184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1101 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1101  LmbE family protein  100 
 
 		 313 aa  641    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0911817  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  64.86 
 
 		 293 aa  386  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  63.92 
 
 		 289 aa  384  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  61.56 
 
 		 316 aa  374  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  62.59 
 
 		 295 aa  363  2e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  61.94 
 
 		 288 aa  361  7.0000000000000005e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  59.66 
 
 		 293 aa  360  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  60.88 
 
 		 287 aa  357  9.999999999999999e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  61.51 
 
 		 295 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  60.62 
 
 		 309 aa  355  3.9999999999999996e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  60.96 
 
 		 291 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  59.53 
 
 		 299 aa  352  4e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  61.03 
 
 		 290 aa  352  7e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  61.03 
 
 		 290 aa  352  7e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  61.03 
 
 		 290 aa  352  7e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  62.84 
 
 		 290 aa  351  1e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  61.69 
 
 		 287 aa  350  2e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  63.01 
 
 		 303 aa  350  3e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  59.66 
 
 		 294 aa  346  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  58.19 
 
 		 291 aa  347  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  60.62 
 
 		 291 aa  341  1e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0942  mycothiol conjugate amidase Mca  59.86 
 
 		 295 aa  339  4e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0096  mycothiol conjugate amidase Mca  57.72 
 
 		 292 aa  333  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  60.07 
 
 		 303 aa  332  3e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  56.76 
 
 		 312 aa  332  6e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  57.24 
 
 		 288 aa  325  5e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  59.46 
 
 		 328 aa  325  7e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  57.68 
 
 		 359 aa  323  2e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1241  mycothiol conjugate amidase Mca  57.39 
 
 		 301 aa  319  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000367029 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  55.44 
 
 		 303 aa  318  7e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  59.66 
 
 		 290 aa  317  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  56 
 
 		 300 aa  304  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2633  mycothiol conjugate amidase Mca  54.08 
 
 		 293 aa  301  7.000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342297  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1169  LmbE family protein  55.22 
 
 		 301 aa  299  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.805763  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  57.14 
 
 		 298 aa  296  4e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05100  uncharacterized LmbE-like protein  48.79 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34779  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1609  LmbE family protein  39.46 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  43.58 
 
 		 294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1157  LmbE family protein  39.09 
 
 		 302 aa  159  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103463  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  37.84 
 
 		 286 aa  155  6e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  39.41 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  38.71 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  35.71 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  38.05 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  37.09 
 
 		 314 aa  147  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  38.18 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  36.54 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3908  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidedeacetylase  37.67 
 
 		 282 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  38.13 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  36.12 
 
 		 308 aa  133  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1131  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  37.63 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  34.56 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194637 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  32.88 
 
 		 309 aa  124  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3763  LmbE family protein  34.78 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  33.98 
 
 		 299 aa  123  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6362  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  32.83 
 
 		 355 aa  122  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.797199  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  34.07 
 
 		 304 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  34 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  33.11 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  35.91 
 
 		 271 aa  119  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  34.12 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  35.29 
 
 		 284 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  32.92 
 
 		 361 aa  113  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  34.19 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  32.56 
 
 		 277 aa  109  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1146  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  33.23 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0802505  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  30.54 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  31.16 
 
 		 311 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11195  N-acetyl-1-D-myo-inosityl-2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside deacetylase mshB  41.18 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  34.87 
 
 		 306 aa  99.4  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1717  LmbE family protein  30.34 
 
 		 265 aa  97.1  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264749  normal  0.141737 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4264  LmbE family protein  31.13 
 
 		 308 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4034  LmbE-like protein  31.13 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4109  LmbE family protein  31.13 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  31.6 
 
 		 272 aa  92.4  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  34.38 
 
 		 274 aa  89.4  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  30.07 
 
 		 484 aa  87.4  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  28.08 
 
 		 299 aa  87  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  27.96 
 
 		 271 aa  87  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11830  uncharacterized LmbE-like protein  36.53 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2744  LmbE family protein  28.88 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26080  uncharacterized LmbE-like protein  28.36 
 
 		 369 aa  82.8  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  29.26 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  35.95 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0963  LmbE family protein  33.5 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.871469  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  36.09 
 
 		 463 aa  80.5  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3329  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  28.99 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0794  LmbE family protein  27.88 
 
 		 331 aa  79.3  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7629  conserved hypothetical protein LmbE  36.54 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4309  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  39.16 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.414925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  29.27 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1564  LmbE family protein  33.11 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3334  hypothetical protein  30.9 
 
 		 930 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  26.89 
 
 		 238 aa  67  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  28.99 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  28.81 
 
 		 237 aa  62  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  29.38 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10328  hypothetical protein  34.97 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  26.53 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25150  uncharacterized LmbE-like protein  28.41 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>