122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1124 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  100 
 
 		 463 aa  873    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  46.3 
 
 		 306 aa  180  5.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  42.36 
 
 		 361 aa  169  9e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26080  uncharacterized LmbE-like protein  41.82 
 
 		 369 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0794  LmbE family protein  39.75 
 
 		 331 aa  155  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0963  LmbE family protein  39.69 
 
 		 408 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.871469  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1157  LmbE family protein  35.2 
 
 		 302 aa  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103463  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  37.14 
 
 		 302 aa  140  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  33.82 
 
 		 302 aa  137  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  34.15 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  35.9 
 
 		 284 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  34.19 
 
 		 284 aa  127  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  35.65 
 
 		 286 aa  123  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  35.11 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  33.85 
 
 		 294 aa  117  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  34.29 
 
 		 268 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  37.16 
 
 		 304 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  34.94 
 
 		 283 aa  114  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  34.98 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3908  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidedeacetylase  37.98 
 
 		 282 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11830  uncharacterized LmbE-like protein  41.21 
 
 		 268 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4264  LmbE family protein  35.88 
 
 		 308 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  33.71 
 
 		 314 aa  110  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  40.91 
 
 		 308 aa  110  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4034  LmbE-like protein  35.88 
 
 		 308 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4109  LmbE family protein  35.88 
 
 		 308 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1131  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  35.69 
 
 		 297 aa  107  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  44.71 
 
 		 484 aa  103  6e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  32.96 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  33.46 
 
 		 276 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3763  LmbE family protein  32.06 
 
 		 314 aa  95.9  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  36.79 
 
 		 288 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  30.42 
 
 		 288 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  37.57 
 
 		 296 aa  91.3  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  32.12 
 
 		 277 aa  90.5  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11195  N-acetyl-1-D-myo-inosityl-2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside deacetylase mshB  38.02 
 
 		 303 aa  90.1  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  34.38 
 
 		 290 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  34.38 
 
 		 290 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  34.38 
 
 		 290 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1146  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  33.44 
 
 		 297 aa  89.7  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0802505  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  36.9 
 
 		 291 aa  89.4  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6362  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  33.54 
 
 		 355 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.797199  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2050  LmbE family protein  33.85 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  35.84 
 
 		 287 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2633  mycothiol conjugate amidase Mca  33.49 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342297  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  35.41 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  35.12 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  34.68 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  34.24 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  35.67 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  32.78 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  35.59 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  33.95 
 
 		 271 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  36.73 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  32.56 
 
 		 289 aa  82.4  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  34.74 
 
 		 303 aa  82.4  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0981  LmbE family protein  35.91 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  36.9 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  26.32 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1717  LmbE family protein  29.1 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264749  normal  0.141737 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  31.69 
 
 		 288 aa  79.3  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  36.31 
 
 		 299 aa  79.7  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  34.81 
 
 		 303 aa  79.3  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  35.07 
 
 		 359 aa  79.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1101  LmbE family protein  36.25 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0911817  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  30.77 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  33.53 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4309  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  38.32 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.414925  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0096  mycothiol conjugate amidase Mca  28.97 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3329  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  31.15 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  33.92 
 
 		 294 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  34.38 
 
 		 290 aa  76.3  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  34.52 
 
 		 328 aa  75.9  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  31.75 
 
 		 303 aa  76.3  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  34.52 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  31.43 
 
 		 274 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4667  LmbE family protein  32.43 
 
 		 290 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  36.71 
 
 		 311 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7629  conserved hypothetical protein LmbE  39.88 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1241  mycothiol conjugate amidase Mca  29.71 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000367029 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  35.22 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  31.91 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1169  LmbE family protein  33.65 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.805763  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0942  mycothiol conjugate amidase Mca  28.57 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05100  uncharacterized LmbE-like protein  29.86 
 
 		 330 aa  72.8  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.34779  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  32.37 
 
 		 238 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1609  LmbE family protein  30.99 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  33.33 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  30.68 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0008  LmbE family protein  29.65 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00173009  normal  0.123538 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  30.9 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  30.54 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0795  hypothetical protein  32.41 
 
 		 130 aa  58.9  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.774261 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2744  LmbE family protein  27.08 
 
 		 253 aa  59.3  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26070  hypothetical protein  42.2 
 
 		 138 aa  58.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2063  LmbE family protein  35.26 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.621091  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  45.33 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  30.6 
 
 		 272 aa  57  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  24.53 
 
 		 283 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0964  hypothetical protein  38.51 
 
 		 150 aa  55.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>