181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3036 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  100 
 
 
302 aa  609  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  72.09 
 
 
302 aa  438  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1131  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  69.42 
 
 
297 aa  366  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  61.2 
 
 
286 aa  345  6e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  60.33 
 
 
323 aa  342  5e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  58.67 
 
 
292 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  56.77 
 
 
305 aa  322  5e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  58.28 
 
 
294 aa  315  9e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  56.95 
 
 
308 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3908  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidedeacetylase  57.29 
 
 
282 aa  310  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  56.07 
 
 
314 aa  308  9e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3763  LmbE family protein  56.86 
 
 
314 aa  297  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  49.34 
 
 
307 aa  278  6e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  54.51 
 
 
296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.194637 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1157  LmbE family protein  52.09 
 
 
302 aa  264  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  51.8 
 
 
304 aa  260  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  54.31 
 
 
268 aa  256  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  50.66 
 
 
283 aa  252  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1146  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  49.84 
 
 
297 aa  230  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0802505  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  47.37 
 
 
284 aa  226  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  47.06 
 
 
284 aa  226  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  47.81 
 
 
361 aa  219  5e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4034  LmbE-like protein  45.67 
 
 
308 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4109  LmbE family protein  45.67 
 
 
308 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4264  LmbE family protein  45.33 
 
 
308 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6362  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  43.75 
 
 
355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.797199  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  40.39 
 
 
288 aa  188  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11195  N-acetyl-1-D-myo-inosityl-2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside deacetylase mshB  42.62 
 
 
303 aa  182  6e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3329  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  42.95 
 
 
283 aa  178  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  40.84 
 
 
288 aa  169  7e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  40.58 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  41.37 
 
 
299 aa  163  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  38.41 
 
 
303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  38.59 
 
 
288 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  41.37 
 
 
295 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  38.03 
 
 
303 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  38.36 
 
 
277 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  40.72 
 
 
309 aa  156  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  40.66 
 
 
289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  37.38 
 
 
312 aa  152  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4309  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  45.49 
 
 
293 aa  152  8e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.414925  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  38.85 
 
 
291 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  38.59 
 
 
290 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  38.59 
 
 
290 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  38.59 
 
 
290 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  39.87 
 
 
316 aa  150  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  38.06 
 
 
291 aa  150  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  37.83 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  40.57 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  40 
 
 
328 aa  147  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  37.37 
 
 
291 aa  145  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  36.31 
 
 
290 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  36.42 
 
 
287 aa  145  9e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  40.27 
 
 
306 aa  142  7e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  36.84 
 
 
294 aa  142  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1101  LmbE family protein  37.1 
 
 
313 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0911817  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  40.33 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  37.66 
 
 
295 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0096  mycothiol conjugate amidase Mca  37.06 
 
 
292 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  39.57 
 
 
300 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  34.19 
 
 
359 aa  139  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  34.8 
 
 
287 aa  138  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  36.23 
 
 
484 aa  137  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26080  uncharacterized LmbE-like protein  44.04 
 
 
369 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  37.6 
 
 
309 aa  136  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1717  LmbE family protein  34.32 
 
 
265 aa  135  8e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264749  normal  0.141737 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  35.71 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  36.51 
 
 
463 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  36.6 
 
 
311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0942  mycothiol conjugate amidase Mca  40.13 
 
 
295 aa  132  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  36.22 
 
 
290 aa  133  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1609  LmbE family protein  38.37 
 
 
297 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  38.13 
 
 
298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2633  mycothiol conjugate amidase Mca  38.39 
 
 
293 aa  129  7.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342297  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  30.48 
 
 
304 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05100  uncharacterized LmbE-like protein  35.56 
 
 
330 aa  122  5e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34779  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1169  LmbE family protein  35.81 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.805763  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  39.13 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  31.39 
 
 
271 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11830  uncharacterized LmbE-like protein  41.82 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1241  mycothiol conjugate amidase Mca  35.76 
 
 
301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000367029 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  32.79 
 
 
260 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0794  LmbE family protein  32.9 
 
 
331 aa  108  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  33.19 
 
 
299 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0963  LmbE family protein  41.15 
 
 
408 aa  104  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.871469  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2744  LmbE family protein  31.54 
 
 
253 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  34.18 
 
 
274 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  39.75 
 
 
272 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7629  conserved hypothetical protein LmbE  33.45 
 
 
263 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2066  LmbE family protein  37.41 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.788335  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  32.28 
 
 
272 aa  92  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4220  conserved hypothetical protein LmbE  36.25 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270991  hitchhiker  0.000751351 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25150  uncharacterized LmbE-like protein  33.21 
 
 
276 aa  82  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2063  LmbE family protein  32.6 
 
 
255 aa  78.2  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.621091  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  32.64 
 
 
238 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  38.67 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1564  LmbE family protein  32.96 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  32.83 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  30.08 
 
 
231 aa  69.3  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  33.33 
 
 
220 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>