156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2165 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  100 
 
 		 284 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  79.15 
 
 		 284 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4264  LmbE family protein  68.33 
 
 		 308 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4034  LmbE-like protein  67.97 
 
 		 308 aa  374  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4109  LmbE family protein  67.97 
 
 		 308 aa  374  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11195  N-acetyl-1-D-myo-inosityl-2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside deacetylase mshB  63.64 
 
 		 303 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  53.61 
 
 		 294 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  53.24 
 
 		 268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1146  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  51.17 
 
 		 297 aa  248  9e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0802505  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  52.45 
 
 		 283 aa  239  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  49.82 
 
 		 292 aa  236  4e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3329  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  48.97 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1131  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  48.08 
 
 		 297 aa  226  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  47.06 
 
 		 302 aa  226  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  47.65 
 
 		 302 aa  222  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  46.53 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3908  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidedeacetylase  46.13 
 
 		 282 aa  217  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  46.8 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  45.24 
 
 		 323 aa  216  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  48.6 
 
 		 308 aa  215  9e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  44.15 
 
 		 307 aa  210  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1157  LmbE family protein  45.15 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103463  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  44.86 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194637 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  44.48 
 
 		 314 aa  203  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3763  LmbE family protein  47.55 
 
 		 314 aa  196  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  42.72 
 
 		 304 aa  185  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4309  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  48.86 
 
 		 293 aa  169  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.414925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  39.27 
 
 		 361 aa  161  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6362  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  40.71 
 
 		 355 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.797199  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  48.69 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  31.85 
 
 		 288 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0794  LmbE family protein  37.13 
 
 		 331 aa  129  5.0000000000000004e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  37.55 
 
 		 276 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  35.29 
 
 		 293 aa  122  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  34.19 
 
 		 463 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  34.87 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  36.79 
 
 		 271 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  36.27 
 
 		 293 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  34.45 
 
 		 295 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  35.41 
 
 		 288 aa  118  9e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  35.43 
 
 		 287 aa  118  9e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  36.24 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0942  mycothiol conjugate amidase Mca  35.79 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  35.76 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  34.29 
 
 		 271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  33 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  42.78 
 
 		 484 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2744  LmbE family protein  33.56 
 
 		 253 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  33.44 
 
 		 359 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  32.2 
 
 		 303 aa  112  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  32.23 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  33.77 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26080  uncharacterized LmbE-like protein  42.22 
 
 		 369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  35.37 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  34.23 
 
 		 303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  32.45 
 
 		 299 aa  109  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1101  LmbE family protein  34.97 
 
 		 313 aa  109  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0911817  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  34.53 
 
 		 309 aa  108  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  36.12 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  32.14 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  33.11 
 
 		 290 aa  106  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  34.63 
 
 		 277 aa  105  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  33.2 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  33.92 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  33.33 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0096  mycothiol conjugate amidase Mca  33.89 
 
 		 292 aa  102  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  36.18 
 
 		 309 aa  102  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  32.33 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  39.26 
 
 		 260 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2633  mycothiol conjugate amidase Mca  34.77 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342297  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  32.79 
 
 		 291 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  34.01 
 
 		 298 aa  99  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  31.72 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  31.72 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  31.72 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  40.88 
 
 		 304 aa  95.5  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  31.8 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  39.19 
 
 		 311 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  37.91 
 
 		 299 aa  92.8  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1609  LmbE family protein  35.87 
 
 		 297 aa  92.4  8e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  37.65 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7629  conserved hypothetical protein LmbE  32.95 
 
 		 263 aa  90.1  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  32.12 
 
 		 272 aa  89.7  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  29.84 
 
 		 290 aa  89  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1241  mycothiol conjugate amidase Mca  32.34 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000367029 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1169  LmbE family protein  33.01 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.805763  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05100  uncharacterized LmbE-like protein  30.53 
 
 		 330 aa  86.3  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34779  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0963  LmbE family protein  36.79 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.871469  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11830  uncharacterized LmbE-like protein  34.91 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1717  LmbE family protein  30.21 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264749  normal  0.141737 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0008  LmbE family protein  29.9 
 
 		 240 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00173009  normal  0.123538 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1564  LmbE family protein  36.77 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  26.61 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  29.66 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  32.37 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  29.82 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  28.9 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  29.44 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1432  LmbE family protein  43.06 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.886775 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4220  conserved hypothetical protein LmbE  36.88 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270991  hitchhiker  0.000751351 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>