183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0981 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  100 
 
 		 309 aa  630  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  69.82 
 
 		 295 aa  412  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  69.26 
 
 		 287 aa  404  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  68.18 
 
 		 293 aa  396  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  66.9 
 
 		 291 aa  387  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  68.09 
 
 		 287 aa  388  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  67.84 
 
 		 293 aa  380  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  68.84 
 
 		 303 aa  374  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  67.02 
 
 		 294 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  64.21 
 
 		 291 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  62.72 
 
 		 290 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  61.86 
 
 		 299 aa  365  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  62.72 
 
 		 290 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  62.72 
 
 		 290 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  65.61 
 
 		 303 aa  362  6e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  67.02 
 
 		 290 aa  361  8e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  67.72 
 
 		 328 aa  360  2e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  61.62 
 
 		 288 aa  357  9.999999999999999e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  64.6 
 
 		 300 aa  354  8.999999999999999e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  64.07 
 
 		 298 aa  354  1e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  62.9 
 
 		 288 aa  353  2e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  60.76 
 
 		 289 aa  353  2.9999999999999997e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  61.13 
 
 		 316 aa  345  6e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  61.89 
 
 		 295 aa  344  1e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1101  LmbE family protein  60.62 
 
 		 313 aa  340  2e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0911817  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  63.96 
 
 		 290 aa  339  4e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  59.23 
 
 		 312 aa  339  4e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0942  mycothiol conjugate amidase Mca  61.13 
 
 		 295 aa  338  5.9999999999999996e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0096  mycothiol conjugate amidase Mca  61.27 
 
 		 292 aa  333  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  60.28 
 
 		 291 aa  329  4e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  55.25 
 
 		 303 aa  322  7e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  57.64 
 
 		 359 aa  320  9.999999999999999e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2633  mycothiol conjugate amidase Mca  57.69 
 
 		 293 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342297  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1241  mycothiol conjugate amidase Mca  57.34 
 
 		 301 aa  309  5e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000367029 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1169  LmbE family protein  58.7 
 
 		 301 aa  296  3e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.805763  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05100  uncharacterized LmbE-like protein  48.72 
 
 		 330 aa  264  2e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34779  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1609  LmbE family protein  41.87 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  36.62 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  38.16 
 
 		 323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  38.57 
 
 		 305 aa  159  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  40.72 
 
 		 302 aa  156  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  41.69 
 
 		 294 aa  155  7e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  38.34 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  37.11 
 
 		 286 aa  150  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  37.13 
 
 		 302 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1157  LmbE family protein  37.09 
 
 		 302 aa  146  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103463  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3908  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidedeacetylase  37.79 
 
 		 282 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  34.46 
 
 		 307 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  35.76 
 
 		 309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  35.15 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  36.91 
 
 		 361 aa  126  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  34.93 
 
 		 276 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  36.68 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6362  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  33.75 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.797199  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  40.12 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1131  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  34.67 
 
 		 297 aa  116  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  33.78 
 
 		 308 aa  116  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  33.01 
 
 		 277 aa  115  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1146  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  36.45 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0802505  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  32.55 
 
 		 283 aa  112  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  34.36 
 
 		 296 aa  112  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194637 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  34.85 
 
 		 284 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  33.67 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  32.18 
 
 		 304 aa  109  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  34.53 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  32.24 
 
 		 304 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  32.65 
 
 		 268 aa  107  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4264  LmbE family protein  33.12 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4034  LmbE-like protein  33.22 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4109  LmbE family protein  33.22 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3763  LmbE family protein  32.44 
 
 		 314 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  37.43 
 
 		 306 aa  91.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1717  LmbE family protein  29.66 
 
 		 265 aa  90.5  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264749  normal  0.141737 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  31.34 
 
 		 272 aa  89.7  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2744  LmbE family protein  28.09 
 
 		 253 aa  88.6  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  37.89 
 
 		 274 aa  87  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11195  N-acetyl-1-D-myo-inosityl-2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside deacetylase mshB  38.8 
 
 		 303 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11830  uncharacterized LmbE-like protein  38.24 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  32.72 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0963  LmbE family protein  34.93 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.871469  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  34.19 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3329  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  28.8 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  35.91 
 
 		 463 aa  81.6  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25150  uncharacterized LmbE-like protein  30.69 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26080  uncharacterized LmbE-like protein  32.11 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  28.9 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  35.87 
 
 		 484 aa  77.8  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0794  LmbE family protein  31.84 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  33.99 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3334  hypothetical protein  31.25 
 
 		 930 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  28.83 
 
 		 283 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7629  conserved hypothetical protein LmbE  38.46 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  32.04 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2880  LmbE-like protein  31.15 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1564  LmbE family protein  29.8 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2487  LmbE family protein  36.41 
 
 		 797 aa  62.4  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1378  LmbE family protein  28 
 
 		 811 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.455016 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  29.27 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  30.43 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  29.27 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>