213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0008 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0008  LmbE family protein  100 
 
 
240 aa  483  1e-136  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00173009  normal  0.123538 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  76.67 
 
 
244 aa  382  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  42.79 
 
 
218 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  36.26 
 
 
276 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  31.76 
 
 
271 aa  85.5  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2880  LmbE-like protein  30.61 
 
 
245 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4034  LmbE-like protein  32.2 
 
 
308 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4109  LmbE family protein  32.2 
 
 
308 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4264  LmbE family protein  32.2 
 
 
308 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  32.62 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  29.7 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  30.51 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  34.57 
 
 
299 aa  79.3  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  28.77 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  27.83 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  27.83 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  27.83 
 
 
227 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  29.9 
 
 
284 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2672  LmbE family protein  34.72 
 
 
246 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  30.81 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  35.19 
 
 
260 aa  77.8  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  27.57 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  29.52 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  31.52 
 
 
288 aa  75.5  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  28.85 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  34.64 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3183  hypothetical protein  28.85 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000002506  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  32.95 
 
 
268 aa  74.7  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  26.89 
 
 
226 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  28.85 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  30.48 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  32.08 
 
 
361 aa  73.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  30.23 
 
 
274 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  28.37 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  29.33 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  29.38 
 
 
323 aa  72  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  33.8 
 
 
231 aa  72  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  28.37 
 
 
220 aa  72  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  30.6 
 
 
302 aa  72.4  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  31.03 
 
 
229 aa  72  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3179  LmbE family protein  28.85 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  32.89 
 
 
221 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  30.43 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  32.89 
 
 
221 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  28 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3268  hypothetical protein  29.19 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000289968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3241  hypothetical protein  29.19 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000243018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3524  hypothetical protein  29.19 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3484  hypothetical protein  29.19 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  28.9 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  32.69 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  24.9 
 
 
277 aa  68.9  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  28.49 
 
 
296 aa  68.6  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.194637 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  30 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1157  LmbE family protein  33.12 
 
 
302 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103463  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  30.49 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  31.48 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  29.69 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  32.88 
 
 
311 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  31.37 
 
 
299 aa  67  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3908  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidedeacetylase  30.23 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  30.26 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  28.91 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  29.63 
 
 
302 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  29.65 
 
 
463 aa  64.3  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  25.81 
 
 
237 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1131  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  32.32 
 
 
297 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  30.07 
 
 
237 aa  63.9  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  28.12 
 
 
237 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1146  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  34.38 
 
 
297 aa  63.5  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0802505  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  26.72 
 
 
207 aa  63.2  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  30.43 
 
 
293 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  29.68 
 
 
248 aa  63.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  33.54 
 
 
484 aa  62.4  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  29.81 
 
 
290 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  29.81 
 
 
290 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  29.81 
 
 
290 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3763  LmbE family protein  31.71 
 
 
314 aa  62  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  31.58 
 
 
303 aa  62  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  29.49 
 
 
293 aa  62  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1423  LmbE family protein  28.48 
 
 
234 aa  62  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1823  LmbE family protein  30.99 
 
 
258 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.318027  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  29.63 
 
 
288 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  30.41 
 
 
305 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  32.1 
 
 
306 aa  60.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  29.66 
 
 
303 aa  60.1  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  30.72 
 
 
225 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  25.52 
 
 
264 aa  59.7  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  28.21 
 
 
316 aa  59.7  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  34 
 
 
250 aa  59.7  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10328  hypothetical protein  34.31 
 
 
223 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  27.78 
 
 
290 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26080  uncharacterized LmbE-like protein  28.42 
 
 
369 aa  59.7  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  26.71 
 
 
291 aa  58.9  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  28.96 
 
 
288 aa  58.9  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3329  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  29.41 
 
 
283 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  28.85 
 
 
300 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  30.63 
 
 
302 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  29.19 
 
 
295 aa  58.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  28.85 
 
 
294 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.997476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>