31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0742 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_12028  hypothetical protein  44.96 
 
 		 830 aa  683    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2865  hypothetical protein  48.22 
 
 		 833 aa  791    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349259 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0742  LmbE family protein  100 
 
 		 882 aa  1809    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2961  LmbE family protein  43.03 
 
 		 843 aa  681    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0537053  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5481  LmbE family protein  47.24 
 
 		 825 aa  749    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.048486 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1378  LmbE family protein  49.22 
 
 		 811 aa  776    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.455016 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5787  LmbE family protein  57.25 
 
 		 826 aa  964    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2611  LmbE family protein  42.53 
 
 		 839 aa  667    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3334  hypothetical protein  37.36 
 
 		 930 aa  243  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2487  LmbE family protein  35.8 
 
 		 797 aa  160  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2590  hypothetical protein  34.43 
 
 		 768 aa  149  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04810  uncharacterized LmbE-like protein  28.21 
 
 		 923 aa  102  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.970372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5445  LmbE family protein  32.37 
 
 		 1071 aa  85.1  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  28.34 
 
 		 309 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  29.89 
 
 		 290 aa  57.4  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  29.21 
 
 		 294 aa  57  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  26.4 
 
 		 288 aa  56.2  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  29.05 
 
 		 295 aa  55.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  30 
 
 		 304 aa  54.7  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  26.4 
 
 		 293 aa  51.6  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  26.7 
 
 		 291 aa  51.2  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  32.64 
 
 		 238 aa  50.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  26.67 
 
 		 309 aa  50.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  26.57 
 
 		 303 aa  49.7  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  26.32 
 
 		 311 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  30.82 
 
 		 231 aa  47.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  28.65 
 
 		 242 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  26.88 
 
 		 300 aa  45.8  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  26.03 
 
 		 323 aa  45.8  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1416  LmbE family protein  30.28 
 
 		 276 aa  45.4  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  27.53 
 
 		 239 aa  44.7  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>