143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0111 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  100 
 
 		 272 aa  550  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25150  uncharacterized LmbE-like protein  57.95 
 
 		 276 aa  244  8e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1717  LmbE family protein  40.84 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264749  normal  0.141737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  38.67 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  36.61 
 
 		 276 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7629  conserved hypothetical protein LmbE  39.77 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  40.78 
 
 		 271 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  38.43 
 
 		 272 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1564  LmbE family protein  41.25 
 
 		 249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2066  LmbE family protein  41.73 
 
 		 260 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.788335  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2063  LmbE family protein  33.46 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.621091  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4220  conserved hypothetical protein LmbE  36.26 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270991  hitchhiker  0.000751351 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4034  LmbE-like protein  34.52 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4109  LmbE family protein  34.52 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4264  LmbE family protein  34.16 
 
 		 308 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  32.72 
 
 		 300 aa  98.6  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  29.45 
 
 		 302 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  29.48 
 
 		 288 aa  96.3  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  32.64 
 
 		 268 aa  96.3  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  31.14 
 
 		 292 aa  94  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1131  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  31.72 
 
 		 297 aa  93.6  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  37.06 
 
 		 303 aa  93.2  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  39.24 
 
 		 293 aa  92.4  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  32.28 
 
 		 302 aa  92  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3908  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidedeacetylase  34.29 
 
 		 282 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  38.85 
 
 		 312 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  31.09 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  31.68 
 
 		 295 aa  90.1  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  31.34 
 
 		 309 aa  89.7  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  33.73 
 
 		 286 aa  89.4  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  32.12 
 
 		 284 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  31 
 
 		 288 aa  89.4  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  30.97 
 
 		 308 aa  89  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  37.11 
 
 		 288 aa  89  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  39.63 
 
 		 287 aa  87.4  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1432  LmbE family protein  36.5 
 
 		 275 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.886775 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  31.46 
 
 		 287 aa  87  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0942  mycothiol conjugate amidase Mca  33.21 
 
 		 295 aa  87  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  40.13 
 
 		 304 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  38.75 
 
 		 303 aa  87  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  31.34 
 
 		 291 aa  87  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1101  LmbE family protein  30.11 
 
 		 313 aa  86.7  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0911817  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  37.21 
 
 		 289 aa  86.3  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  29.58 
 
 		 291 aa  85.9  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  28.16 
 
 		 274 aa  85.5  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  30.07 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1157  LmbE family protein  30.11 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103463  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  37.8 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  30.6 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  31.3 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  29.96 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1169  LmbE family protein  29.96 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.805763  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1241  mycothiol conjugate amidase Mca  36.65 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000367029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  38.04 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  30.8 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  29.85 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3763  LmbE family protein  29.55 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  31.54 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  30.74 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194637 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  35.9 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1609  LmbE family protein  36.71 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  35.22 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  35.22 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  35.22 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  30.29 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  33.76 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2633  mycothiol conjugate amidase Mca  30.83 
 
 		 293 aa  78.6  0.00000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342297  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  37.34 
 
 		 328 aa  79  0.00000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  29.58 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  37.89 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  28.19 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11830  uncharacterized LmbE-like protein  34.66 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  29.05 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  30.33 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  30.19 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  32.98 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  39.13 
 
 		 307 aa  75.9  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26080  uncharacterized LmbE-like protein  34.62 
 
 		 369 aa  75.5  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  37.2 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  29.32 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1146  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  39.61 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0802505  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  28.07 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05100  uncharacterized LmbE-like protein  37.58 
 
 		 330 aa  72.4  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34779  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  33.96 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0096  mycothiol conjugate amidase Mca  37.34 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2744  LmbE family protein  28.24 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  33.51 
 
 		 484 aa  70.5  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  34 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3329  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  31.95 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  36.11 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11195  N-acetyl-1-D-myo-inosityl-2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside deacetylase mshB  36.55 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  30.46 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6362  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  34.78 
 
 		 355 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.797199  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4309  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  34.04 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.414925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  30.56 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  24.27 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  34.39 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2689  LmbE-like protein  28.63 
 
 		 285 aa  57  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  30.6 
 
 		 463 aa  57  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0963  LmbE family protein  30.41 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.871469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>