149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3459 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  100 
 
 		 307 aa  625  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  66.22 
 
 		 305 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  62.75 
 
 		 314 aa  380  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  52.56 
 
 		 296 aa  293  3e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194637 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  52.4 
 
 		 292 aa  279  3e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  51.86 
 
 		 294 aa  278  6e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  49.34 
 
 		 302 aa  278  6e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1131  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  52.38 
 
 		 297 aa  278  7e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  48.86 
 
 		 323 aa  276  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  50.87 
 
 		 286 aa  271  8.000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  51.35 
 
 		 308 aa  271  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  48.03 
 
 		 302 aa  266  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3763  LmbE family protein  50 
 
 		 314 aa  251  7e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3908  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidedeacetylase  47.75 
 
 		 282 aa  251  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1157  LmbE family protein  48.84 
 
 		 302 aa  247  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  44.44 
 
 		 283 aa  232  7.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  44.67 
 
 		 268 aa  220  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  45.33 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1146  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  44.41 
 
 		 297 aa  211  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0802505  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  44.15 
 
 		 284 aa  210  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  45.91 
 
 		 304 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  45.02 
 
 		 361 aa  202  8e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4034  LmbE-like protein  43.39 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4109  LmbE family protein  43.39 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4264  LmbE family protein  43.39 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6362  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  43.09 
 
 		 355 aa  192  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.797199  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  37.97 
 
 		 288 aa  179  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3329  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  41.2 
 
 		 283 aa  166  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11195  N-acetyl-1-D-myo-inosityl-2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside deacetylase mshB  44.11 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  38.26 
 
 		 359 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  38.72 
 
 		 289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  37.63 
 
 		 291 aa  152  5.9999999999999996e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  37.75 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  37.75 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  37.75 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  37.46 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  36.91 
 
 		 288 aa  149  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  36.63 
 
 		 293 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  36.58 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  37.76 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  34.55 
 
 		 291 aa  145  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  36.21 
 
 		 312 aa  145  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  36.52 
 
 		 294 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  36.33 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  34.78 
 
 		 303 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  35.91 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  36.75 
 
 		 295 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  34.46 
 
 		 309 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  36.05 
 
 		 290 aa  139  6e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  38.26 
 
 		 328 aa  139  7e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  36.18 
 
 		 293 aa  139  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  36.12 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  36.7 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  35.02 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05100  uncharacterized LmbE-like protein  32.62 
 
 		 330 aa  133  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34779  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  35.84 
 
 		 303 aa  133  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  34.65 
 
 		 300 aa  132  7.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  33.44 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4309  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  50 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.414925  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0096  mycothiol conjugate amidase Mca  35.37 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  34.23 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1241  mycothiol conjugate amidase Mca  34.64 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000367029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  32.76 
 
 		 276 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1101  LmbE family protein  36.54 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0911817  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  33.45 
 
 		 277 aa  125  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0942  mycothiol conjugate amidase Mca  36.05 
 
 		 295 aa  125  9e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  33.45 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  33.77 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26080  uncharacterized LmbE-like protein  41.4 
 
 		 369 aa  123  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  33.78 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  44.17 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1717  LmbE family protein  32.42 
 
 		 265 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264749  normal  0.141737 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2633  mycothiol conjugate amidase Mca  35.77 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342297  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1169  LmbE family protein  34.77 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.805763  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  40.33 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1609  LmbE family protein  36.43 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  34.16 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  43.21 
 
 		 484 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  30.33 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  37.37 
 
 		 463 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0963  LmbE family protein  38.86 
 
 		 408 aa  99.4  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.871469  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  34.95 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  35.62 
 
 		 260 aa  97.4  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11830  uncharacterized LmbE-like protein  38.55 
 
 		 268 aa  95.1  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2744  LmbE family protein  31 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  35.8 
 
 		 272 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  30.86 
 
 		 274 aa  88.6  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0794  LmbE family protein  33.33 
 
 		 331 aa  85.9  8e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7629  conserved hypothetical protein LmbE  38.04 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  39.13 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  27.34 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  29.35 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4220  conserved hypothetical protein LmbE  30.8 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270991  hitchhiker  0.000751351 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  28.98 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2063  LmbE family protein  31.89 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.621091  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  28.63 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  31.33 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1432  LmbE family protein  38.93 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.886775 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1564  LmbE family protein  37.33 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2066  LmbE family protein  33.73 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.788335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>