More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5305 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5305  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 		 184 aa  378  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2957  flavin reductase-like, FMN-binding  44.3 
 
 		 171 aa  131  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  45.1 
 
 		 309 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  40.37 
 
 		 175 aa  127  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  40.37 
 
 		 175 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  41.46 
 
 		 175 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  40.12 
 
 		 175 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  41.46 
 
 		 175 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  46.5 
 
 		 172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  41.36 
 
 		 175 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.51 
 
 		 186 aa  125  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  44.81 
 
 		 175 aa  124  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  42.95 
 
 		 166 aa  124  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  44.91 
 
 		 186 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3429  flavin reductase domain-containing protein  49.32 
 
 		 172 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  43.23 
 
 		 180 aa  123  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  43.23 
 
 		 322 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  43.21 
 
 		 169 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  44.17 
 
 		 169 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  44.17 
 
 		 169 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  44.17 
 
 		 169 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  44.23 
 
 		 168 aa  121  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  41.98 
 
 		 169 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  44.38 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1345  flavin reductase-like, FMN-binding  41.51 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000569792  hitchhiker  0.00000938161 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  40 
 
 		 313 aa  119  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  40 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  41.98 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  41.98 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1836  hypothetical protein  40.76 
 
 		 183 aa  117  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0567658  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  41.18 
 
 		 167 aa  117  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  44.74 
 
 		 186 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.76 
 
 		 165 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  43.71 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  42.59 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3318  flavin reductase-like, FMN-binding  38.92 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.62 
 
 		 311 aa  115  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  42.58 
 
 		 180 aa  115  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  44.67 
 
 		 172 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  40.67 
 
 		 304 aa  115  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  40.28 
 
 		 226 aa  115  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  40.28 
 
 		 226 aa  115  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  41.52 
 
 		 172 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  41.52 
 
 		 172 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  39.49 
 
 		 327 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  42.59 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  42.59 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  42.59 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  42.59 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  42.59 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  42.59 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  42.59 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  39.58 
 
 		 226 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  43.87 
 
 		 172 aa  111  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  38.82 
 
 		 174 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.96 
 
 		 311 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.29 
 
 		 169 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5008  flavin reductase domain-containing protein  43.05 
 
 		 173 aa  108  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  39.61 
 
 		 311 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.1 
 
 		 330 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.56 
 
 		 311 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  38.56 
 
 		 172 aa  108  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  39.51 
 
 		 169 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  38.03 
 
 		 306 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  38.04 
 
 		 172 aa  106  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.6 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3822  flavin reductase domain-containing protein  38.65 
 
 		 175 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  38.71 
 
 		 311 aa  104  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.72 
 
 		 192 aa  104  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  40.36 
 
 		 191 aa  103  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6310  flavin reductase-like, FMN-binding  39.75 
 
 		 161 aa  103  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.72 
 
 		 192 aa  104  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  40.99 
 
 		 408 aa  103  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4664  flavin reductase-like, FMN-binding  38.04 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3699  flavin reductase domain-containing protein  38.04 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.927223  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.96 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0378  flavin reductase domain-containing protein  36.97 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.557848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  38.36 
 
 		 174 aa  101  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6116  flavin reductase domain-containing protein  42.58 
 
 		 320 aa  101  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.362693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0811  flavin reductase-like, FMN-binding  37.8 
 
 		 186 aa  99.8  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0871  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.56 
 
 		 175 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.190746 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3262  flavin reductase-like, FMN-binding  32.93 
 
 		 161 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281543 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  38.82 
 
 		 177 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  37.34 
 
 		 302 aa  99.8  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2283  flavin reductase domain protein FMN-binding  38 
 
 		 191 aa  99.4  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2215  nitrilotriacetate monooxygenase  41.46 
 
 		 318 aa  99.4  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0334  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.5 
 
 		 168 aa  99  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  36.25 
 
 		 162 aa  98.6  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2574  flavin reductase domain-containing protein  36.75 
 
 		 181 aa  98.6  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3360  flavin reductase-like, FMN-binding  39.74 
 
 		 172 aa  98.6  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.439324 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2616  flavin reductase-like, FMN-binding protein  36.84 
 
 		 178 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2660  flavin reductase domain-containing protein  36.84 
 
 		 178 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0383927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  36.25 
 
 		 182 aa  98.2  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2645  flavin reductase domain-containing protein  36.84 
 
 		 178 aa  98.2  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0515  flavin reductase-like, FMN-binding  37.25 
 
 		 160 aa  97.8  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2409  flavin reductase domain-containing protein  37.27 
 
 		 181 aa  97.8  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6495  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.31 
 
 		 168 aa  97.1  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3861  flavin reductase-like, FMN-binding  41.18 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.657973  normal  0.52723 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1986  flavin reductase domain-containing protein  34.69 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2570  flavin reductase domain-containing protein  40.88 
 
 		 178 aa  95.5  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>