57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5481 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2865  hypothetical protein  48.31 
 
 		 833 aa  787    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349259 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5787  LmbE family protein  47.11 
 
 		 826 aa  753    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1378  LmbE family protein  50.61 
 
 		 811 aa  835    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.455016 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2961  LmbE family protein  41.2 
 
 		 843 aa  652    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0537053  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5481  LmbE family protein  100 
 
 		 825 aa  1706    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.048486 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0742  LmbE family protein  47.24 
 
 		 882 aa  757    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12028  hypothetical protein  42.48 
 
 		 830 aa  658    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2611  LmbE family protein  41 
 
 		 839 aa  630  1e-179  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3334  hypothetical protein  35.77 
 
 		 930 aa  244  6e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2487  LmbE family protein  30.53 
 
 		 797 aa  147  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2590  hypothetical protein  28.67 
 
 		 768 aa  123  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04810  uncharacterized LmbE-like protein  33.92 
 
 		 923 aa  112  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.970372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5445  LmbE family protein  31.2 
 
 		 1071 aa  94.4  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  31.82 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  28.85 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  28.34 
 
 		 288 aa  62  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  29.21 
 
 		 290 aa  60.1  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  30.06 
 
 		 293 aa  59.7  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  27.51 
 
 		 309 aa  59.7  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  26.63 
 
 		 359 aa  60.1  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  28.9 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  26.1 
 
 		 287 aa  56.6  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  28.95 
 
 		 289 aa  55.5  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  30 
 
 		 300 aa  55.1  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  25.93 
 
 		 303 aa  54.3  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  25.27 
 
 		 291 aa  53.9  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  27.27 
 
 		 287 aa  53.5  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  29.94 
 
 		 304 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  28.07 
 
 		 293 aa  52  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  26.97 
 
 		 288 aa  51.6  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  29.67 
 
 		 311 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  27.22 
 
 		 298 aa  50.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  26.55 
 
 		 312 aa  50.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  26.97 
 
 		 288 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  30.18 
 
 		 314 aa  49.7  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  25.99 
 
 		 295 aa  48.5  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  26.63 
 
 		 303 aa  48.5  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  27.53 
 
 		 291 aa  48.1  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  29.66 
 
 		 238 aa  47.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  29.17 
 
 		 242 aa  47.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  26.97 
 
 		 290 aa  47.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  26.97 
 
 		 290 aa  47.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  26.97 
 
 		 290 aa  47.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  27.27 
 
 		 244 aa  46.6  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  27.81 
 
 		 238 aa  45.8  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  29.14 
 
 		 234 aa  45.4  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1241  mycothiol conjugate amidase Mca  25.7 
 
 		 301 aa  45.4  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000367029 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  27.78 
 
 		 299 aa  45.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  26.49 
 
 		 316 aa  44.7  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  28.48 
 
 		 234 aa  44.7  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  28.48 
 
 		 234 aa  44.7  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  28.48 
 
 		 234 aa  44.7  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  28.48 
 
 		 234 aa  44.7  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  28.48 
 
 		 234 aa  44.7  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  28.48 
 
 		 234 aa  44.7  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  28.48 
 
 		 234 aa  44.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1416  LmbE family protein  31.03 
 
 		 276 aa  44.3  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>