211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0826 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  100 
 
 		 298 aa  604  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  82.01 
 
 		 300 aa  473  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  68.49 
 
 		 293 aa  393  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  66.32 
 
 		 287 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  64.07 
 
 		 309 aa  382  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  65.4 
 
 		 295 aa  383  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  67.13 
 
 		 287 aa  376  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  64.83 
 
 		 293 aa  377  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  70.21 
 
 		 303 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  67.01 
 
 		 294 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  64.07 
 
 		 291 aa  361  9e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  59.6 
 
 		 312 aa  347  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  64.71 
 
 		 328 aa  343  2e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  64.38 
 
 		 303 aa  343  2e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  65.53 
 
 		 290 aa  342  4e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0942  mycothiol conjugate amidase Mca  62.2 
 
 		 295 aa  335  5e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  58.62 
 
 		 288 aa  335  5.999999999999999e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  60.21 
 
 		 290 aa  332  4e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  60.21 
 
 		 290 aa  332  4e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  60.21 
 
 		 290 aa  332  4e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  60.82 
 
 		 316 aa  332  4e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0096  mycothiol conjugate amidase Mca  60.21 
 
 		 292 aa  332  5e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  57.09 
 
 		 299 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  57.93 
 
 		 291 aa  322  3e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  58.97 
 
 		 295 aa  322  6e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  56.76 
 
 		 289 aa  314  9e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  56.4 
 
 		 288 aa  312  4.999999999999999e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1101  LmbE family protein  57.14 
 
 		 313 aa  312  4.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0911817  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1241  mycothiol conjugate amidase Mca  57.24 
 
 		 301 aa  311  1e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000367029 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  59.04 
 
 		 291 aa  304  1.0000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2633  mycothiol conjugate amidase Mca  55.33 
 
 		 293 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342297  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  54.7 
 
 		 359 aa  300  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  59.31 
 
 		 290 aa  300  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  54.7 
 
 		 303 aa  300  2e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1169  LmbE family protein  56.95 
 
 		 301 aa  292  4e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.805763  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05100  uncharacterized LmbE-like protein  47.15 
 
 		 330 aa  243  1.9999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34779  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1609  LmbE family protein  40.69 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  36.82 
 
 		 288 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  38.49 
 
 		 294 aa  152  8.999999999999999e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  37.87 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1157  LmbE family protein  35.71 
 
 		 302 aa  142  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103463  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  38.6 
 
 		 309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  37.45 
 
 		 286 aa  139  7e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  38.49 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  36.63 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  35.26 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  34.97 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  33.99 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3908  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidedeacetylase  36.36 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  33.99 
 
 		 314 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  34.44 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  35.35 
 
 		 276 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1131  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  36.4 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  33.56 
 
 		 299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  33.33 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  34.83 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  33.1 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  35.43 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  34.69 
 
 		 361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1146  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  35.81 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0802505  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3763  LmbE family protein  32.33 
 
 		 314 aa  106  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  35.15 
 
 		 284 aa  105  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  33.57 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194637 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  33.2 
 
 		 274 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  32.33 
 
 		 283 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  34.95 
 
 		 284 aa  102  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  42.24 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  31.19 
 
 		 268 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6362  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  31.76 
 
 		 355 aa  99  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.797199  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4264  LmbE family protein  31.56 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4034  LmbE-like protein  31.56 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4109  LmbE family protein  31.56 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1717  LmbE family protein  31.52 
 
 		 265 aa  95.1  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264749  normal  0.141737 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  39.62 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  36.81 
 
 		 306 aa  93.6  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  38.41 
 
 		 272 aa  90.1  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  36.18 
 
 		 272 aa  89.4  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  28.23 
 
 		 271 aa  87  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  27.4 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11195  N-acetyl-1-D-myo-inosityl-2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside deacetylase mshB  40.97 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  32.73 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11830  uncharacterized LmbE-like protein  34.1 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  35 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7629  conserved hypothetical protein LmbE  39.74 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  29.26 
 
 		 484 aa  79.7  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0963  LmbE family protein  33.49 
 
 		 408 aa  79.3  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.871469  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26080  uncharacterized LmbE-like protein  33.33 
 
 		 369 aa  79.3  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  32.77 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2880  LmbE-like protein  36.46 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  32.2 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2744  LmbE family protein  27.78 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1564  LmbE family protein  32.45 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  31.03 
 
 		 463 aa  73.6  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4309  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  38.55 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.414925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  30.85 
 
 		 237 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0794  LmbE family protein  31.67 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3329  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  28.66 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0008  LmbE family protein  32.92 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00173009  normal  0.123538 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  29.74 
 
 		 239 aa  68.9  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4220  conserved hypothetical protein LmbE  35.29 
 
 		 273 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270991  hitchhiker  0.000751351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>