119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0794 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0794  LmbE family protein  100 
 
 		 331 aa  667    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26080  uncharacterized LmbE-like protein  43.79 
 
 		 369 aa  218  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  43.55 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  37.1 
 
 		 361 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  38.18 
 
 		 463 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  38.89 
 
 		 283 aa  142  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0963  LmbE family protein  35.25 
 
 		 408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.871469  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  37.13 
 
 		 284 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  34.65 
 
 		 268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  33.44 
 
 		 286 aa  122  8e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  36.27 
 
 		 284 aa  122  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  39.25 
 
 		 304 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4034  LmbE-like protein  35.96 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4109  LmbE family protein  35.96 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4264  LmbE family protein  35.96 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3908  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidedeacetylase  33.12 
 
 		 282 aa  109  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1157  LmbE family protein  30.65 
 
 		 302 aa  109  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103463  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  32.59 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  32.9 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1146  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  35.87 
 
 		 297 aa  105  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0802505  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  38.89 
 
 		 323 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  32.58 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  39.33 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  35.75 
 
 		 308 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11830  uncharacterized LmbE-like protein  38.1 
 
 		 268 aa  100  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  33.83 
 
 		 276 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  42.37 
 
 		 484 aa  99.8  6e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1131  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  32.28 
 
 		 297 aa  97.4  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  37.14 
 
 		 314 aa  96.7  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3763  LmbE family protein  34.84 
 
 		 314 aa  95.9  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11195  N-acetyl-1-D-myo-inosityl-2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside deacetylase mshB  43.98 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  40.11 
 
 		 309 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3329  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  32.8 
 
 		 283 aa  93.6  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  33.7 
 
 		 288 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  35.71 
 
 		 316 aa  92.4  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  34.9 
 
 		 296 aa  90.5  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194637 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  39.67 
 
 		 271 aa  90.5  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6362  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  38.59 
 
 		 355 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.797199  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  31.65 
 
 		 303 aa  87.4  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  36.96 
 
 		 305 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  33.33 
 
 		 307 aa  85.9  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  38.32 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  33.33 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  29.12 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  31.5 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  35.56 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  31.67 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  33.33 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  31.28 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  35.33 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  33.51 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  29.44 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  35.87 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  30.73 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  31.84 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  30.73 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  30.73 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  30.17 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  32.78 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  29.78 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  33.33 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  31.77 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1101  LmbE family protein  30.72 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0911817  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  32.95 
 
 		 260 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  29.61 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  33.33 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  29.44 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2633  mycothiol conjugate amidase Mca  31.46 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342297  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  34.09 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0942  mycothiol conjugate amidase Mca  31.11 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  31.11 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  31.25 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  31.52 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4309  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  41.71 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.414925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  29.73 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  28.33 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  31.9 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1169  LmbE family protein  30.3 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.805763  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  30.94 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2744  LmbE family protein  35.71 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7629  conserved hypothetical protein LmbE  33.71 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  28.49 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  28.33 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  27.27 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1241  mycothiol conjugate amidase Mca  29.69 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000367029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  31.11 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05100  uncharacterized LmbE-like protein  31.11 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34779  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1609  LmbE family protein  31.87 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0096  mycothiol conjugate amidase Mca  26.82 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1717  LmbE family protein  27.93 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264749  normal  0.141737 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1564  LmbE family protein  29.44 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0008  LmbE family protein  27.62 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00173009  normal  0.123538 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  30.56 
 
 		 272 aa  55.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  27.87 
 
 		 244 aa  52.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  25.6 
 
 		 220 aa  50.8  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3183  hypothetical protein  24.4 
 
 		 220 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000002506  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3268  hypothetical protein  24.4 
 
 		 220 aa  49.3  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000289968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3241  hypothetical protein  24.4 
 
 		 220 aa  49.3  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000243018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3524  hypothetical protein  24.4 
 
 		 220 aa  49.3  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3484  hypothetical protein  24.4 
 
 		 220 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>