213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1639 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  100 
 
 		 299 aa  614  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  74.04 
 
 		 288 aa  462  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  73.59 
 
 		 290 aa  447  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  73.59 
 
 		 290 aa  447  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  73.59 
 
 		 290 aa  447  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  73.94 
 
 		 288 aa  441  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  72.18 
 
 		 291 aa  436  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  65.96 
 
 		 293 aa  403  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  70.42 
 
 		 290 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  63.97 
 
 		 303 aa  375  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  61.15 
 
 		 295 aa  374  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  61.86 
 
 		 309 aa  365  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  64.21 
 
 		 289 aa  362  3e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  59.01 
 
 		 287 aa  354  7.999999999999999e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  59.36 
 
 		 287 aa  348  7e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0942  mycothiol conjugate amidase Mca  64.79 
 
 		 295 aa  347  2e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1101  LmbE family protein  59.53 
 
 		 313 aa  339  2.9999999999999998e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0911817  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  60.48 
 
 		 295 aa  333  1e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  58.6 
 
 		 293 aa  332  5e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0096  mycothiol conjugate amidase Mca  58.6 
 
 		 292 aa  332  6e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  61.67 
 
 		 303 aa  330  1e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  62.81 
 
 		 328 aa  329  3e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  62.19 
 
 		 290 aa  329  4e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  56.6 
 
 		 291 aa  328  7e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  58.04 
 
 		 316 aa  328  1.0000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  57.19 
 
 		 294 aa  323  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  60.14 
 
 		 291 aa  319  3e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  54.79 
 
 		 312 aa  311  7.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  54.01 
 
 		 359 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  57.09 
 
 		 300 aa  309  4e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  52.43 
 
 		 303 aa  308  5e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1241  mycothiol conjugate amidase Mca  54.48 
 
 		 301 aa  303  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000367029 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2633  mycothiol conjugate amidase Mca  57.64 
 
 		 293 aa  299  4e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342297  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  57.09 
 
 		 298 aa  294  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1169  LmbE family protein  56.21 
 
 		 301 aa  288  7e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.805763  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05100  uncharacterized LmbE-like protein  47.06 
 
 		 330 aa  263  2e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34779  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1609  LmbE family protein  39.26 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  38.68 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  38.46 
 
 		 323 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  41.37 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  37.37 
 
 		 305 aa  158  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  38.57 
 
 		 286 aa  157  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3908  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidedeacetylase  40.14 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  37.46 
 
 		 307 aa  149  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1157  LmbE family protein  37.83 
 
 		 302 aa  149  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103463  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  37.93 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  37.54 
 
 		 314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  36.75 
 
 		 292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  36.86 
 
 		 302 aa  138  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  38.41 
 
 		 271 aa  136  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  44.51 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1131  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  36.03 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  35.4 
 
 		 276 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  34.43 
 
 		 304 aa  129  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  33.11 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  35.6 
 
 		 361 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  32.89 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  34.59 
 
 		 296 aa  119  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  32.11 
 
 		 308 aa  115  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  35.05 
 
 		 268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  33.33 
 
 		 283 aa  112  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  34.58 
 
 		 277 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1146  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  33.76 
 
 		 297 aa  112  9e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0802505  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  32.45 
 
 		 284 aa  109  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3763  LmbE family protein  32.56 
 
 		 314 aa  109  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6362  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  31.97 
 
 		 355 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.797199  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  38.98 
 
 		 274 aa  105  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  31.91 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  39.18 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  30.74 
 
 		 311 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  30.34 
 
 		 260 aa  96.7  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11830  uncharacterized LmbE-like protein  37.85 
 
 		 268 aa  95.5  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  29.45 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  39.47 
 
 		 272 aa  93.6  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4264  LmbE family protein  31.46 
 
 		 308 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11195  N-acetyl-1-D-myo-inosityl-2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside deacetylase mshB  39.23 
 
 		 303 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26080  uncharacterized LmbE-like protein  34.83 
 
 		 369 aa  91.3  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  30.14 
 
 		 299 aa  91.7  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4034  LmbE-like protein  31.46 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4109  LmbE family protein  31.46 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1717  LmbE family protein  29.62 
 
 		 265 aa  91.3  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264749  normal  0.141737 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2744  LmbE family protein  27.68 
 
 		 253 aa  90.5  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7629  conserved hypothetical protein LmbE  41.29 
 
 		 263 aa  85.5  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3329  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  29.73 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0963  LmbE family protein  32.68 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.871469  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  35.9 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  30.69 
 
 		 463 aa  79  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0794  LmbE family protein  29.78 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  31.43 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  36.02 
 
 		 484 aa  74.7  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1564  LmbE family protein  31.54 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25150  uncharacterized LmbE-like protein  35.22 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4309  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  40.62 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.414925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  32.02 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  33.7 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  30.86 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  30.5 
 
 		 239 aa  67  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  32.6 
 
 		 237 aa  67  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  31.82 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  32.6 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>