More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_19500 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  100 
 
 
484 aa  949    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  39.12 
 
 
292 aa  157  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3908  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidedeacetylase  39.25 
 
 
282 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  39.31 
 
 
283 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  37.93 
 
 
302 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  36.01 
 
 
314 aa  140  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  36.23 
 
 
302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  36.33 
 
 
286 aa  137  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1131  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  40.2 
 
 
297 aa  137  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  46.93 
 
 
268 aa  130  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  35.56 
 
 
323 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  34.55 
 
 
305 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  35.96 
 
 
294 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  46.99 
 
 
308 aa  127  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  38.81 
 
 
361 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  45.68 
 
 
304 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1157  LmbE family protein  35.71 
 
 
302 aa  123  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103463  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  44.44 
 
 
284 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26080  uncharacterized LmbE-like protein  47.16 
 
 
369 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3763  LmbE family protein  46.88 
 
 
314 aa  117  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  38.44 
 
 
306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  42.78 
 
 
284 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  34.44 
 
 
296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.194637 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  41.77 
 
 
299 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1146  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  35.86 
 
 
297 aa  111  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0802505  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  43.21 
 
 
307 aa  111  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3329  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  41.07 
 
 
283 aa  110  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1133  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  43.75 
 
 
170 aa  109  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  41.1 
 
 
271 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4309  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  46.19 
 
 
293 aa  107  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.414925  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  36.51 
 
 
288 aa  106  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  44.71 
 
 
463 aa  103  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4034  LmbE-like protein  43.02 
 
 
308 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.78 
 
 
174 aa  103  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4109  LmbE family protein  43.02 
 
 
308 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  38.89 
 
 
304 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4264  LmbE family protein  42.46 
 
 
308 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3100  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  43.31 
 
 
155 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  37.57 
 
 
276 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11195  N-acetyl-1-D-myo-inosityl-2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside deacetylase mshB  43.33 
 
 
303 aa  99.8  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6362  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  41.46 
 
 
355 aa  99.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.797199  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0794  LmbE family protein  42.37 
 
 
331 aa  99.8  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  37.08 
 
 
274 aa  93.2  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2695  flavin reductase domain-containing protein  42.14 
 
 
178 aa  92.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2164  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  36.84 
 
 
271 aa  92  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
393 aa  91.3  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  29.59 
 
 
293 aa  90.1  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.96 
 
 
177 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  37.84 
 
 
277 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  36.42 
 
 
293 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  35.53 
 
 
156 aa  89  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07280  mycothiol conjugate amidase Mca  31.49 
 
 
316 aa  89  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.608208 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  29.3 
 
 
303 aa  87.8  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0990  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.24 
 
 
164 aa  87.4  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  38.51 
 
 
186 aa  87  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3861  flavin reductase-like, FMN-binding  41.77 
 
 
214 aa  87  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.657973  normal  0.52723 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  30.81 
 
 
260 aa  86.7  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.1 
 
 
170 aa  86.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.65 
 
 
169 aa  85.9  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  36.77 
 
 
180 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5120  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.67 
 
 
163 aa  86.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.51 
 
 
186 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  29.8 
 
 
303 aa  85.5  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  37.72 
 
 
167 aa  85.9  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0963  LmbE family protein  40.41 
 
 
408 aa  85.5  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.871469  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  30.85 
 
 
288 aa  85.5  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1101  LmbE family protein  30.07 
 
 
313 aa  85.1  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0911817  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  36.77 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  35.71 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  37.65 
 
 
172 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  34.21 
 
 
156 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1886  LmbE family protein  37.43 
 
 
328 aa  84  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.63571 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  39.38 
 
 
172 aa  84  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  34.78 
 
 
204 aa  84  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  36.52 
 
 
287 aa  83.6  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0196  flavin reductase-like protein, FMN-binding  40.74 
 
 
162 aa  83.6  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.869968 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  35.98 
 
 
169 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  36.65 
 
 
309 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6997  flavin reductase-like, FMN-binding protein  41.72 
 
 
179 aa  83.2  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974297 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2035  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.13 
 
 
166 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2574  flavin reductase domain-containing protein  38.15 
 
 
181 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  38.65 
 
 
186 aa  82.4  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1079  mycothiol conjugate amidase Mca  34.02 
 
 
289 aa  82.4  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  37.5 
 
 
290 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  37.5 
 
 
290 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  37.5 
 
 
290 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  38.51 
 
 
170 aa  82  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.9 
 
 
155 aa  81.3  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6495  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.42 
 
 
168 aa  81.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  36.77 
 
 
180 aa  81.3  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0334  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.97 
 
 
168 aa  80.9  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  37.42 
 
 
172 aa  81.3  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  31.65 
 
 
179 aa  81.3  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  35.58 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0096  mycothiol conjugate amidase Mca  28.37 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.94 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  33.77 
 
 
160 aa  80.1  0.00000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0553  flavin reductase domain-containing protein  39.29 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  30.43 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0578  putative reductase  36.59 
 
 
163 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.637649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>