209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8537 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  100 
 
 		 294 aa  604  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  82.94 
 
 		 293 aa  511  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  74.91 
 
 		 303 aa  432  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  71.68 
 
 		 290 aa  412  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  68.75 
 
 		 295 aa  404  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  66.08 
 
 		 287 aa  394  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  66.55 
 
 		 293 aa  385  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  67.48 
 
 		 287 aa  386  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0096  mycothiol conjugate amidase Mca  67.83 
 
 		 292 aa  382  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  67.02 
 
 		 309 aa  376  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  64.14 
 
 		 291 aa  374  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  62.37 
 
 		 303 aa  360  1e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  65.03 
 
 		 328 aa  360  1e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  65.97 
 
 		 298 aa  351  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  63.19 
 
 		 300 aa  348  5e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  62.76 
 
 		 295 aa  348  5e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  60.14 
 
 		 316 aa  345  5e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  58.5 
 
 		 312 aa  344  1e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0942  mycothiol conjugate amidase Mca  62.5 
 
 		 295 aa  338  8e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  57.34 
 
 		 289 aa  336  2.9999999999999997e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1101  LmbE family protein  59.66 
 
 		 313 aa  333  1e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0911817  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  57.8 
 
 		 288 aa  333  2e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  58.3 
 
 		 291 aa  328  9e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  56.64 
 
 		 290 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  56.64 
 
 		 290 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  56.64 
 
 		 290 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  58.13 
 
 		 291 aa  323  3e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  57.19 
 
 		 299 aa  323  3e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1241  mycothiol conjugate amidase Mca  57.53 
 
 		 301 aa  316  3e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000367029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  56.94 
 
 		 290 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2633  mycothiol conjugate amidase Mca  57.19 
 
 		 293 aa  311  6.999999999999999e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342297  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  55.93 
 
 		 359 aa  311  7.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1169  LmbE family protein  58.36 
 
 		 301 aa  307  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.805763  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  55.48 
 
 		 288 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  52.25 
 
 		 303 aa  290  2e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05100  uncharacterized LmbE-like protein  45.43 
 
 		 330 aa  237  2e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34779  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1609  LmbE family protein  39.12 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  35.44 
 
 		 288 aa  172  7.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  40.96 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  38.64 
 
 		 294 aa  152  8.999999999999999e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  35.47 
 
 		 305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  35.45 
 
 		 323 aa  145  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  36.52 
 
 		 307 aa  144  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  36.84 
 
 		 302 aa  142  9e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  35.06 
 
 		 302 aa  136  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1157  LmbE family protein  34.42 
 
 		 302 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103463  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  34.26 
 
 		 309 aa  132  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3908  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidedeacetylase  35.86 
 
 		 282 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  32.99 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  32.76 
 
 		 292 aa  125  9e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  35.25 
 
 		 296 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194637 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  35.93 
 
 		 271 aa  122  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  32.68 
 
 		 314 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1131  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  35.37 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  34.41 
 
 		 361 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  34.11 
 
 		 284 aa  115  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  31.31 
 
 		 304 aa  115  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  33 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  33.22 
 
 		 304 aa  112  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  31.79 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  32.55 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  32.75 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6362  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  32.38 
 
 		 355 aa  109  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.797199  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  31.83 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1146  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  33.55 
 
 		 297 aa  106  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0802505  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  33.45 
 
 		 268 aa  106  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3763  LmbE family protein  31.58 
 
 		 314 aa  105  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4264  LmbE family protein  30.62 
 
 		 308 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4034  LmbE-like protein  32.17 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4109  LmbE family protein  32.17 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  38.22 
 
 		 260 aa  99.8  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1717  LmbE family protein  30.74 
 
 		 265 aa  98.6  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264749  normal  0.141737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  29.05 
 
 		 277 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  37.5 
 
 		 274 aa  94  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  37.35 
 
 		 306 aa  93.6  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  38.16 
 
 		 272 aa  92  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  31.63 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  30.08 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11830  uncharacterized LmbE-like protein  31.28 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11195  N-acetyl-1-D-myo-inosityl-2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside deacetylase mshB  37.57 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  32.42 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  32.37 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4309  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  37.72 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.414925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  28.63 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  30.33 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  33.92 
 
 		 463 aa  76.6  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  27.78 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26080  uncharacterized LmbE-like protein  30 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0794  LmbE family protein  29.44 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7629  conserved hypothetical protein LmbE  38.46 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  31.52 
 
 		 484 aa  72.8  0.000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2744  LmbE family protein  32.18 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3329  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  27.42 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3334  hypothetical protein  32.57 
 
 		 930 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  27.27 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2880  LmbE-like protein  34.27 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  30.51 
 
 		 227 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  29.21 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0963  LmbE family protein  30.29 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.871469  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2611  LmbE family protein  28.57 
 
 		 839 aa  64.3  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>