193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_07280 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  100 
 
 
316 aa  643    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  65.84 
 
 
289 aa  384  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  61.43 
 
 
293 aa  365  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1101  LmbE family protein  61.56 
 
 
313 aa  363  2e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0911817  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  60.28 
 
 
287 aa  360  1e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  65.16 
 
 
303 aa  360  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  63.96 
 
 
288 aa  359  3e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  61.67 
 
 
287 aa  358  8e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  62.24 
 
 
295 aa  354  1e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  61.46 
 
 
293 aa  353  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  58.48 
 
 
312 aa  352  5e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  62.28 
 
 
291 aa  350  3e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  60.76 
 
 
290 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  60.76 
 
 
290 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  60.76 
 
 
290 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  60.14 
 
 
294 aa  345  6e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  61.13 
 
 
309 aa  345  6e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  58.97 
 
 
291 aa  343  2.9999999999999997e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0942  mycothiol conjugate amidase Mca  61.19 
 
 
295 aa  340  2e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  60.14 
 
 
295 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  60.7 
 
 
291 aa  339  5e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0096  mycothiol conjugate amidase Mca  59.58 
 
 
292 aa  328  7e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  58.04 
 
 
299 aa  328  1.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  58.6 
 
 
288 aa  322  4e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  61.27 
 
 
303 aa  322  7e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  58.89 
 
 
290 aa  321  9.000000000000001e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  61.4 
 
 
290 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  60.75 
 
 
328 aa  317  2e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  56.85 
 
 
359 aa  316  3e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  55.83 
 
 
303 aa  315  9e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1169  LmbE family protein  58.62 
 
 
301 aa  315  9e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.805763  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1241  mycothiol conjugate amidase Mca  55.52 
 
 
301 aa  311  5.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000367029 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2633  mycothiol conjugate amidase Mca  56.99 
 
 
293 aa  310  2e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342297  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  60.82 
 
 
298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  58.42 
 
 
300 aa  302  6.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05100  uncharacterized LmbE-like protein  50.32 
 
 
330 aa  282  5.000000000000001e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34779  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  37.54 
 
 
288 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  39.59 
 
 
323 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1609  LmbE family protein  37.41 
 
 
297 aa  152  5e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1157  LmbE family protein  37.99 
 
 
302 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103463  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  41.56 
 
 
292 aa  150  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  39.87 
 
 
302 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  41.72 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  37.5 
 
 
286 aa  145  6e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  38 
 
 
305 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  39.39 
 
 
308 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3908  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidedeacetylase  37.46 
 
 
282 aa  139  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  37.58 
 
 
302 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  36.7 
 
 
307 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3763  LmbE family protein  38.72 
 
 
314 aa  135  9e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  36.01 
 
 
309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  45.14 
 
 
299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  35.12 
 
 
276 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  35.4 
 
 
271 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  35.02 
 
 
314 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  39.03 
 
 
361 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1131  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  36.45 
 
 
297 aa  122  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  35.23 
 
 
304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6362  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  33.75 
 
 
355 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.797199  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1717  LmbE family protein  33.73 
 
 
265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264749  normal  0.141737 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  34.21 
 
 
283 aa  115  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  35.1 
 
 
296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.194637 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  34.36 
 
 
268 aa  110  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  36.12 
 
 
284 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  33.56 
 
 
311 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  30.41 
 
 
304 aa  106  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  32.55 
 
 
274 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  33.67 
 
 
284 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  43.64 
 
 
306 aa  102  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  31.25 
 
 
277 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4264  LmbE family protein  33.22 
 
 
308 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11195  N-acetyl-1-D-myo-inosityl-2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside deacetylase mshB  44.09 
 
 
303 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4034  LmbE-like protein  35.86 
 
 
308 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4109  LmbE family protein  35.86 
 
 
308 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1146  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  33.76 
 
 
297 aa  95.1  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0802505  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  35.64 
 
 
260 aa  93.6  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0794  LmbE family protein  35.71 
 
 
331 aa  92.4  9e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  31.09 
 
 
272 aa  91.3  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26080  uncharacterized LmbE-like protein  36.52 
 
 
369 aa  91.3  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  37.58 
 
 
272 aa  88.6  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  31.49 
 
 
484 aa  89  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11830  uncharacterized LmbE-like protein  36.11 
 
 
268 aa  86.7  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0963  LmbE family protein  36.06 
 
 
408 aa  84.7  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.871469  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  30.72 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2744  LmbE family protein  28.2 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7629  conserved hypothetical protein LmbE  38.22 
 
 
263 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4309  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  42.77 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.414925  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  32.4 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  28.72 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25150  uncharacterized LmbE-like protein  27.17 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  33.33 
 
 
463 aa  70.9  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  27.62 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  33.96 
 
 
229 aa  68.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1564  LmbE family protein  30.92 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2880  LmbE-like protein  29.15 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  30.2 
 
 
283 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  30.53 
 
 
218 aa  65.1  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3329  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  28.95 
 
 
283 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  27.31 
 
 
237 aa  64.7  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  32.31 
 
 
239 aa  63.2  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>