182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1886 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  100 
 
 
328 aa  657    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  67.72 
 
 
309 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  64.6 
 
 
293 aa  386  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  65.64 
 
 
293 aa  381  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  70.38 
 
 
303 aa  378  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  66.43 
 
 
294 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  63.29 
 
 
287 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  66.55 
 
 
290 aa  365  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0096  mycothiol conjugate amidase Mca  63.92 
 
 
292 aa  365  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  63.99 
 
 
291 aa  365  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  62.94 
 
 
295 aa  364  1e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  65.6 
 
 
289 aa  363  3e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  62.07 
 
 
291 aa  360  2e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  63.67 
 
 
287 aa  359  3e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  66.2 
 
 
303 aa  358  8e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  60.68 
 
 
312 aa  357  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  62.81 
 
 
299 aa  356  2.9999999999999997e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  62.68 
 
 
290 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  62.68 
 
 
290 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  62.68 
 
 
290 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  61.27 
 
 
288 aa  354  1e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  63.19 
 
 
295 aa  348  6e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  61.97 
 
 
288 aa  342  7e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  60.75 
 
 
316 aa  342  7e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  64.79 
 
 
290 aa  341  8e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  64.71 
 
 
298 aa  340  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  63.89 
 
 
300 aa  338  5e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0942  mycothiol conjugate amidase Mca  63.07 
 
 
295 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1101  LmbE family protein  59.46 
 
 
313 aa  336  3.9999999999999995e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0911817  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  61.64 
 
 
291 aa  333  3e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  57.61 
 
 
359 aa  333  3e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2633  mycothiol conjugate amidase Mca  57.84 
 
 
293 aa  309  5e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342297  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1241  mycothiol conjugate amidase Mca  56.7 
 
 
301 aa  304  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000367029 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  53.82 
 
 
303 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1169  LmbE family protein  59.18 
 
 
301 aa  299  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.805763  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05100  uncharacterized LmbE-like protein  49.06 
 
 
330 aa  259  6e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34779  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  38.68 
 
 
288 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1609  LmbE family protein  41.11 
 
 
297 aa  165  8e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  41.31 
 
 
302 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  38.23 
 
 
323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  39.73 
 
 
305 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  38.16 
 
 
294 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  38.78 
 
 
286 aa  144  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  35.89 
 
 
309 aa  143  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  38.87 
 
 
307 aa  142  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1157  LmbE family protein  36.27 
 
 
302 aa  139  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103463  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  35.33 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  38.93 
 
 
302 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  33.95 
 
 
304 aa  129  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  36.95 
 
 
292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3908  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidedeacetylase  36.59 
 
 
282 aa  126  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  35.79 
 
 
299 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  36.27 
 
 
308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  35.07 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  34.83 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  33.68 
 
 
276 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1131  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  35.22 
 
 
297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  34.93 
 
 
283 aa  115  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  34.38 
 
 
268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3763  LmbE family protein  35.59 
 
 
314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  34.98 
 
 
284 aa  110  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  34.87 
 
 
361 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1146  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  35.86 
 
 
297 aa  106  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0802505  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  36.84 
 
 
296 aa  106  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.194637 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  35.36 
 
 
284 aa  106  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  32.99 
 
 
277 aa  105  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  34.1 
 
 
304 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6362  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  34.39 
 
 
355 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.797199  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  33.22 
 
 
260 aa  95.1  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  38.82 
 
 
306 aa  94.7  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4264  LmbE family protein  30.92 
 
 
308 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  33.33 
 
 
274 aa  91.3  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  31.08 
 
 
299 aa  90.5  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1717  LmbE family protein  30.62 
 
 
265 aa  90.1  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264749  normal  0.141737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7629  conserved hypothetical protein LmbE  32.82 
 
 
263 aa  90.1  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4034  LmbE-like protein  30.59 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4109  LmbE family protein  30.59 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26080  uncharacterized LmbE-like protein  35.91 
 
 
369 aa  87.4  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2744  LmbE family protein  30.29 
 
 
253 aa  85.9  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3329  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  31.7 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  37.43 
 
 
484 aa  84.3  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11195  N-acetyl-1-D-myo-inosityl-2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside deacetylase mshB  39.89 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11830  uncharacterized LmbE-like protein  35.59 
 
 
268 aa  83.2  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  29.54 
 
 
271 aa  83.2  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  30.48 
 
 
283 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  36.84 
 
 
272 aa  82.8  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  38.61 
 
 
272 aa  82  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2880  LmbE-like protein  30.5 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  36.09 
 
 
463 aa  79.7  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  30.04 
 
 
238 aa  75.9  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0794  LmbE family protein  29.73 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1564  LmbE family protein  35.1 
 
 
249 aa  72.4  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4309  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  40.61 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.414925  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  31.77 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4220  conserved hypothetical protein LmbE  31.62 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270991  hitchhiker  0.000751351 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0963  LmbE family protein  32.68 
 
 
408 aa  66.6  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.871469  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3334  hypothetical protein  27.71 
 
 
930 aa  66.2  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896794  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  32.03 
 
 
218 aa  64.7  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2487  LmbE family protein  34.81 
 
 
797 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25150  uncharacterized LmbE-like protein  34.87 
 
 
276 aa  59.7  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>