179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0868 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  100 
 
 		 287 aa  584  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  94.06 
 
 		 287 aa  550  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  70.63 
 
 		 295 aa  417  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  68.75 
 
 		 293 aa  415  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  67.93 
 
 		 291 aa  410  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  69.34 
 
 		 293 aa  407  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  67.48 
 
 		 294 aa  398  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  68.09 
 
 		 309 aa  395  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  64.73 
 
 		 312 aa  388  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0096  mycothiol conjugate amidase Mca  67.25 
 
 		 292 aa  386  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  70.32 
 
 		 303 aa  381  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  66.78 
 
 		 303 aa  368  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  66.2 
 
 		 290 aa  365  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  65.97 
 
 		 300 aa  366  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  61.67 
 
 		 316 aa  366  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  61.7 
 
 		 288 aa  362  3e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  67.13 
 
 		 298 aa  361  9e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  62.9 
 
 		 290 aa  360  1e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  62.9 
 
 		 290 aa  360  1e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  62.9 
 
 		 290 aa  360  1e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0942  mycothiol conjugate amidase Mca  63.41 
 
 		 295 aa  356  1.9999999999999998e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  59.36 
 
 		 299 aa  353  2.9999999999999997e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  61.97 
 
 		 289 aa  350  1e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1101  LmbE family protein  61.69 
 
 		 313 aa  349  2e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0911817  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  60.35 
 
 		 295 aa  349  3e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  63.67 
 
 		 328 aa  347  1e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  61.05 
 
 		 291 aa  346  2e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  59.01 
 
 		 288 aa  331  7.000000000000001e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1241  mycothiol conjugate amidase Mca  58.76 
 
 		 301 aa  329  3e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000367029 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  59.44 
 
 		 359 aa  328  8e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  60.49 
 
 		 291 aa  324  9e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  60 
 
 		 290 aa  319  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  54.86 
 
 		 303 aa  306  3e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1169  LmbE family protein  58.42 
 
 		 301 aa  304  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.805763  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2633  mycothiol conjugate amidase Mca  54.7 
 
 		 293 aa  298  6e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342297  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05100  uncharacterized LmbE-like protein  50.49 
 
 		 330 aa  269  5e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34779  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  38.57 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1609  LmbE family protein  40.35 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1157  LmbE family protein  38.36 
 
 		 302 aa  165  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103463  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  39.53 
 
 		 294 aa  156  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  38.31 
 
 		 305 aa  155  7e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  36.75 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  37.84 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  37.04 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  37.29 
 
 		 292 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  36.51 
 
 		 286 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  35.35 
 
 		 302 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  36.33 
 
 		 314 aa  138  8.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3908  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidedeacetylase  37.37 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  36.39 
 
 		 276 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  39.46 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  35.97 
 
 		 284 aa  125  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  35.5 
 
 		 284 aa  123  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1131  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  36.49 
 
 		 297 aa  122  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  34.78 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4264  LmbE family protein  37 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  34.49 
 
 		 309 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4034  LmbE-like protein  36.67 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4109  LmbE family protein  36.67 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6362  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  33.23 
 
 		 355 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.797199  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  33.99 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  41.14 
 
 		 299 aa  115  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  33.55 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3763  LmbE family protein  33.89 
 
 		 314 aa  112  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1146  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  34.84 
 
 		 297 aa  112  9e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0802505  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  33.33 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  33.56 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  34.01 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  32.01 
 
 		 283 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  31.94 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1717  LmbE family protein  31.56 
 
 		 265 aa  99.4  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264749  normal  0.141737 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  31.23 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11195  N-acetyl-1-D-myo-inosityl-2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside deacetylase mshB  41.18 
 
 		 303 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  39.24 
 
 		 260 aa  93.2  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  33.33 
 
 		 306 aa  92.8  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11830  uncharacterized LmbE-like protein  37.29 
 
 		 268 aa  91.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  36.84 
 
 		 272 aa  90.1  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  30.57 
 
 		 274 aa  89.4  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  39.63 
 
 		 272 aa  86.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26080  uncharacterized LmbE-like protein  36.08 
 
 		 369 aa  86.7  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  35.84 
 
 		 463 aa  85.5  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0794  LmbE family protein  33.33 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  36.52 
 
 		 484 aa  83.2  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  27.82 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3329  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  29.51 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0963  LmbE family protein  34.72 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.871469  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2880  LmbE-like protein  31.96 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7629  conserved hypothetical protein LmbE  39.1 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4309  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  42.01 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.414925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2744  LmbE family protein  29.59 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  30.07 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  26.07 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1564  LmbE family protein  31.97 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25150  uncharacterized LmbE-like protein  30.57 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4220  conserved hypothetical protein LmbE  36.54 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270991  hitchhiker  0.000751351 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  28.92 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  30.68 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  29.81 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  30.68 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  29.81 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>