202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_08230 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  100 
 
 
295 aa  593  1e-169  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0942  mycothiol conjugate amidase Mca  75.68 
 
 
295 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  72.66 
 
 
291 aa  428  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2633  mycothiol conjugate amidase Mca  72.82 
 
 
293 aa  415  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342297  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  66.09 
 
 
289 aa  379  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  64.69 
 
 
293 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  62.54 
 
 
295 aa  358  5e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  62.24 
 
 
316 aa  354  1e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  63.54 
 
 
293 aa  350  1e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  60.56 
 
 
287 aa  350  2e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  67.37 
 
 
303 aa  349  3e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1101  LmbE family protein  61.51 
 
 
313 aa  349  3e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0911817  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  62.76 
 
 
294 aa  348  5e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  59.6 
 
 
291 aa  348  6e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  59.45 
 
 
312 aa  345  6e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  61.89 
 
 
309 aa  344  8.999999999999999e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  61.4 
 
 
290 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  61.4 
 
 
290 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  61.4 
 
 
290 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  60.35 
 
 
287 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  60.48 
 
 
299 aa  333  1e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  58.68 
 
 
291 aa  330  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0096  mycothiol conjugate amidase Mca  59.65 
 
 
292 aa  330  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  62.37 
 
 
303 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  58.8 
 
 
288 aa  326  3e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1241  mycothiol conjugate amidase Mca  58.31 
 
 
301 aa  325  8.000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000367029 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  63.19 
 
 
328 aa  322  5e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  61.27 
 
 
290 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  58.48 
 
 
359 aa  318  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1169  LmbE family protein  60 
 
 
301 aa  315  6e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.805763  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  56.79 
 
 
288 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  59.65 
 
 
290 aa  301  8.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  53.5 
 
 
303 aa  295  8e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  58.97 
 
 
298 aa  289  4e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  56.06 
 
 
300 aa  288  7e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05100  uncharacterized LmbE-like protein  52.9 
 
 
330 aa  286  2.9999999999999996e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34779  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  38.39 
 
 
323 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  41.37 
 
 
302 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1157  LmbE family protein  38.59 
 
 
302 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103463  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3908  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidedeacetylase  38.78 
 
 
282 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  37.46 
 
 
305 aa  149  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  39.07 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  39.66 
 
 
294 aa  146  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  37.88 
 
 
286 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  33.33 
 
 
288 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1609  LmbE family protein  36.46 
 
 
297 aa  142  9e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  37.58 
 
 
314 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  35.91 
 
 
307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  37.06 
 
 
308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1131  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  39.2 
 
 
297 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  35.77 
 
 
302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3763  LmbE family protein  36.13 
 
 
314 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  37.89 
 
 
361 aa  135  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  38.49 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  36.64 
 
 
271 aa  125  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  36.03 
 
 
296 aa  125  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.194637 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1717  LmbE family protein  35.34 
 
 
265 aa  123  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264749  normal  0.141737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  34.24 
 
 
276 aa  122  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6362  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  33.75 
 
 
355 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.797199  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  33.89 
 
 
284 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  34.15 
 
 
309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  38.13 
 
 
268 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  33.01 
 
 
304 aa  119  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  34.45 
 
 
284 aa  119  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  33.55 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1146  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  36.75 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0802505  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  34.24 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4264  LmbE family protein  32.8 
 
 
308 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  39.66 
 
 
299 aa  112  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4034  LmbE-like protein  33.77 
 
 
308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4109  LmbE family protein  33.77 
 
 
308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  35.79 
 
 
306 aa  109  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  33.33 
 
 
311 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  34.43 
 
 
274 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11195  N-acetyl-1-D-myo-inosityl-2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside deacetylase mshB  39.47 
 
 
303 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  39.74 
 
 
272 aa  95.1  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  30.24 
 
 
271 aa  92.8  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  34.16 
 
 
299 aa  90.9  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  31.68 
 
 
272 aa  90.1  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3329  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  28.96 
 
 
283 aa  90.1  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2744  LmbE family protein  28.36 
 
 
253 aa  86.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  30.61 
 
 
260 aa  86.7  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7629  conserved hypothetical protein LmbE  41.72 
 
 
263 aa  86.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26080  uncharacterized LmbE-like protein  34.27 
 
 
369 aa  86.3  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0963  LmbE family protein  35.75 
 
 
408 aa  85.5  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.871469  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  35.12 
 
 
463 aa  84.7  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11830  uncharacterized LmbE-like protein  37.57 
 
 
268 aa  83.2  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0794  LmbE family protein  29.44 
 
 
331 aa  79.7  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  37.06 
 
 
484 aa  78.2  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25150  uncharacterized LmbE-like protein  29.59 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1564  LmbE family protein  31.58 
 
 
249 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  26.75 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4309  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  40.61 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.414925  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  29.88 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2880  LmbE-like protein  29.43 
 
 
245 aa  69.3  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4220  conserved hypothetical protein LmbE  32.28 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270991  hitchhiker  0.000751351 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  32.1 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  29.88 
 
 
227 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  32.16 
 
 
218 aa  68.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  27.57 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>