55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2865 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2611  LmbE family protein  40.73 
 
 		 839 aa  645    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12028  hypothetical protein  44.02 
 
 		 830 aa  688    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0742  LmbE family protein  48.22 
 
 		 882 aa  782    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5481  LmbE family protein  48.31 
 
 		 825 aa  774    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.048486 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1378  LmbE family protein  48.91 
 
 		 811 aa  790    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.455016 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5787  LmbE family protein  44.89 
 
 		 826 aa  742    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2961  LmbE family protein  42.76 
 
 		 843 aa  655    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0537053  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2865  hypothetical protein  100 
 
 		 833 aa  1716    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349259 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3334  hypothetical protein  30.13 
 
 		 930 aa  347  5e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2487  LmbE family protein  26.93 
 
 		 797 aa  259  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2590  hypothetical protein  27.84 
 
 		 768 aa  228  5.0000000000000005e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04810  uncharacterized LmbE-like protein  31.93 
 
 		 923 aa  108  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.970372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5445  LmbE family protein  34.27 
 
 		 1071 aa  85.1  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  27.93 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  27.5 
 
 		 291 aa  63.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  29.78 
 
 		 295 aa  62.4  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  29.05 
 
 		 294 aa  60.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  27.78 
 
 		 293 aa  60.1  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  29.32 
 
 		 309 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  27.53 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  27.93 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  25 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  28.11 
 
 		 323 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  27 
 
 		 290 aa  56.2  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  29.94 
 
 		 304 aa  55.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  29.12 
 
 		 294 aa  54.3  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  23.81 
 
 		 307 aa  53.9  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  24.07 
 
 		 312 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  24.29 
 
 		 303 aa  53.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  31.28 
 
 		 314 aa  52.8  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  24.48 
 
 		 293 aa  52  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  25.67 
 
 		 287 aa  50.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  26.71 
 
 		 300 aa  49.7  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  25 
 
 		 287 aa  48.9  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  29.83 
 
 		 311 aa  48.5  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1416  LmbE family protein  32.48 
 
 		 276 aa  48.5  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  24.48 
 
 		 296 aa  48.5  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194637 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  25.84 
 
 		 288 aa  48.5  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  26.21 
 
 		 292 aa  48.1  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  27.98 
 
 		 288 aa  48.1  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  27.95 
 
 		 290 aa  47.8  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  27.95 
 
 		 290 aa  47.8  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  27.95 
 
 		 290 aa  47.8  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1241  mycothiol conjugate amidase Mca  25.56 
 
 		 301 aa  47.8  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000367029 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2080  LmbE family protein  25.38 
 
 		 281 aa  46.6  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0263313  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4036  hypothetical protein  28.21 
 
 		 276 aa  46.2  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  26.15 
 
 		 298 aa  46.6  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  24.86 
 
 		 291 aa  46.6  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  25.28 
 
 		 239 aa  45.8  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  29.35 
 
 		 305 aa  46.2  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1169  LmbE family protein  27.44 
 
 		 301 aa  45.8  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.805763  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2672  LmbE family protein  25.93 
 
 		 246 aa  45.4  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  25.56 
 
 		 316 aa  45.1  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  25.64 
 
 		 295 aa  44.7  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3412  LmbE family protein  30.13 
 
 		 292 aa  44.3  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>