275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3918 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3918  LmbE family protein  100 
 
 		 242 aa  506  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  44.64 
 
 		 237 aa  209  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  47.18 
 
 		 244 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  46.03 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  43.93 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  39.91 
 
 		 243 aa  159  5e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  40.77 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  44.26 
 
 		 241 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  36.33 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  42.49 
 
 		 237 aa  151  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  42.49 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  38.84 
 
 		 240 aa  149  3e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  41.45 
 
 		 237 aa  149  4e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  38.2 
 
 		 239 aa  148  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  37.18 
 
 		 239 aa  143  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  38.3 
 
 		 227 aa  133  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  36.8 
 
 		 244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  38.3 
 
 		 227 aa  128  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  32.39 
 
 		 258 aa  128  8.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  34.18 
 
 		 259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2706  LmbE family protein  34.3 
 
 		 256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  42.59 
 
 		 245 aa  119  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  35.16 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2878  LmbE family protein  36.6 
 
 		 246 aa  115  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14320  uncharacterized LmbE-like protein  37.86 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00973186  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1963  LmbE family protein  35.9 
 
 		 245 aa  112  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0119223  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0084  hypothetical protein  33.62 
 
 		 243 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  31.74 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14910  uncharacterized LmbE-like protein  37.08 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4797  LmbE family protein  34.91 
 
 		 239 aa  95.1  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.861098 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  32 
 
 		 271 aa  94.4  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2604  LmbE family protein  32.48 
 
 		 241 aa  93.2  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4038  conserved hypothetical protein LmbE  33.33 
 
 		 243 aa  88.6  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  31.9 
 
 		 237 aa  86.3  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  27.71 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  27.64 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3452  LmbE family protein  34.62 
 
 		 240 aa  81.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  33.81 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0680  LmbE family protein  32.77 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2405  LmbE family protein  36.07 
 
 		 222 aa  78.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17590  uncharacterized LmbE-like protein  30.63 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134633  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  30.05 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  33.59 
 
 		 423 aa  75.5  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1823  LmbE family protein  35.34 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.318027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  28.57 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  31.03 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  28.18 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  30.81 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  34.04 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2080  LmbE family protein  28.63 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0263313  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  32.68 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  36.03 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  28.99 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  31.55 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  34.59 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  26.36 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  30.9 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  30.14 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  30.25 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  36.15 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  33.33 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  29.1 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  30.27 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  30.81 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  30.27 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  32.53 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  30.27 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  30.27 
 
 		 288 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2672  LmbE family protein  31 
 
 		 246 aa  67  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  29.26 
 
 		 295 aa  67  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  29.12 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  28.35 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  35.96 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  33.33 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  33.8 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  29.3 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1217  LmbE family protein  31.13 
 
 		 298 aa  65.1  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  27.98 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  28.44 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  27.36 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  27.32 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  24.68 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  27.96 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  28.65 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0589  LmbE family protein  38.41 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.154611  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  27.32 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  28.21 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  28.21 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  28.21 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  28.21 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  28.21 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  28.21 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  25.38 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  27.18 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  29.19 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  24.79 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  29.82 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  35.94 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  30.22 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  29.34 
 
 		 287 aa  62  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>