262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0368 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  100 
 
 		 218 aa  446  1.0000000000000001e-124  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  44.1 
 
 		 244 aa  166  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0008  LmbE family protein  42.79 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00173009  normal  0.123538 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2672  LmbE family protein  38.78 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  31.73 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  31.73 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  31.73 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  31.28 
 
 		 227 aa  95.1  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  33.68 
 
 		 221 aa  94.7  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  33.68 
 
 		 221 aa  94.7  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  30.61 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  33.33 
 
 		 238 aa  90.1  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  32.98 
 
 		 217 aa  89.4  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  31.91 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  30.21 
 
 		 221 aa  84.7  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  31.38 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  29.79 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  29.79 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3179  LmbE family protein  29.26 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3183  hypothetical protein  28.72 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000002506  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  29.79 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  28.72 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  28.72 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  27.24 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  34.81 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  30.08 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1423  LmbE family protein  31.71 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  27.61 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3268  hypothetical protein  28.19 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000289968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3241  hypothetical protein  28.19 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000243018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3524  hypothetical protein  28.19 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3484  hypothetical protein  28.19 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  31.68 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  28.69 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  24 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  34.39 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2880  LmbE-like protein  29.69 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  33.16 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  30.35 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  28.03 
 
 		 260 aa  71.6  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  33.99 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  33.56 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  25.5 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  31.79 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  27.03 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  33.09 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  33.76 
 
 		 303 aa  68.6  0.00000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  38.58 
 
 		 248 aa  68.2  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  23 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  29.03 
 
 		 484 aa  68.2  0.00000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1609  LmbE family protein  33.77 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  27.85 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  34.02 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  32.16 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  32.28 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  28.33 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  31.11 
 
 		 299 aa  67  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  30.57 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  28.33 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0096  mycothiol conjugate amidase Mca  32.81 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  29.44 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1416  LmbE family protein  31.69 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26080  uncharacterized LmbE-like protein  32.35 
 
 		 369 aa  65.9  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  27.23 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  31.14 
 
 		 302 aa  65.1  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  30.53 
 
 		 316 aa  65.1  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2706  LmbE family protein  35.04 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  29.65 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10328  hypothetical protein  31.12 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  29.38 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  33.76 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  31.61 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2878  LmbE family protein  34.38 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  27.03 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4036  hypothetical protein  27.09 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  34.16 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  27.65 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  31.37 
 
 		 328 aa  62.4  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  28.66 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  34.18 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  32.32 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  31.65 
 
 		 323 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  30.54 
 
 		 463 aa  62  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1823  LmbE family protein  36.36 
 
 		 258 aa  62  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.318027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  30.97 
 
 		 308 aa  62  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0611  LmbE family protein  25.77 
 
 		 569 aa  61.6  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  32.03 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  28.33 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  38.21 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  33.33 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2604  LmbE family protein  34.07 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849278 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  32.91 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  29.47 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  32.91 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  32.91 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11195  N-acetyl-1-D-myo-inosityl-2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside deacetylase mshB  32.24 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  29.69 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  32.7 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  29.05 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  29.75 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>