194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4417 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  100 
 
 		 359 aa  726    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  60.27 
 
 		 293 aa  350  3e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  61.86 
 
 		 303 aa  345  8e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  58.95 
 
 		 287 aa  330  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  57.24 
 
 		 295 aa  326  3e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  60.21 
 
 		 303 aa  325  8.000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  59.44 
 
 		 287 aa  321  9.999999999999999e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  57.64 
 
 		 309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  55.9 
 
 		 291 aa  320  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  56.31 
 
 		 293 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  57.61 
 
 		 328 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  58.13 
 
 		 289 aa  319  3.9999999999999996e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  58.48 
 
 		 295 aa  318  1e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  56.85 
 
 		 316 aa  316  4e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  55.93 
 
 		 294 aa  311  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1101  LmbE family protein  57.68 
 
 		 313 aa  311  2e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0911817  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  57.09 
 
 		 291 aa  310  2e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  53.5 
 
 		 288 aa  310  2.9999999999999997e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  54.01 
 
 		 299 aa  309  5e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  55.9 
 
 		 290 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  55.9 
 
 		 290 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  55.9 
 
 		 290 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  55.82 
 
 		 312 aa  306  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0942  mycothiol conjugate amidase Mca  58.19 
 
 		 295 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  53.92 
 
 		 291 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  56.36 
 
 		 290 aa  298  1e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0096  mycothiol conjugate amidase Mca  55.36 
 
 		 292 aa  294  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  52.41 
 
 		 288 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  53.26 
 
 		 290 aa  288  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  54.7 
 
 		 298 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  50.52 
 
 		 303 aa  280  4e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  52.58 
 
 		 300 aa  276  5e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2633  mycothiol conjugate amidase Mca  52.41 
 
 		 293 aa  271  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342297  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1241  mycothiol conjugate amidase Mca  50.34 
 
 		 301 aa  261  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000367029 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1169  LmbE family protein  49.33 
 
 		 301 aa  241  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.805763  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05100  uncharacterized LmbE-like protein  46.62 
 
 		 330 aa  230  2e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34779  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  35.35 
 
 		 288 aa  164  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1609  LmbE family protein  36.27 
 
 		 297 aa  157  3e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  38.26 
 
 		 307 aa  156  6e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  39.04 
 
 		 294 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  37 
 
 		 305 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3908  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidedeacetylase  39.66 
 
 		 282 aa  149  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  35.03 
 
 		 323 aa  142  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1157  LmbE family protein  35.28 
 
 		 302 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103463  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  34.19 
 
 		 302 aa  139  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  34.53 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  33.75 
 
 		 309 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  33.56 
 
 		 286 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  34.24 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  34.24 
 
 		 271 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  35.28 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  43.6 
 
 		 299 aa  126  7e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  34.92 
 
 		 361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6362  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  32.4 
 
 		 355 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.797199  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3763  LmbE family protein  33.12 
 
 		 314 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  32.8 
 
 		 308 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  32.56 
 
 		 276 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1131  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  34.91 
 
 		 297 aa  116  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  35.48 
 
 		 304 aa  116  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  35.37 
 
 		 268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  33.44 
 
 		 284 aa  113  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  33.21 
 
 		 296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  31.39 
 
 		 277 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  30.19 
 
 		 283 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  31.56 
 
 		 304 aa  105  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4264  LmbE family protein  33.13 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  33.11 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4034  LmbE-like protein  33.13 
 
 		 308 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4109  LmbE family protein  33.13 
 
 		 308 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1146  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  33.33 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0802505  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  40.44 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  32.77 
 
 		 274 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11195  N-acetyl-1-D-myo-inosityl-2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside deacetylase mshB  41.34 
 
 		 303 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  39.51 
 
 		 306 aa  95.9  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1717  LmbE family protein  31.32 
 
 		 265 aa  94  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264749  normal  0.141737 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  31.08 
 
 		 299 aa  93.6  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7629  conserved hypothetical protein LmbE  31.11 
 
 		 263 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  37.5 
 
 		 272 aa  87.4  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  35.85 
 
 		 260 aa  87  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26080  uncharacterized LmbE-like protein  33.71 
 
 		 369 aa  86.7  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  26.72 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2744  LmbE family protein  27.68 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0963  LmbE family protein  31.7 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.871469  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11830  uncharacterized LmbE-like protein  33.91 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  35.87 
 
 		 463 aa  77.8  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3329  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  26.8 
 
 		 283 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4309  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  39.64 
 
 		 293 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.414925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  25.74 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3334  hypothetical protein  32.95 
 
 		 930 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  33.73 
 
 		 484 aa  69.7  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0794  LmbE family protein  28.33 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  36.11 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2880  LmbE-like protein  34.24 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  26.72 
 
 		 244 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  27.38 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  29.59 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4220  conserved hypothetical protein LmbE  36.6 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270991  hitchhiker  0.000751351 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1378  LmbE family protein  27.81 
 
 		 811 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.455016 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2672  LmbE family protein  30.28 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25150  uncharacterized LmbE-like protein  30.22 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>