172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1169 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1169  LmbE family protein  100 
 
 		 301 aa  612  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.805763  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1241  mycothiol conjugate amidase Mca  86.71 
 
 		 301 aa  514  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000367029 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  60.27 
 
 		 289 aa  359  3e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  60.2 
 
 		 295 aa  351  1e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  58.62 
 
 		 316 aa  346  2e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  58.84 
 
 		 293 aa  341  9e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0942  mycothiol conjugate amidase Mca  59.66 
 
 		 295 aa  340  2e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  61.74 
 
 		 303 aa  339  2.9999999999999998e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  58.36 
 
 		 294 aa  339  4e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  57.24 
 
 		 291 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  58.97 
 
 		 287 aa  333  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  57.73 
 
 		 293 aa  327  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  56.75 
 
 		 288 aa  326  3e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  58.45 
 
 		 295 aa  326  3e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  58.42 
 
 		 287 aa  326  3e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  55.7 
 
 		 312 aa  326  3e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  58.7 
 
 		 309 aa  325  5e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  56.51 
 
 		 299 aa  322  6e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1101  LmbE family protein  55.22 
 
 		 313 aa  320  1.9999999999999998e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0911817  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  59.18 
 
 		 290 aa  319  3e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  57.59 
 
 		 290 aa  318  7.999999999999999e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  57.59 
 
 		 290 aa  318  7.999999999999999e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  57.59 
 
 		 290 aa  318  7.999999999999999e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0096  mycothiol conjugate amidase Mca  57.14 
 
 		 292 aa  317  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2633  mycothiol conjugate amidase Mca  56.12 
 
 		 293 aa  315  9e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342297  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  55.44 
 
 		 291 aa  313  2.9999999999999996e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  59.18 
 
 		 328 aa  310  2e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  58.78 
 
 		 300 aa  305  5.0000000000000004e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  55.17 
 
 		 291 aa  305  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  55.89 
 
 		 303 aa  301  6.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05100  uncharacterized LmbE-like protein  54.81 
 
 		 330 aa  301  9e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34779  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  56.81 
 
 		 298 aa  295  5e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  53.1 
 
 		 288 aa  286  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  52.38 
 
 		 303 aa  286  4e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  56.21 
 
 		 290 aa  281  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  49.66 
 
 		 359 aa  271  7e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  36.15 
 
 		 288 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  39.34 
 
 		 323 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  37.97 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1157  LmbE family protein  38.06 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103463  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  36.48 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  37.05 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3908  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidedeacetylase  37.84 
 
 		 282 aa  142  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  38.18 
 
 		 292 aa  142  7e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1131  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  39.6 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1609  LmbE family protein  36.33 
 
 		 297 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  36.04 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  38.36 
 
 		 304 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  35.26 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  37.16 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  37.66 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  32.99 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  34.34 
 
 		 276 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  34.5 
 
 		 308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  34.81 
 
 		 271 aa  125  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  33.01 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3763  LmbE family protein  34.22 
 
 		 314 aa  123  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  33.85 
 
 		 361 aa  119  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  30.51 
 
 		 304 aa  116  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6362  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  33.75 
 
 		 355 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.797199  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  33.97 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  34.35 
 
 		 268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  41.04 
 
 		 299 aa  112  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  33.22 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194637 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  31.96 
 
 		 311 aa  106  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1146  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  34.73 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0802505  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  33.77 
 
 		 284 aa  102  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  30.79 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  32.37 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  39.87 
 
 		 260 aa  99  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  38.89 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11830  uncharacterized LmbE-like protein  39.55 
 
 		 268 aa  95.1  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1717  LmbE family protein  32.03 
 
 		 265 aa  94  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264749  normal  0.141737 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26080  uncharacterized LmbE-like protein  32.78 
 
 		 369 aa  93.6  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4034  LmbE-like protein  30.23 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4109  LmbE family protein  30.23 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4264  LmbE family protein  28.57 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  27.65 
 
 		 271 aa  90.5  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  30 
 
 		 272 aa  89.7  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  30.43 
 
 		 299 aa  88.6  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0963  LmbE family protein  33.03 
 
 		 408 aa  85.9  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.871469  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  37.91 
 
 		 272 aa  85.5  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0794  LmbE family protein  31.82 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  30.56 
 
 		 484 aa  83.6  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11195  N-acetyl-1-D-myo-inosityl-2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside deacetylase mshB  35.12 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2744  LmbE family protein  26.91 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  32.74 
 
 		 463 aa  79.7  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7629  conserved hypothetical protein LmbE  38.56 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  32.28 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4309  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  38.89 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.414925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25150  uncharacterized LmbE-like protein  28.77 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2880  LmbE-like protein  28.15 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3329  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  27.36 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1564  LmbE family protein  30.92 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  31.58 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  29.51 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2063  LmbE family protein  28.91 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.621091  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  31.91 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4220  conserved hypothetical protein LmbE  29.37 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270991  hitchhiker  0.000751351 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  29.73 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>