More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2574 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2574  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
181 aa  370  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2409  flavin reductase domain-containing protein  93.37 
 
 
181 aa  346  9e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2035  flavin reductase domain protein FMN-binding  64.78 
 
 
166 aa  212  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3100  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  50.34 
 
 
155 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0221  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  56.45 
 
 
135 aa  139  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0196  flavin reductase-like protein, FMN-binding  49.66 
 
 
162 aa  134  7.000000000000001e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.869968 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3141  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.05 
 
 
165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1723  flavin reductase domain protein FMN-binding  48.41 
 
 
196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  38.85 
 
 
156 aa  124  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  38.22 
 
 
156 aa  121  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3691  flavin reductase domain-containing protein  38.82 
 
 
158 aa  119  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00123529  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0334  flavin reductase domain protein FMN-binding  46 
 
 
168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3861  flavin reductase-like, FMN-binding  47.06 
 
 
214 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.657973  normal  0.52723 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  44.65 
 
 
175 aa  114  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  41.77 
 
 
180 aa  111  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  40.51 
 
 
180 aa  111  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.29 
 
 
174 aa  110  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
393 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.13 
 
 
155 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  41.92 
 
 
168 aa  106  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3318  flavin reductase-like, FMN-binding  41.72 
 
 
170 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  41.92 
 
 
186 aa  106  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1554  flavin reductase domain-containing protein  40.27 
 
 
154 aa  106  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0149656  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.38 
 
 
311 aa  105  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  40.48 
 
 
170 aa  105  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4507  flavin reductase-like, FMN-binding  39.86 
 
 
162 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.657354  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2513  putative PAH-inducible ring hydroxylating monooxygenase small subunit  47.76 
 
 
158 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0458261 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  42.51 
 
 
173 aa  105  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  43.14 
 
 
175 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  38.85 
 
 
160 aa  105  4e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  38.55 
 
 
177 aa  104  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  42.76 
 
 
172 aa  104  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2695  flavin reductase domain-containing protein  41.07 
 
 
178 aa  104  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2164  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.5 
 
 
186 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  42.11 
 
 
175 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  40.12 
 
 
172 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.14 
 
 
183 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  40.37 
 
 
172 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  40.37 
 
 
172 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2570  flavin reductase domain-containing protein  43.75 
 
 
178 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  41.45 
 
 
175 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4010  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.18 
 
 
176 aa  102  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2179  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.85 
 
 
178 aa  102  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4363  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.6 
 
 
174 aa  102  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  41.45 
 
 
175 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  41.72 
 
 
175 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  41.45 
 
 
175 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1331  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  37.84 
 
 
157 aa  100  9e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0131046  normal  0.0375915 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5008  flavin reductase domain-containing protein  44.16 
 
 
173 aa  100  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0811  flavin reductase-like, FMN-binding  38.95 
 
 
186 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0868  flavin reductase domain-containing protein  43.35 
 
 
237 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.240136  normal  0.360955 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  41.88 
 
 
186 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.54 
 
 
170 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.02 
 
 
160 aa  100  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  40.79 
 
 
302 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  41.45 
 
 
322 aa  100  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  41.03 
 
 
430 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2313  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.2 
 
 
159 aa  100  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  36.75 
 
 
188 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.74 
 
 
177 aa  99.4  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4700  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.84 
 
 
179 aa  99.4  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.403241  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1133  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.37 
 
 
170 aa  99  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  38.31 
 
 
304 aa  99  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1345  flavin reductase-like, FMN-binding  38.12 
 
 
174 aa  98.6  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000569792  hitchhiker  0.00000938161 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5305  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.75 
 
 
184 aa  98.6  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0871  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.69 
 
 
175 aa  97.8  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.190746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  41.18 
 
 
167 aa  97.8  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  40.76 
 
 
169 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.61 
 
 
166 aa  97.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  38.37 
 
 
204 aa  97.1  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  40.13 
 
 
313 aa  97.1  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2616  flavin reductase-like, FMN-binding protein  39.31 
 
 
178 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  40.76 
 
 
169 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.32 
 
 
192 aa  97.1  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2660  flavin reductase domain-containing protein  39.31 
 
 
178 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0383927  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2645  flavin reductase domain-containing protein  39.31 
 
 
178 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  39.49 
 
 
309 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  33.92 
 
 
188 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1916  flavin reductase domain-containing protein  42.25 
 
 
166 aa  95.9  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.751349 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6495  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.26 
 
 
168 aa  95.9  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  39.87 
 
 
202 aa  95.5  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3523  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.12 
 
 
191 aa  95.1  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30752  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.72 
 
 
192 aa  95.1  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2607  nitrilotriacetate monooxygenase component B  43.71 
 
 
166 aa  94.7  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.396427  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1265  flavin reductase domain-containing protein  43.71 
 
 
166 aa  94.7  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.463145 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  39.74 
 
 
169 aa  94.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  40.4 
 
 
311 aa  94.4  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  39.74 
 
 
169 aa  94.4  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  39.74 
 
 
169 aa  94.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  39.74 
 
 
169 aa  94.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.13 
 
 
169 aa  94.4  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4436  hypothetical protein  43.38 
 
 
175 aa  94.4  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  39.61 
 
 
174 aa  94  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  35.8 
 
 
204 aa  94.4  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2517  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  38.41 
 
 
174 aa  94.4  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118991  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  36.31 
 
 
188 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  40.62 
 
 
207 aa  93.6  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2124  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.71 
 
 
184 aa  94  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  36.31 
 
 
188 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  38.65 
 
 
172 aa  93.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>