138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2744 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2744  LmbE family protein  100 
 
 		 253 aa  515  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  34.81 
 
 		 284 aa  125  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  33.9 
 
 		 284 aa  122  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  35.9 
 
 		 283 aa  115  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  34.41 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  33.33 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  31.43 
 
 		 304 aa  109  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  31.54 
 
 		 302 aa  108  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  31.32 
 
 		 323 aa  108  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  35.44 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1131  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  32.71 
 
 		 297 aa  105  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  27.99 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  30.82 
 
 		 302 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  29.48 
 
 		 276 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4264  LmbE family protein  31.41 
 
 		 308 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4034  LmbE-like protein  31.41 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4109  LmbE family protein  31.41 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  30.66 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  29.56 
 
 		 290 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  29.56 
 
 		 290 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  29.56 
 
 		 290 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  29.01 
 
 		 288 aa  99.4  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  31.73 
 
 		 308 aa  99.4  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3908  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidedeacetylase  32.65 
 
 		 282 aa  97.8  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  28.09 
 
 		 309 aa  98.2  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  29.04 
 
 		 291 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3763  LmbE family protein  30.63 
 
 		 314 aa  96.7  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0096  mycothiol conjugate amidase Mca  29.21 
 
 		 292 aa  96.7  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  28.73 
 
 		 288 aa  97.1  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  33.46 
 
 		 271 aa  96.3  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  28.04 
 
 		 299 aa  96.7  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  31.85 
 
 		 292 aa  95.5  7e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1157  LmbE family protein  30.58 
 
 		 302 aa  95.1  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103463  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  31 
 
 		 307 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1146  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  35.57 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0802505  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11195  N-acetyl-1-D-myo-inosityl-2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside deacetylase mshB  36.82 
 
 		 303 aa  94  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  35.84 
 
 		 299 aa  93.6  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  29.1 
 
 		 303 aa  93.6  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  32.42 
 
 		 361 aa  93.2  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6362  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  31.97 
 
 		 355 aa  93.2  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.797199  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  28.36 
 
 		 291 aa  92.4  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  28.36 
 
 		 295 aa  91.3  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  28.62 
 
 		 295 aa  90.5  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  35.06 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1241  mycothiol conjugate amidase Mca  29.45 
 
 		 301 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000367029 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  29.12 
 
 		 289 aa  90.5  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  30.26 
 
 		 305 aa  89.4  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  28 
 
 		 312 aa  89.4  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  28.95 
 
 		 277 aa  89.4  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05100  uncharacterized LmbE-like protein  29.79 
 
 		 330 aa  89  7e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34779  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  26.97 
 
 		 290 aa  88.6  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  26.91 
 
 		 288 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0942  mycothiol conjugate amidase Mca  26.12 
 
 		 295 aa  88.2  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  28.21 
 
 		 309 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  28.57 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  41.61 
 
 		 304 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  30.86 
 
 		 296 aa  86.3  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194637 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  29.43 
 
 		 290 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  28.46 
 
 		 287 aa  85.9  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  27.68 
 
 		 359 aa  85.5  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7629  conserved hypothetical protein LmbE  32.33 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  31.39 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1101  LmbE family protein  28.88 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0911817  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1564  LmbE family protein  32.03 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  28.09 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  32.77 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  29.93 
 
 		 328 aa  82.8  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  28.57 
 
 		 311 aa  82  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  29.27 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4220  conserved hypothetical protein LmbE  35.6 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270991  hitchhiker  0.000751351 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  28.83 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  30 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  28.24 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  32.18 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  29.1 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  34.08 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3329  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  29.03 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2066  LmbE family protein  33.99 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.788335  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2633  mycothiol conjugate amidase Mca  31.84 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342297  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1717  LmbE family protein  27.03 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264749  normal  0.141737 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  28.51 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1609  LmbE family protein  31.54 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  27.84 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1169  LmbE family protein  32 
 
 		 301 aa  72  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.805763  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  28.37 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2063  LmbE family protein  28.74 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.621091  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0794  LmbE family protein  35.2 
 
 		 331 aa  69.3  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  26.34 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26080  uncharacterized LmbE-like protein  27.18 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  27.08 
 
 		 463 aa  65.5  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11830  uncharacterized LmbE-like protein  32.12 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2672  LmbE family protein  29.11 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  30.84 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  26.7 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  33.75 
 
 		 484 aa  57  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0963  LmbE family protein  30.21 
 
 		 408 aa  56.2  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.871469  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  25.75 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  28.63 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4309  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  32.53 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.414925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  26.58 
 
 		 231 aa  50.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>