More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_5008 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_5008  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
173 aa  355  1.9999999999999998e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  77.46 
 
 
173 aa  277  5e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  68.21 
 
 
186 aa  257  5.0000000000000005e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  68.79 
 
 
186 aa  257  7e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  73.62 
 
 
172 aa  256  9e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  73.01 
 
 
169 aa  255  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  71.43 
 
 
186 aa  248  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  72.39 
 
 
172 aa  247  7e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  66.87 
 
 
168 aa  228  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  67.5 
 
 
170 aa  225  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  62.11 
 
 
167 aa  201  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  58.43 
 
 
169 aa  197  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  57.83 
 
 
169 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  57.83 
 
 
169 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  57.83 
 
 
169 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  57.83 
 
 
169 aa  194  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  57.23 
 
 
169 aa  193  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  57.23 
 
 
169 aa  193  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  56.63 
 
 
169 aa  191  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  56.52 
 
 
171 aa  184  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  56.52 
 
 
171 aa  184  5e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  56.52 
 
 
171 aa  184  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  56.52 
 
 
171 aa  184  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  56.52 
 
 
171 aa  184  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  56.52 
 
 
171 aa  184  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  56.52 
 
 
171 aa  184  5e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  55.28 
 
 
169 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  55.28 
 
 
171 aa  182  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  56.52 
 
 
174 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  54.71 
 
 
204 aa  177  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0811  flavin reductase-like, FMN-binding  52.05 
 
 
186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  53.85 
 
 
191 aa  167  7e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  55.56 
 
 
192 aa  167  9e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  51.57 
 
 
322 aa  166  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  54.94 
 
 
192 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  50 
 
 
175 aa  161  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  51.68 
 
 
166 aa  159  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  50.98 
 
 
180 aa  155  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  47.71 
 
 
304 aa  150  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  49.02 
 
 
180 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  47.71 
 
 
309 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  46.1 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  43.95 
 
 
313 aa  138  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  46.5 
 
 
172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  46.5 
 
 
172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1345  flavin reductase-like, FMN-binding  47.37 
 
 
174 aa  137  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000569792  hitchhiker  0.00000938161 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  50.34 
 
 
174 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  44.72 
 
 
175 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  43.83 
 
 
175 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  44.72 
 
 
175 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  44.72 
 
 
175 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0378  flavin reductase domain-containing protein  47.77 
 
 
168 aa  134  8e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.557848  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  43.21 
 
 
175 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  41.46 
 
 
172 aa  133  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.27 
 
 
165 aa  133  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  43.21 
 
 
175 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  44.67 
 
 
172 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2957  flavin reductase-like, FMN-binding  44.59 
 
 
171 aa  128  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  45.27 
 
 
170 aa  127  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3429  flavin reductase domain-containing protein  49.66 
 
 
172 aa  127  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  44.44 
 
 
408 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1916  flavin reductase domain-containing protein  51.72 
 
 
166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.751349 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  38 
 
 
186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2607  nitrilotriacetate monooxygenase component B  51.95 
 
 
166 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.396427  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1265  flavin reductase domain-containing protein  51.95 
 
 
166 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.463145 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  42.86 
 
 
311 aa  121  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1836  hypothetical protein  39.87 
 
 
183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0567658  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  41.67 
 
 
177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3647  oxidoreductase, putative  40.25 
 
 
161 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0722443  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2261  flavin reductase domain-containing protein  40.25 
 
 
161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2283  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.16 
 
 
191 aa  118  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153986  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4664  flavin reductase-like, FMN-binding  42.28 
 
 
191 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3699  flavin reductase domain-containing protein  42.28 
 
 
191 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.927223  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1841  flavin reductase-like, FMN-binding  40.79 
 
 
161 aa  117  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2083  flavin reductase domain-containing protein  39.62 
 
 
161 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3822  flavin reductase domain-containing protein  42.28 
 
 
175 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5305  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.05 
 
 
184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  43.07 
 
 
302 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  39.86 
 
 
161 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6310  flavin reductase-like, FMN-binding  44.67 
 
 
161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2411  flavin reductase-like, FMN-binding  42.76 
 
 
182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3440  flavin reductase domain-containing protein  38.56 
 
 
161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540454  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.87 
 
 
160 aa  114  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2256  flavin reductase domain-containing protein  38.99 
 
 
161 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550172  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6495  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.22 
 
 
168 aa  114  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3234  flavin reductase-like, FMN-binding  39.22 
 
 
161 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  39.19 
 
 
161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  39.19 
 
 
161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.49 
 
 
311 aa  113  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  38.06 
 
 
179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  37.04 
 
 
182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2574  flavin reductase domain-containing protein  46.75 
 
 
181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3492  flavin reductase domain-containing protein  40.76 
 
 
196 aa  112  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  40.12 
 
 
311 aa  112  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  38.61 
 
 
393 aa  112  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1795  flavin reductase domain-containing protein  43.51 
 
 
164 aa  112  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629541  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  39.19 
 
 
161 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2672  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  37.74 
 
 
161 aa  111  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  40 
 
 
311 aa  111  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3360  flavin reductase-like, FMN-binding  43.02 
 
 
172 aa  111  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.439324 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>