220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1904 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  100 
 
 
271 aa  546  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  71.22 
 
 
276 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  54.04 
 
 
277 aa  254  8e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  43.37 
 
 
292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  46.67 
 
 
286 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  40.77 
 
 
323 aa  176  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  38.28 
 
 
288 aa  169  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  41.46 
 
 
294 aa  168  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  37.87 
 
 
302 aa  165  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  40.78 
 
 
272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  40.78 
 
 
308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  41.01 
 
 
283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1717  LmbE family protein  40.94 
 
 
265 aa  161  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264749  normal  0.141737 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  40.54 
 
 
287 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  41.39 
 
 
268 aa  159  6e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1131  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  38.7 
 
 
297 aa  159  7e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3908  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidedeacetylase  40.21 
 
 
282 aa  156  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  39.46 
 
 
287 aa  152  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  39.53 
 
 
312 aa  151  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3763  LmbE family protein  37.01 
 
 
314 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  37.29 
 
 
303 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  37.76 
 
 
295 aa  150  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  38.19 
 
 
299 aa  149  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  40.33 
 
 
302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  37.59 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  36.21 
 
 
296 aa  146  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.194637 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0096  mycothiol conjugate amidase Mca  37.04 
 
 
292 aa  146  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  35.53 
 
 
293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  37.71 
 
 
304 aa  145  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  37.15 
 
 
303 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  36.3 
 
 
291 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  34.24 
 
 
359 aa  143  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  36.55 
 
 
295 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1157  LmbE family protein  36.96 
 
 
302 aa  142  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103463  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  35.59 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0942  mycothiol conjugate amidase Mca  35.91 
 
 
295 aa  141  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  36.99 
 
 
305 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4034  LmbE-like protein  40.21 
 
 
308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  35.17 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  36.68 
 
 
309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4109  LmbE family protein  40.21 
 
 
308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  34.24 
 
 
289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  35.4 
 
 
291 aa  139  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4264  LmbE family protein  39.86 
 
 
308 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  35.62 
 
 
290 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  35.62 
 
 
290 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  35.62 
 
 
290 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  35.4 
 
 
316 aa  138  7.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05100  uncharacterized LmbE-like protein  35.76 
 
 
330 aa  138  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34779  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  35.93 
 
 
294 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1146  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  38.82 
 
 
297 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0802505  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  35.67 
 
 
300 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  34.35 
 
 
299 aa  135  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  36.79 
 
 
284 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  36.18 
 
 
288 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  34.93 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  34.13 
 
 
311 aa  133  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2633  mycothiol conjugate amidase Mca  33.9 
 
 
293 aa  132  6e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342297  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  35.27 
 
 
299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  33.33 
 
 
309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  32.88 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  34.14 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  35.06 
 
 
361 aa  130  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1609  LmbE family protein  38.57 
 
 
297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  37.06 
 
 
284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  34.27 
 
 
304 aa  129  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  37.11 
 
 
314 aa  128  8.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1101  LmbE family protein  36.24 
 
 
313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0911817  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1241  mycothiol conjugate amidase Mca  34.24 
 
 
301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000367029 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3329  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  37.02 
 
 
283 aa  125  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  33.92 
 
 
328 aa  125  9e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  34.11 
 
 
274 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6362  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  35.03 
 
 
355 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.797199  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25150  uncharacterized LmbE-like protein  39.63 
 
 
276 aa  123  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  32.19 
 
 
307 aa  122  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  36 
 
 
298 aa  122  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  39 
 
 
306 aa  121  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7629  conserved hypothetical protein LmbE  38.58 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1169  LmbE family protein  34.13 
 
 
301 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.805763  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  37.84 
 
 
272 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2744  LmbE family protein  34.21 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  33.33 
 
 
271 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11830  uncharacterized LmbE-like protein  38.42 
 
 
268 aa  106  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0794  LmbE family protein  39.67 
 
 
331 aa  105  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1564  LmbE family protein  33.86 
 
 
249 aa  102  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4220  conserved hypothetical protein LmbE  35.51 
 
 
273 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270991  hitchhiker  0.000751351 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26080  uncharacterized LmbE-like protein  41.67 
 
 
369 aa  102  9e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  33.1 
 
 
260 aa  101  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  27.48 
 
 
283 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  36.84 
 
 
484 aa  95.1  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4309  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  42.01 
 
 
293 aa  92  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.414925  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0008  LmbE family protein  32.66 
 
 
240 aa  91.7  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00173009  normal  0.123538 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2063  LmbE family protein  33.08 
 
 
255 aa  90.9  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.621091  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  31.39 
 
 
238 aa  89  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  32.58 
 
 
244 aa  88.6  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  38.29 
 
 
463 aa  87.8  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11195  N-acetyl-1-D-myo-inosityl-2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside deacetylase mshB  39.01 
 
 
303 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0963  LmbE family protein  35.23 
 
 
408 aa  85.9  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.871469  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  33.33 
 
 
231 aa  85.1  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2066  LmbE family protein  35.25 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.788335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>