136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1717 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1717  LmbE family protein  100 
 
 		 265 aa  540  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264749  normal  0.141737 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  40.84 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7629  conserved hypothetical protein LmbE  44.32 
 
 		 263 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  43.17 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  41.43 
 
 		 277 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  40.5 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25150  uncharacterized LmbE-like protein  42.64 
 
 		 276 aa  149  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  38.46 
 
 		 292 aa  149  5e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  36.97 
 
 		 308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  40.94 
 
 		 271 aa  139  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  39.02 
 
 		 286 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  34.32 
 
 		 302 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3763  LmbE family protein  36.46 
 
 		 314 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  35.56 
 
 		 294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  32.95 
 
 		 288 aa  129  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  34.5 
 
 		 323 aa  128  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4220  conserved hypothetical protein LmbE  38.13 
 
 		 273 aa  128  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270991  hitchhiker  0.000751351 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1131  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  35 
 
 		 297 aa  126  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3908  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidedeacetylase  36.04 
 
 		 282 aa  125  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  35.34 
 
 		 295 aa  123  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  36.36 
 
 		 296 aa  122  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194637 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1564  LmbE family protein  39.68 
 
 		 249 aa  121  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  35.98 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  36.36 
 
 		 302 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  34.63 
 
 		 268 aa  119  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  32.42 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  32.4 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  33.73 
 
 		 316 aa  115  6e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  33.67 
 
 		 314 aa  113  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2063  LmbE family protein  35 
 
 		 255 aa  112  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.621091  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2066  LmbE family protein  42.64 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.788335  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  32.82 
 
 		 290 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  32.82 
 
 		 290 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  32.82 
 
 		 290 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  31.69 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  33.2 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  32.98 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  33.21 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0096  mycothiol conjugate amidase Mca  31.67 
 
 		 292 aa  106  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  32.24 
 
 		 361 aa  103  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  30.38 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  31.15 
 
 		 293 aa  102  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  30.8 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0942  mycothiol conjugate amidase Mca  33.47 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  32.47 
 
 		 283 aa  99.8  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  30.53 
 
 		 290 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  30.74 
 
 		 294 aa  98.6  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  37.91 
 
 		 309 aa  98.6  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  29.22 
 
 		 274 aa  98.6  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1146  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  31.67 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0802505  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  30.89 
 
 		 290 aa  97.8  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  29.33 
 
 		 304 aa  98.2  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1432  LmbE family protein  40.91 
 
 		 275 aa  98.6  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.886775 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  29.74 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1157  LmbE family protein  31.99 
 
 		 302 aa  97.1  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103463  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1101  LmbE family protein  30.34 
 
 		 313 aa  96.7  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0911817  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  38.31 
 
 		 299 aa  96.3  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  29.62 
 
 		 303 aa  96.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  29.87 
 
 		 271 aa  96.3  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  30.38 
 
 		 293 aa  95.9  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6362  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  32.13 
 
 		 355 aa  95.9  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.797199  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  36.05 
 
 		 311 aa  95.9  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  31.21 
 
 		 287 aa  95.5  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4034  LmbE-like protein  34.86 
 
 		 308 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4109  LmbE family protein  34.86 
 
 		 308 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  31.66 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  31.05 
 
 		 289 aa  94.4  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  31.32 
 
 		 359 aa  94  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4264  LmbE family protein  34.51 
 
 		 308 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2633  mycothiol conjugate amidase Mca  31.23 
 
 		 293 aa  92  9e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342297  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  31.15 
 
 		 287 aa  92  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  31.37 
 
 		 306 aa  91.3  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1609  LmbE family protein  33.47 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11830  uncharacterized LmbE-like protein  38.07 
 
 		 268 aa  91.3  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  29.62 
 
 		 299 aa  91.3  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  29.66 
 
 		 309 aa  90.5  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  30.21 
 
 		 299 aa  90.1  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  29.62 
 
 		 288 aa  89.7  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1241  mycothiol conjugate amidase Mca  31.25 
 
 		 301 aa  89.7  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000367029 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  29 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  29.15 
 
 		 291 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  31.13 
 
 		 298 aa  87  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26080  uncharacterized LmbE-like protein  29.08 
 
 		 369 aa  85.9  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05100  uncharacterized LmbE-like protein  30.19 
 
 		 330 aa  85.5  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34779  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  29.46 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3329  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  31.6 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  30.21 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1169  LmbE family protein  31.66 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.805763  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  27.57 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  29.48 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  29.58 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4309  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  42.33 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.414925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  33.53 
 
 		 484 aa  70.1  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  33.33 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2744  LmbE family protein  27.03 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2672  LmbE family protein  32.91 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  27.31 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0963  LmbE family protein  27.6 
 
 		 408 aa  62.4  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.871469  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0794  LmbE family protein  27.93 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  33.09 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>