38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12028 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5787  LmbE family protein  43.7 
 
 		 826 aa  682    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462523  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12028  hypothetical protein  100 
 
 		 830 aa  1708    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0742  LmbE family protein  44.96 
 
 		 882 aa  687    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5481  LmbE family protein  42.48 
 
 		 825 aa  662    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.048486 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1378  LmbE family protein  44.39 
 
 		 811 aa  684    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.455016 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2611  LmbE family protein  41.61 
 
 		 839 aa  676    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2961  LmbE family protein  54.91 
 
 		 843 aa  934    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0537053  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2865  hypothetical protein  44.02 
 
 		 833 aa  700    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349259 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3334  hypothetical protein  30.43 
 
 		 930 aa  351  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2487  LmbE family protein  26.9 
 
 		 797 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2590  hypothetical protein  25.45 
 
 		 768 aa  213  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04810  uncharacterized LmbE-like protein  35.15 
 
 		 923 aa  91.7  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.970372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5445  LmbE family protein  30.26 
 
 		 1071 aa  87  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  30.17 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  29.67 
 
 		 290 aa  59.3  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  27.23 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  27.17 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  28.73 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  28.02 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  24.64 
 
 		 303 aa  56.6  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  27.07 
 
 		 309 aa  53.9  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  26.26 
 
 		 293 aa  52.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  27.32 
 
 		 300 aa  51.2  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  22.75 
 
 		 312 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  29.24 
 
 		 288 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  26.4 
 
 		 303 aa  49.3  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  27.22 
 
 		 299 aa  48.9  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  27.66 
 
 		 304 aa  48.5  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  27.07 
 
 		 311 aa  48.5  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  29.93 
 
 		 231 aa  47.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  29.38 
 
 		 249 aa  47.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1241  mycothiol conjugate amidase Mca  24.74 
 
 		 301 aa  46.6  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000367029 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  26.19 
 
 		 1276 aa  46.6  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  26.85 
 
 		 238 aa  47  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  22.76 
 
 		 298 aa  46.6  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  31.15 
 
 		 302 aa  47  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  26.55 
 
 		 361 aa  45.8  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  28 
 
 		 296 aa  45.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194637 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>