250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4435 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  100 
 
 		 244 aa  490  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  61.57 
 
 		 243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  57.51 
 
 		 239 aa  263  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  60.43 
 
 		 239 aa  263  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  57.08 
 
 		 239 aa  259  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  54.62 
 
 		 240 aa  238  9e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  49.38 
 
 		 258 aa  231  6e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  51.05 
 
 		 259 aa  230  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  42.24 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14910  uncharacterized LmbE-like protein  48.28 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  43.7 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1963  LmbE family protein  44.26 
 
 		 245 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0119223  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  40.49 
 
 		 242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  41.92 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  36.56 
 
 		 231 aa  151  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14320  uncharacterized LmbE-like protein  43.46 
 
 		 240 aa  151  8e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00973186  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4797  LmbE family protein  48.47 
 
 		 239 aa  150  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.861098 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17590  uncharacterized LmbE-like protein  42.73 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134633  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  40.98 
 
 		 245 aa  142  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2706  LmbE family protein  40.51 
 
 		 256 aa  142  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2604  LmbE family protein  41.13 
 
 		 241 aa  141  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849278 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  39.39 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  39.83 
 
 		 244 aa  138  7.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0084  hypothetical protein  40.41 
 
 		 243 aa  134  9e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2878  LmbE family protein  38.33 
 
 		 246 aa  132  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  37.37 
 
 		 237 aa  131  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  37.89 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  36.84 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  34.96 
 
 		 227 aa  125  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3918  LmbE family protein  37.23 
 
 		 242 aa  122  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4038  conserved hypothetical protein LmbE  40.26 
 
 		 243 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  33.48 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  33.33 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3452  LmbE family protein  41.18 
 
 		 240 aa  105  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  35.38 
 
 		 423 aa  96.3  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  29.9 
 
 		 213 aa  88.6  9e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2405  LmbE family protein  31.76 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  35.56 
 
 		 309 aa  86.3  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  34.47 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  32.49 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  35.36 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  32.18 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  31.19 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  32.65 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  32.65 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  32.49 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  36.36 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3179  LmbE family protein  31.47 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  28.14 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  34.5 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  28.14 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  28.14 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3183  hypothetical protein  30.77 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000002506  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0589  LmbE family protein  37.5 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.154611  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  30.96 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  30.96 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  32.71 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  31.28 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  30.77 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  27.59 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  30.77 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  30.1 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  34.31 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  29.61 
 
 		 220 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3484  hypothetical protein  32.31 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3268  hypothetical protein  32.31 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000289968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3241  hypothetical protein  32.31 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000243018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3524  hypothetical protein  32.31 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123177  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  31.28 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  28.38 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  26.8 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  26.63 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  28.11 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2080  LmbE family protein  31.65 
 
 		 281 aa  72  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0263313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  28.34 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  28.15 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  30.82 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  27.81 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  28.57 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  33.67 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  28.34 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  28.34 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  28.34 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  28.34 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  28.34 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  27.78 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0680  LmbE family protein  32.46 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  28.21 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1217  LmbE family protein  31.22 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  27.81 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  29.2 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  27.27 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  27.96 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  30.04 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  31.13 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  33.56 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  33.79 
 
 		 308 aa  65.1  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  29.79 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  30.25 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  27.23 
 
 		 234 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>