177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4145 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  100 
 
 
308 aa  625  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3763  LmbE family protein  90.91 
 
 
314 aa  531  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  58.05 
 
 
296 aa  333  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.194637 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  60.2 
 
 
294 aa  329  3e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  57.93 
 
 
292 aa  317  1e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  57.7 
 
 
323 aa  316  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  56.95 
 
 
302 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  54.85 
 
 
305 aa  308  8e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  55.63 
 
 
302 aa  300  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  55.56 
 
 
314 aa  297  2e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1131  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  55.48 
 
 
297 aa  289  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  53.12 
 
 
286 aa  280  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  51.35 
 
 
307 aa  271  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3908  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidedeacetylase  52.63 
 
 
282 aa  262  4.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1157  LmbE family protein  53 
 
 
302 aa  255  6e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  50.49 
 
 
304 aa  252  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  47.86 
 
 
268 aa  235  7e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  47.92 
 
 
283 aa  226  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4264  LmbE family protein  48.78 
 
 
308 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4034  LmbE-like protein  48.78 
 
 
308 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4109  LmbE family protein  48.78 
 
 
308 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  48.6 
 
 
284 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  48.43 
 
 
284 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1146  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  47.47 
 
 
297 aa  209  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0802505  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6362  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  43.04 
 
 
355 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.797199  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  43.18 
 
 
361 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11195  N-acetyl-1-D-myo-inosityl-2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside deacetylase mshB  45.73 
 
 
303 aa  181  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3329  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  42.71 
 
 
283 aa  171  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  40.7 
 
 
276 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  39.3 
 
 
277 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  40.78 
 
 
271 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  34.13 
 
 
288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4309  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  42.51 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.414925  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26080  uncharacterized LmbE-like protein  47.12 
 
 
369 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  36.08 
 
 
303 aa  143  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  39.39 
 
 
316 aa  142  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  37.06 
 
 
295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1717  LmbE family protein  36.97 
 
 
265 aa  139  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264749  normal  0.141737 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  39.84 
 
 
306 aa  139  7.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  36.24 
 
 
303 aa  135  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  34.67 
 
 
291 aa  135  8e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  32.51 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  36.12 
 
 
288 aa  131  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  34.07 
 
 
274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  34.45 
 
 
300 aa  129  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  33.22 
 
 
299 aa  129  6e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1101  LmbE family protein  36.12 
 
 
313 aa  129  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0911817  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  33.66 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  46.99 
 
 
484 aa  127  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  30.92 
 
 
304 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  35 
 
 
290 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  35 
 
 
290 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  35 
 
 
290 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  34.13 
 
 
291 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0942  mycothiol conjugate amidase Mca  36.36 
 
 
295 aa  122  8e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  36.39 
 
 
289 aa  122  8e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  35.5 
 
 
295 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  35.59 
 
 
328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  33.22 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  31.56 
 
 
291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  33.66 
 
 
312 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  33.89 
 
 
287 aa  119  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  34.11 
 
 
290 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  34.11 
 
 
287 aa  119  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1609  LmbE family protein  35.17 
 
 
297 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  32.8 
 
 
359 aa  119  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  33.78 
 
 
309 aa  116  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  32.33 
 
 
290 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  33.55 
 
 
299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  32.11 
 
 
299 aa  115  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  42.01 
 
 
309 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05100  uncharacterized LmbE-like protein  33.33 
 
 
330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34779  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  33.12 
 
 
293 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  33.33 
 
 
298 aa  112  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2633  mycothiol conjugate amidase Mca  35.35 
 
 
293 aa  112  9e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342297  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  32.55 
 
 
294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1169  LmbE family protein  34.5 
 
 
301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.805763  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  30.95 
 
 
311 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  34.55 
 
 
303 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  40.91 
 
 
463 aa  109  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  39.61 
 
 
260 aa  108  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0096  mycothiol conjugate amidase Mca  33.11 
 
 
292 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0794  LmbE family protein  35.75 
 
 
331 aa  103  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11830  uncharacterized LmbE-like protein  40.96 
 
 
268 aa  102  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1241  mycothiol conjugate amidase Mca  33.64 
 
 
301 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000367029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  39.87 
 
 
272 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2744  LmbE family protein  31.73 
 
 
253 aa  97.8  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0963  LmbE family protein  38.97 
 
 
408 aa  93.2  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.871469  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  30.97 
 
 
272 aa  89  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7629  conserved hypothetical protein LmbE  41.14 
 
 
263 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2063  LmbE family protein  36.71 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.621091  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4220  conserved hypothetical protein LmbE  32.99 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270991  hitchhiker  0.000751351 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  29.37 
 
 
238 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  33.75 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25150  uncharacterized LmbE-like protein  31.18 
 
 
276 aa  70.9  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  35.85 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  29.58 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1564  LmbE family protein  39.87 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0008  LmbE family protein  30.49 
 
 
240 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00173009  normal  0.123538 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  25.74 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>