187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8449 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  100 
 
 		 302 aa  611  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  72.09 
 
 		 302 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1131  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  64.62 
 
 		 297 aa  340  2e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  59.6 
 
 		 323 aa  326  4.0000000000000003e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  57.33 
 
 		 292 aa  323  1e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  60.43 
 
 		 286 aa  323  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  61.01 
 
 		 294 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3908  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidedeacetylase  56.27 
 
 		 282 aa  302  5.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  53.27 
 
 		 305 aa  302  5.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  55.63 
 
 		 308 aa  300  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  52.6 
 
 		 314 aa  290  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1157  LmbE family protein  56.91 
 
 		 302 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103463  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3763  LmbE family protein  56.86 
 
 		 314 aa  286  4e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  53.15 
 
 		 296 aa  271  9e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194637 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  48.03 
 
 		 307 aa  266  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  49.03 
 
 		 304 aa  249  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  50.38 
 
 		 268 aa  240  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  49.28 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  47.65 
 
 		 284 aa  222  7e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4034  LmbE-like protein  48.35 
 
 		 308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4109  LmbE family protein  48.35 
 
 		 308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1146  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  48.72 
 
 		 297 aa  218  8.999999999999998e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0802505  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4264  LmbE family protein  47.62 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  46.57 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  46.13 
 
 		 361 aa  214  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11195  N-acetyl-1-D-myo-inosityl-2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside deacetylase mshB  43.88 
 
 		 303 aa  185  7e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6362  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  41.61 
 
 		 355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.797199  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  40.81 
 
 		 288 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3329  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  43.32 
 
 		 283 aa  172  9e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  39.41 
 
 		 303 aa  161  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  41.1 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  37.1 
 
 		 277 aa  156  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  40.74 
 
 		 276 aa  155  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  38.02 
 
 		 293 aa  155  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  37.87 
 
 		 271 aa  152  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  39.64 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  35.74 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  37.13 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4309  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  43.36 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.414925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  35.9 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  35.5 
 
 		 291 aa  142  7e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  37.93 
 
 		 484 aa  141  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  36.86 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  36.51 
 
 		 293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26080  uncharacterized LmbE-like protein  34.2 
 
 		 369 aa  139  6e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  37.5 
 
 		 291 aa  139  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  36.86 
 
 		 299 aa  138  8.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  38.06 
 
 		 295 aa  138  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  37.58 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  36.76 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  37.68 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  37.68 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  37.68 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  35.77 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  34.3 
 
 		 290 aa  136  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  35.06 
 
 		 294 aa  136  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  35.35 
 
 		 287 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  33.94 
 
 		 463 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  34.53 
 
 		 359 aa  133  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  33.96 
 
 		 287 aa  132  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  37.66 
 
 		 328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  34.08 
 
 		 312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  35.5 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1609  LmbE family protein  37.94 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  36.42 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0096  mycothiol conjugate amidase Mca  34.73 
 
 		 292 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0942  mycothiol conjugate amidase Mca  39.25 
 
 		 295 aa  127  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  34.54 
 
 		 309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  35.26 
 
 		 298 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  34.98 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1101  LmbE family protein  35.97 
 
 		 313 aa  122  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0911817  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  33.21 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  40.76 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1717  LmbE family protein  36.36 
 
 		 265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264749  normal  0.141737 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05100  uncharacterized LmbE-like protein  35.29 
 
 		 330 aa  119  6e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34779  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1169  LmbE family protein  35.92 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.805763  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  31.6 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2633  mycothiol conjugate amidase Mca  32.58 
 
 		 293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342297  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0963  LmbE family protein  43.54 
 
 		 408 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.871469  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1241  mycothiol conjugate amidase Mca  34.89 
 
 		 301 aa  109  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000367029 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  31.58 
 
 		 271 aa  108  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11830  uncharacterized LmbE-like protein  38.79 
 
 		 268 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  31.3 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0794  LmbE family protein  32.58 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  41.61 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2744  LmbE family protein  30.82 
 
 		 253 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7629  conserved hypothetical protein LmbE  42.86 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  30.48 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  29.45 
 
 		 272 aa  97.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  32.64 
 
 		 274 aa  97.1  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  28.87 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  36.11 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  37.41 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2880  LmbE-like protein  29.13 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25150  uncharacterized LmbE-like protein  31.37 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0008  LmbE family protein  30.6 
 
 		 240 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00173009  normal  0.123538 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  34.23 
 
 		 217 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  29.35 
 
 		 231 aa  72  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  33.33 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2063  LmbE family protein  31.75 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.621091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>