189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4034 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4034  LmbE-like protein  100 
 
 
308 aa  620  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4109  LmbE family protein  100 
 
 
308 aa  620  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4264  LmbE family protein  99.35 
 
 
308 aa  618  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  67.97 
 
 
284 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  67.03 
 
 
284 aa  373  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11195  N-acetyl-1-D-myo-inosityl-2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside deacetylase mshB  60.2 
 
 
303 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1146  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  52.01 
 
 
297 aa  253  3e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0802505  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  49.82 
 
 
292 aa  251  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  50.68 
 
 
294 aa  247  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  51.62 
 
 
268 aa  245  6.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  50.86 
 
 
283 aa  236  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  48.35 
 
 
302 aa  231  9e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3329  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  50.52 
 
 
283 aa  231  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1131  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  48.12 
 
 
297 aa  230  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  46.49 
 
 
296 aa  230  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.194637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  48.78 
 
 
308 aa  227  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  45.67 
 
 
302 aa  225  8e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3908  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidedeacetylase  47.02 
 
 
282 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  46.48 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  45.08 
 
 
323 aa  215  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3763  LmbE family protein  49.31 
 
 
314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  45.76 
 
 
314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1157  LmbE family protein  44.15 
 
 
302 aa  210  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103463  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  43.81 
 
 
305 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  43.39 
 
 
307 aa  203  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  42.52 
 
 
304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4309  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  48.51 
 
 
293 aa  178  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.414925  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  40.73 
 
 
361 aa  169  8e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6362  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  38.92 
 
 
355 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.797199  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  40.24 
 
 
276 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  32.13 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  40.61 
 
 
306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  40.07 
 
 
271 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  31.86 
 
 
304 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  36 
 
 
287 aa  125  8.000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0794  LmbE family protein  35.96 
 
 
331 aa  123  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  37.8 
 
 
287 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  33.77 
 
 
295 aa  119  7.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  34.01 
 
 
288 aa  118  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  32.12 
 
 
271 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  35.88 
 
 
463 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  34.05 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  43.02 
 
 
484 aa  115  8.999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  34.29 
 
 
277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26080  uncharacterized LmbE-like protein  43.96 
 
 
369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  34.38 
 
 
293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  33 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  34.32 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  32.65 
 
 
303 aa  114  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  32.21 
 
 
311 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  34.64 
 
 
288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0942  mycothiol conjugate amidase Mca  33.44 
 
 
295 aa  112  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  34.19 
 
 
295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  31.35 
 
 
291 aa  110  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  34 
 
 
300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  39.11 
 
 
309 aa  109  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  33.13 
 
 
359 aa  108  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0096  mycothiol conjugate amidase Mca  34.64 
 
 
292 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  34.52 
 
 
272 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  33.56 
 
 
309 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1609  LmbE family protein  35.6 
 
 
297 aa  107  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  32.17 
 
 
294 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  31.91 
 
 
274 aa  105  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  33.33 
 
 
291 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  31.51 
 
 
260 aa  103  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2744  LmbE family protein  32.37 
 
 
253 aa  102  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  31.73 
 
 
289 aa  102  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  31.95 
 
 
299 aa  101  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  35.86 
 
 
316 aa  101  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1717  LmbE family protein  34.86 
 
 
265 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264749  normal  0.141737 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  31.46 
 
 
299 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  34.25 
 
 
291 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7629  conserved hypothetical protein LmbE  35.66 
 
 
263 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  32.58 
 
 
290 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  32.58 
 
 
290 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  32.58 
 
 
290 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  30.67 
 
 
290 aa  97.8  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2633  mycothiol conjugate amidase Mca  32.08 
 
 
293 aa  97.4  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342297  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  31.15 
 
 
303 aa  96.7  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1101  LmbE family protein  31.13 
 
 
313 aa  95.5  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0911817  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  31.56 
 
 
298 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  41.94 
 
 
272 aa  94.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  30.94 
 
 
328 aa  92.8  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  34.39 
 
 
299 aa  92.8  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  32.3 
 
 
290 aa  89  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0008  LmbE family protein  32.2 
 
 
240 aa  89  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00173009  normal  0.123538 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1169  LmbE family protein  31.37 
 
 
301 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.805763  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11830  uncharacterized LmbE-like protein  33.48 
 
 
268 aa  88.2  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05100  uncharacterized LmbE-like protein  31.99 
 
 
330 aa  88.6  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34779  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0963  LmbE family protein  35.75 
 
 
408 aa  85.9  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.871469  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1564  LmbE family protein  30.98 
 
 
249 aa  82  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  31.09 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1241  mycothiol conjugate amidase Mca  27.63 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000367029 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2066  LmbE family protein  35.69 
 
 
260 aa  79  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.788335  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  31.58 
 
 
244 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25150  uncharacterized LmbE-like protein  35.64 
 
 
276 aa  77.8  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  28.02 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  33.62 
 
 
250 aa  74.3  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  27.35 
 
 
218 aa  70.5  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  28.07 
 
 
229 aa  68.2  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>