175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1609 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1609  LmbE family protein  100 
 
 		 297 aa  589  1e-167  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  43.06 
 
 		 293 aa  185  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  41.18 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  41.87 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  39.26 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  41.38 
 
 		 303 aa  180  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0096  mycothiol conjugate amidase Mca  41.75 
 
 		 292 aa  176  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  39.93 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  40.28 
 
 		 290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  40.28 
 
 		 290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  40.28 
 
 		 290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  39.12 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  41.81 
 
 		 295 aa  172  9e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  39.37 
 
 		 290 aa  169  7e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  39.11 
 
 		 288 aa  168  9e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  40 
 
 		 287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  39.31 
 
 		 300 aa  166  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  39.56 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  38.36 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  40.35 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  36.77 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1101  LmbE family protein  39.46 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0911817  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  39.31 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  40.07 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  38.95 
 
 		 303 aa  158  9e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  36.27 
 
 		 359 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  37.36 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  36.71 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  37.85 
 
 		 312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  37.41 
 
 		 316 aa  152  5e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  39.1 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  37.28 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  35.69 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0942  mycothiol conjugate amidase Mca  38.81 
 
 		 295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05100  uncharacterized LmbE-like protein  39.55 
 
 		 330 aa  145  6e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34779  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  36.46 
 
 		 295 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  38.04 
 
 		 286 aa  139  6e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1241  mycothiol conjugate amidase Mca  38 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000367029 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2633  mycothiol conjugate amidase Mca  37.72 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342297  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  38.37 
 
 		 302 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  37.94 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  37.7 
 
 		 292 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1157  LmbE family protein  34.8 
 
 		 302 aa  129  8.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103463  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  32.51 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1169  LmbE family protein  35.22 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.805763  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3908  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidedeacetylase  36.93 
 
 		 282 aa  123  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  33.23 
 
 		 314 aa  122  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  33.58 
 
 		 296 aa  119  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  35.17 
 
 		 308 aa  119  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  34.6 
 
 		 283 aa  119  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  31.53 
 
 		 305 aa  119  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  40.85 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  38.24 
 
 		 361 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  32.62 
 
 		 299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  37.24 
 
 		 276 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  36.43 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  40.1 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  34.49 
 
 		 268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1131  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  34.75 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  33.74 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  42.24 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  32.18 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3763  LmbE family protein  33.79 
 
 		 314 aa  106  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1146  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  35.29 
 
 		 297 aa  102  9e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0802505  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4034  LmbE-like protein  35.6 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4109  LmbE family protein  35.6 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  33.33 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4264  LmbE family protein  35.34 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  32.92 
 
 		 311 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4309  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  46.02 
 
 		 293 aa  95.9  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.414925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  35.87 
 
 		 284 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1717  LmbE family protein  33.47 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264749  normal  0.141737 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  29.68 
 
 		 260 aa  89.7  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  35.07 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11195  N-acetyl-1-D-myo-inosityl-2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside deacetylase mshB  35.71 
 
 		 303 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6362  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  30.03 
 
 		 355 aa  86.3  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.797199  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  31.47 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  37.97 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  36.71 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3329  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  34.54 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11830  uncharacterized LmbE-like protein  33.71 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  32.97 
 
 		 484 aa  76.6  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  28.26 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  29.79 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2744  LmbE family protein  30.25 
 
 		 253 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  28.63 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  31.62 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  30.35 
 
 		 463 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  33.77 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7629  conserved hypothetical protein LmbE  35.53 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  31.82 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26080  uncharacterized LmbE-like protein  32.96 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1564  LmbE family protein  34.81 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0794  LmbE family protein  31.87 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  24.47 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  27.2 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  26.83 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  30 
 
 		 229 aa  62.4  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  25.74 
 
 		 227 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  28.14 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>