 284 aa  123  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  34.93 
 
 		 309 aa  122  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  35.57 
 
 		 295 aa  122  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1241  mycothiol conjugate amidase Mca  34.58 
 
 		 301 aa  122  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000367029 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  34.24 
 
 		 295 aa  122  8e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  32.88 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  34.24 
 
 		 314 aa  120  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  33.68 
 
 		 328 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  32.56 
 
 		 359 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1169  LmbE family protein  33.79 
 
 		 301 aa  116  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.805763  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6362  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  34.7 
 
 		 355 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.797199  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3329  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  33.11 
 
 		 283 aa  116  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1609  LmbE family protein  37.24 
 
 		 297 aa  115  6e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  33.56 
 
 		 288 aa  115  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  32.62 
 
 		 274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1101  LmbE family protein  33.11 
 
 		 313 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0911817  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  34.34 
 
 		 298 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  32.75 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25150  uncharacterized LmbE-like protein  37.34 
 
 		 276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  31.27 
 
 		 271 aa  109  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0963  LmbE family protein  39.38 
 
 		 408 aa  105  7e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.871469  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26080  uncharacterized LmbE-like protein  34.89 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  39.07 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7629  conserved hypothetical protein LmbE  38.84 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11830  uncharacterized LmbE-like protein  35.16 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1564  LmbE family protein  33.07 
 
 		 249 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  37.57 
 
 		 484 aa  100  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0794  LmbE family protein  33.83 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  31.97 
 
 		 463 aa  98.6  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  33.33 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2744  LmbE family protein  29.85 
 
 		 253 aa  95.1  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4309  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  39.57 
 
 		 293 aa  94.7  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.414925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4220  conserved hypothetical protein LmbE  36.73 
 
 		 273 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270991  hitchhiker  0.000751351 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  34.44 
 
 		 244 aa  91.7  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0008  LmbE family protein  36.26 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00173009  normal  0.123538 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  32.83 
 
 		 231 aa  90.1  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2066  LmbE family protein  35.29 
 
 		 260 aa  90.5  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.788335  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11195  N-acetyl-1-D-myo-inosityl-2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside deacetylase mshB  35.04 
 
 		 303 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  30.74 
 
 		 238 aa  85.9  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  30.47 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2063  LmbE family protein  32.46 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.621091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>