167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4036 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4036  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  568  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0630  LmbE family protein  58.67 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  29.15 
 
 		 236 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  28.11 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2080  LmbE family protein  28.38 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0263313  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  29.21 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  25.7 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  40.74 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  33.33 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  31.07 
 
 		 227 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  29.68 
 
 		 227 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  27.31 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  36.36 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1416  LmbE family protein  30.12 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  26.19 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  34.06 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2880  LmbE-like protein  28.78 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  27.09 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  35.45 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  30.24 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  29.76 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  26.7 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  31.94 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  35.51 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  27.78 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  31.48 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2672  LmbE family protein  27.87 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  23.93 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  24.07 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  26.58 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4210  LmbE family protein  33.11 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  33.94 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  25.22 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  28.92 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  27.96 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  29.6 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0020  LmbE family protein  36.11 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  25.75 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  27.4 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  27.87 
 
 		 293 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  27.89 
 
 		 304 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  22.94 
 
 		 227 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  24.32 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  24.32 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  31.58 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  32.41 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1823  LmbE family protein  25 
 
 		 258 aa  53.1  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.318027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  24.32 
 
 		 227 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  24.5 
 
 		 264 aa  53.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  26.87 
 
 		 221 aa  53.1  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  26.87 
 
 		 221 aa  53.1  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  25.12 
 
 		 217 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3179  LmbE family protein  29.93 
 
 		 220 aa  53.1  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  22.51 
 
 		 229 aa  52.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  26.09 
 
 		 244 aa  52.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  24.53 
 
 		 193 aa  52.8  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  31.03 
 
 		 242 aa  52.4  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1423  LmbE family protein  27.64 
 
 		 234 aa  52.4  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  28.22 
 
 		 308 aa  52.4  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  27.82 
 
 		 302 aa  52.4  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  26.96 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  28.99 
 
 		 220 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  26.96 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3268  hypothetical protein  29.71 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000289968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  26.96 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3241  hypothetical protein  29.71 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000243018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3183  hypothetical protein  28.99 
 
 		 220 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000002506  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  26.96 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3524  hypothetical protein  29.71 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123177  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  25.94 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  24.49 
 
 		 303 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  25.94 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  25.94 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  30.56 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  28.57 
 
 		 242 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  26.96 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  28.99 
 
 		 220 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  26.96 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3484  hypothetical protein  29.71 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3329  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  25.1 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  26.37 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10328  hypothetical protein  27.78 
 
 		 223 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  24.04 
 
 		 218 aa  51.2  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  22.58 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  28.47 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  26.47 
 
 		 234 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  28.47 
 
 		 220 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  28.43 
 
 		 238 aa  50.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4220  conserved hypothetical protein LmbE  26.01 
 
 		 273 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270991  hitchhiker  0.000751351 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  25.73 
 
 		 234 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0008  LmbE family protein  25.75 
 
 		 240 aa  49.3  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00173009  normal  0.123538 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  27.89 
 
 		 272 aa  49.3  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  25.89 
 
 		 236 aa  49.3  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  25.86 
 
 		 292 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  25.73 
 
 		 234 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  24.66 
 
 		 260 aa  48.9  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  25.24 
 
 		 258 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  24 
 
 		 227 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  25.53 
 
 		 283 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  29.41 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>