278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2880 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2880  LmbE-like protein  100 
 
 
245 aa  505  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  34.02 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  32 
 
 
244 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  40.34 
 
 
311 aa  101  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  31.62 
 
 
287 aa  97.8  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  31.1 
 
 
304 aa  97.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  40.23 
 
 
299 aa  97.1  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0008  LmbE family protein  30.61 
 
 
240 aa  95.9  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00173009  normal  0.123538 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  36.96 
 
 
287 aa  95.5  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  30.14 
 
 
303 aa  93.6  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  29.45 
 
 
300 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  30.14 
 
 
328 aa  92.8  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  33.8 
 
 
238 aa  92.8  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  31.1 
 
 
302 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  29.69 
 
 
218 aa  88.2  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  27.53 
 
 
288 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  30.48 
 
 
237 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  29.72 
 
 
289 aa  86.7  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  35.48 
 
 
298 aa  86.3  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  28.33 
 
 
312 aa  85.9  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  34.44 
 
 
293 aa  85.5  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  33.15 
 
 
293 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  29.41 
 
 
229 aa  84  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  28.97 
 
 
290 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  28.97 
 
 
290 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  28.97 
 
 
290 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  29.97 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  34.27 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  32.02 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  28.22 
 
 
288 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  29.43 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  30.77 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  29.77 
 
 
304 aa  82.8  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  34.62 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0942  mycothiol conjugate amidase Mca  29.73 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  30.32 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  24.66 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  31.72 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  34.24 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  32.26 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  27.91 
 
 
302 aa  79  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  33.87 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  29.82 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  32.58 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  31.15 
 
 
309 aa  77  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  27.65 
 
 
299 aa  77  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1241  mycothiol conjugate amidase Mca  28.67 
 
 
301 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000367029 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  27.8 
 
 
291 aa  77  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4036  hypothetical protein  28.78 
 
 
276 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  28.64 
 
 
227 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  27.73 
 
 
259 aa  75.5  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  30.7 
 
 
260 aa  75.5  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2633  mycothiol conjugate amidase Mca  28.38 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342297  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  29.37 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  26.64 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  28.92 
 
 
243 aa  73.6  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2672  LmbE family protein  37.4 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  32.86 
 
 
239 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  30.66 
 
 
244 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  34.59 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1169  LmbE family protein  34.2 
 
 
301 aa  72.4  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.805763  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  29.67 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  35.42 
 
 
271 aa  72.4  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  28.77 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  28.77 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  36.25 
 
 
247 aa  72  0.000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  28.77 
 
 
227 aa  72  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  27.51 
 
 
276 aa  72  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1101  LmbE family protein  27.67 
 
 
313 aa  72  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0911817  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  31.34 
 
 
239 aa  71.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  26.83 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  27.54 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  30.7 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  26.47 
 
 
193 aa  71.2  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  35.2 
 
 
226 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  33.53 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0630  LmbE family protein  27.31 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  28.57 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  27.46 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1146  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  30 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0802505  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3433  LmbE-like protein  32.46 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  30.36 
 
 
299 aa  69.7  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3329  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  27.87 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  34.12 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  32.18 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2611  LmbE family protein  32.99 
 
 
839 aa  68.6  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  30.58 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  29.93 
 
 
217 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05100  uncharacterized LmbE-like protein  27.48 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34779  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1157  LmbE family protein  29.14 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103463  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  28.57 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  28.1 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10328  hypothetical protein  38.02 
 
 
223 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  28.57 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  26.39 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  34.27 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  29.85 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  28.57 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  36.18 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  30.28 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.566146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>