53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2487 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2487  LmbE family protein  100 
 
 
797 aa  1618    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2590  hypothetical protein  40.91 
 
 
768 aa  531  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2611  LmbE family protein  29.69 
 
 
839 aa  265  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2865  hypothetical protein  26.93 
 
 
833 aa  259  1e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349259 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5787  LmbE family protein  26.44 
 
 
826 aa  227  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462523  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0742  LmbE family protein  36.97 
 
 
882 aa  158  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1378  LmbE family protein  32.35 
 
 
811 aa  156  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.455016 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5481  LmbE family protein  30.53 
 
 
825 aa  147  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.048486 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12028  hypothetical protein  34.89 
 
 
830 aa  140  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3334  hypothetical protein  34.01 
 
 
930 aa  137  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896794  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2961  LmbE family protein  31.2 
 
 
843 aa  136  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0537053  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04810  uncharacterized LmbE-like protein  33.88 
 
 
923 aa  94.7  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.970372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5445  LmbE family protein  32.38 
 
 
1071 aa  85.5  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  36.41 
 
 
309 aa  62.4  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  34.29 
 
 
328 aa  59.7  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  32.78 
 
 
309 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  32.96 
 
 
298 aa  59.3  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  33.14 
 
 
288 aa  58.2  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  33.33 
 
 
300 aa  57.4  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  33.33 
 
 
359 aa  57.4  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  33.7 
 
 
316 aa  57.4  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  30.65 
 
 
288 aa  56.2  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  30.11 
 
 
312 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  33.33 
 
 
291 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  32.18 
 
 
293 aa  54.7  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  32.77 
 
 
303 aa  54.3  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  32.22 
 
 
290 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  32.22 
 
 
290 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  33.97 
 
 
272 aa  53.5  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1963  LmbE family protein  32.32 
 
 
245 aa  53.9  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0119223  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  32.22 
 
 
290 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  33.33 
 
 
288 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  35.52 
 
 
303 aa  52.8  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  35.81 
 
 
231 aa  52.4  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  32.78 
 
 
290 aa  52.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  31.11 
 
 
294 aa  52.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  29.12 
 
 
303 aa  52  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  31.18 
 
 
293 aa  52  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  32.02 
 
 
291 aa  51.2  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  31.49 
 
 
289 aa  49.7  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  32.49 
 
 
311 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  30.39 
 
 
290 aa  49.3  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  31.25 
 
 
299 aa  48.9  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1101  LmbE family protein  34.03 
 
 
313 aa  47.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0911817  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  28.96 
 
 
304 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2878  LmbE family protein  30.59 
 
 
246 aa  46.2  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147925  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  30.98 
 
 
302 aa  45.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  31.25 
 
 
295 aa  45.4  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  30.11 
 
 
245 aa  45.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7629  conserved hypothetical protein LmbE  36.42 
 
 
263 aa  45.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  31.37 
 
 
270 aa  44.7  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  31.32 
 
 
291 aa  44.7  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  30.77 
 
 
323 aa  43.9  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>