60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2611 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1378  LmbE family protein  42.13 
 
 		 811 aa  640    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.455016 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2865  hypothetical protein  40.73 
 
 		 833 aa  645    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349259 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12028  hypothetical protein  41.61 
 
 		 830 aa  665    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5787  LmbE family protein  41.43 
 
 		 826 aa  650    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2611  LmbE family protein  100 
 
 		 839 aa  1685    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0742  LmbE family protein  42.53 
 
 		 882 aa  663    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2961  LmbE family protein  40.1 
 
 		 843 aa  624  1e-177  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0537053  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5481  LmbE family protein  41 
 
 		 825 aa  620  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.048486 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2487  LmbE family protein  29.69 
 
 		 797 aa  265  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3334  hypothetical protein  36.53 
 
 		 930 aa  221  6e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2590  hypothetical protein  35.37 
 
 		 768 aa  149  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04810  uncharacterized LmbE-like protein  35.2 
 
 		 923 aa  107  8e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.970372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5445  LmbE family protein  36.72 
 
 		 1071 aa  88.2  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  34.04 
 
 		 309 aa  73.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  28.57 
 
 		 294 aa  64.3  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  33.33 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  29.05 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  29.21 
 
 		 295 aa  59.7  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  29.21 
 
 		 293 aa  59.7  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  29.61 
 
 		 291 aa  59.3  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  26.8 
 
 		 359 aa  59.3  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  27.27 
 
 		 303 aa  59.3  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  29.67 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  32.47 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1963  LmbE family protein  29.53 
 
 		 245 aa  55.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0119223  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  25 
 
 		 328 aa  55.8  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2880  LmbE-like protein  32.99 
 
 		 245 aa  55.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  26.29 
 
 		 293 aa  55.1  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2633  mycothiol conjugate amidase Mca  27.78 
 
 		 293 aa  54.7  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342297  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  29.26 
 
 		 304 aa  54.7  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  29.1 
 
 		 323 aa  54.7  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  27.72 
 
 		 298 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  26.55 
 
 		 295 aa  53.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  30.34 
 
 		 299 aa  53.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  32.12 
 
 		 302 aa  52.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  26.52 
 
 		 290 aa  52.8  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  32.61 
 
 		 294 aa  52.4  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  27.51 
 
 		 312 aa  51.2  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  27.42 
 
 		 291 aa  51.2  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  29.89 
 
 		 296 aa  50.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194637 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  31.16 
 
 		 361 aa  50.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  29.41 
 
 		 271 aa  49.7  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  29.94 
 
 		 314 aa  50.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  27.41 
 
 		 463 aa  48.9  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0096  mycothiol conjugate amidase Mca  26.52 
 
 		 292 aa  48.9  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  27.22 
 
 		 287 aa  48.5  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11195  N-acetyl-1-D-myo-inosityl-2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside deacetylase mshB  31.54 
 
 		 303 aa  48.5  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  27.78 
 
 		 287 aa  48.5  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  23.63 
 
 		 303 aa  47  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  33.53 
 
 		 270 aa  46.2  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  27.37 
 
 		 288 aa  46.6  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  25 
 
 		 309 aa  46.2  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  27.13 
 
 		 302 aa  46.2  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  25.97 
 
 		 307 aa  45.8  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  28.18 
 
 		 316 aa  45.8  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  32 
 
 		 292 aa  44.7  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3412  LmbE family protein  30.52 
 
 		 292 aa  44.3  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0942  mycothiol conjugate amidase Mca  25.99 
 
 		 295 aa  44.3  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2706  LmbE family protein  29.03 
 
 		 256 aa  44.3  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  30.59 
 
 		 284 aa  44.3  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>