190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_10120 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  100 
 
 		 245 aa  487  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0084  hypothetical protein  68.88 
 
 		 243 aa  320  9.999999999999999e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4038  conserved hypothetical protein LmbE  63.79 
 
 		 243 aa  278  7e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  58.2 
 
 		 242 aa  272  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1963  LmbE family protein  57.98 
 
 		 245 aa  264  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0119223  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2706  LmbE family protein  58.82 
 
 		 256 aa  261  8.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2604  LmbE family protein  58.02 
 
 		 241 aa  258  8e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849278 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4797  LmbE family protein  57.14 
 
 		 239 aa  249  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.861098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2878  LmbE family protein  56.02 
 
 		 246 aa  247  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3452  LmbE family protein  58.53 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14320  uncharacterized LmbE-like protein  50.23 
 
 		 240 aa  172  2.9999999999999996e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00973186  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17590  uncharacterized LmbE-like protein  47.44 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134633  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  42.22 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  40.17 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  41.94 
 
 		 239 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2405  LmbE family protein  44.22 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  35.62 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  38.17 
 
 		 423 aa  135  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  41.75 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  40.98 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  38.79 
 
 		 244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  41.74 
 
 		 239 aa  128  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  36.84 
 
 		 234 aa  123  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  36.07 
 
 		 241 aa  121  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  33.04 
 
 		 231 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  36.48 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  34.83 
 
 		 237 aa  109  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  34.16 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  33 
 
 		 237 aa  108  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  32.72 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3918  LmbE family protein  42.59 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  30.21 
 
 		 259 aa  105  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  33.33 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  32.91 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  30.95 
 
 		 311 aa  89  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  29.37 
 
 		 309 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14910  uncharacterized LmbE-like protein  35.75 
 
 		 259 aa  86.3  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  29.91 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  36.17 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  30.53 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  30.2 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  29.84 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  31.25 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0680  LmbE family protein  34.74 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0589  LmbE family protein  33.2 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.154611  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  29.03 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2672  LmbE family protein  34 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  28.36 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  27.08 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  29.33 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  29.66 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  31.52 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  31.25 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  27.67 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  23.79 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  29.29 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  29.29 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  29.29 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  27.87 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  29.69 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  28.28 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  26.11 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  28.95 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  26.84 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  31.37 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  32.85 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  25.85 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  28.78 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  29.8 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2080  LmbE family protein  29.08 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0263313  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4036  hypothetical protein  29.6 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  25 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  25.85 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  25.85 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  25.85 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  25.85 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  25.85 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  28.67 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  34.81 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  26 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04810  uncharacterized LmbE-like protein  30.36 
 
 		 923 aa  55.8  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.970372  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  28.65 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  25.85 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  25.85 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  30.04 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0630  LmbE family protein  30.4 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  25.85 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  31.61 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  26.76 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  25.85 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  23.47 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  29.1 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  32.12 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1217  LmbE family protein  30.56 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  25.24 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1416  LmbE family protein  33.09 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  26.06 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  26.06 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  28.83 
 
 		 245 aa  52.4  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  26.32 
 
 		 249 aa  52.4  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>