176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0766 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  100 
 
 
283 aa  564  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  61.54 
 
 
268 aa  324  9e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  52.41 
 
 
292 aa  264  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  50.66 
 
 
302 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1146  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  53.54 
 
 
297 aa  248  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0802505  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  53.55 
 
 
284 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  49.65 
 
 
286 aa  240  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  52.45 
 
 
284 aa  239  4e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  48.83 
 
 
294 aa  238  5.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  48.66 
 
 
314 aa  235  8e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  49.28 
 
 
302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1131  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  51.19 
 
 
297 aa  233  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  44.44 
 
 
307 aa  232  6e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  45.36 
 
 
305 aa  225  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  47.92 
 
 
308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3329  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  47.55 
 
 
283 aa  223  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4034  LmbE-like protein  50.86 
 
 
308 aa  221  7e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4109  LmbE family protein  50.86 
 
 
308 aa  221  7e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  45.64 
 
 
323 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3908  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidedeacetylase  44.98 
 
 
282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4264  LmbE family protein  50.17 
 
 
308 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3763  LmbE family protein  47.12 
 
 
314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1157  LmbE family protein  44.95 
 
 
302 aa  212  5.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  44.92 
 
 
304 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  42.67 
 
 
296 aa  205  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.194637 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  45.16 
 
 
361 aa  196  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11195  N-acetyl-1-D-myo-inosityl-2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside deacetylase mshB  48.17 
 
 
303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6362  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  41.32 
 
 
355 aa  175  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.797199  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  39.44 
 
 
276 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  44.69 
 
 
271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  36.14 
 
 
288 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  39.31 
 
 
484 aa  144  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0794  LmbE family protein  38.89 
 
 
331 aa  142  5e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4309  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  44.8 
 
 
293 aa  142  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.414925  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  41.67 
 
 
306 aa  141  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26080  uncharacterized LmbE-like protein  36.71 
 
 
369 aa  139  6e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  34.47 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  34.69 
 
 
304 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  36.75 
 
 
277 aa  128  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  34.13 
 
 
311 aa  125  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  35.02 
 
 
291 aa  125  7e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  45.57 
 
 
299 aa  123  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  41.57 
 
 
260 aa  122  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1101  LmbE family protein  34 
 
 
313 aa  119  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0911817  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1609  LmbE family protein  34.6 
 
 
297 aa  119  7e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  33.11 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  34.01 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  33.55 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  33.22 
 
 
293 aa  116  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  37.83 
 
 
274 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  34.34 
 
 
312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  34.21 
 
 
316 aa  115  7.999999999999999e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  35.15 
 
 
299 aa  115  7.999999999999999e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  33.99 
 
 
295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  33.78 
 
 
303 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  34.01 
 
 
328 aa  113  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  31.63 
 
 
303 aa  113  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  32.55 
 
 
309 aa  112  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  33.33 
 
 
299 aa  112  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  32.67 
 
 
300 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  31.79 
 
 
294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  33.48 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  34.94 
 
 
463 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  31.97 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  32.99 
 
 
288 aa  110  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  32.76 
 
 
287 aa  109  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2744  LmbE family protein  33.69 
 
 
253 aa  109  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  31.31 
 
 
290 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11830  uncharacterized LmbE-like protein  39.08 
 
 
268 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  30.19 
 
 
359 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  31.58 
 
 
287 aa  106  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0942  mycothiol conjugate amidase Mca  33.9 
 
 
295 aa  106  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  31.97 
 
 
290 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  31.97 
 
 
290 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  31.97 
 
 
290 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  31.63 
 
 
291 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  31.05 
 
 
291 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  30.33 
 
 
289 aa  102  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0096  mycothiol conjugate amidase Mca  33.56 
 
 
292 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1717  LmbE family protein  32.47 
 
 
265 aa  99.8  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264749  normal  0.141737 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  31.33 
 
 
298 aa  99  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2633  mycothiol conjugate amidase Mca  31.88 
 
 
293 aa  98.2  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342297  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  30.3 
 
 
290 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1241  mycothiol conjugate amidase Mca  33.66 
 
 
301 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000367029 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05100  uncharacterized LmbE-like protein  30.5 
 
 
330 aa  96.7  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34779  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1169  LmbE family protein  33.33 
 
 
301 aa  95.5  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.805763  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  32.27 
 
 
238 aa  92.8  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0963  LmbE family protein  37.82 
 
 
408 aa  89.4  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.871469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7629  conserved hypothetical protein LmbE  31.8 
 
 
263 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  32.32 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  30.8 
 
 
272 aa  83.2  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25150  uncharacterized LmbE-like protein  33.74 
 
 
276 aa  82.4  0.000000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  30.42 
 
 
231 aa  80.9  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0008  LmbE family protein  30.51 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00173009  normal  0.123538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4220  conserved hypothetical protein LmbE  32.28 
 
 
273 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270991  hitchhiker  0.000751351 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  30.43 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1564  LmbE family protein  32.86 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  28.51 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  33.62 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  36.3 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>