More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3492 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3492  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
196 aa  392  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2517  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  50.3 
 
 
174 aa  149  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118991  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  42.48 
 
 
156 aa  135  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  40.52 
 
 
156 aa  128  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.86 
 
 
155 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02120  conserved protein of DIM6/NTAB family  42.16 
 
 
193 aa  123  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  36 
 
 
186 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  39.88 
 
 
169 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6495  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.16 
 
 
168 aa  114  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.88 
 
 
169 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  39.39 
 
 
226 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  39.39 
 
 
226 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  39.47 
 
 
161 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.5 
 
 
190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.11 
 
 
186 aa  112  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  36.63 
 
 
180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  39.42 
 
 
311 aa  111  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  40 
 
 
186 aa  111  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  38.36 
 
 
172 aa  111  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  39.35 
 
 
327 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  40.91 
 
 
408 aa  111  8.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  38.64 
 
 
226 aa  111  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  36.84 
 
 
161 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  36.84 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.35 
 
 
311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  40.13 
 
 
174 aa  108  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5310  flavoprotein oxidoreductase  39.05 
 
 
181 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00829883  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4133  flavin reductase-like, FMN-binding  54.46 
 
 
129 aa  107  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  38.71 
 
 
306 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.85 
 
 
311 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  41.38 
 
 
186 aa  106  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  40.24 
 
 
173 aa  106  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.72 
 
 
165 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6116  flavin reductase domain-containing protein  46.97 
 
 
320 aa  105  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.362693  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  38.46 
 
 
167 aa  105  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  40.15 
 
 
311 aa  105  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.9 
 
 
311 aa  105  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  38.65 
 
 
171 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  38.65 
 
 
171 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  38.65 
 
 
171 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  38.65 
 
 
171 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  38.65 
 
 
171 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  38.65 
 
 
171 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  38.65 
 
 
171 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3451  flavin reductase domain-containing protein  36.13 
 
 
161 aa  104  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.299495  normal  0.309521 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  33.77 
 
 
160 aa  104  7e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  33.54 
 
 
188 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  36.18 
 
 
162 aa  104  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  33.33 
 
 
204 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  33.54 
 
 
188 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  40 
 
 
170 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5531  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.71 
 
 
183 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0259957  decreased coverage  0.00000136774 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  35.03 
 
 
180 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  37.66 
 
 
302 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  37.58 
 
 
171 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2278  flavin reductase domain-containing protein  37.97 
 
 
170 aa  103  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.663724 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  38.85 
 
 
172 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1781  flavin reductase-like, FMN-binding protein  39.29 
 
 
179 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.160868  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2689  flavin reductase domain-containing protein  41.94 
 
 
181 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  38.32 
 
 
191 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  38.16 
 
 
172 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  38.16 
 
 
172 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  45.99 
 
 
430 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2261  flavin reductase domain-containing protein  35.1 
 
 
161 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2256  flavin reductase domain-containing protein  35.76 
 
 
161 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550172  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5008  flavin reductase domain-containing protein  40.76 
 
 
173 aa  101  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  39.42 
 
 
169 aa  101  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  39.42 
 
 
169 aa  101  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  37.21 
 
 
204 aa  101  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  35.29 
 
 
170 aa  101  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0811  flavin reductase-like, FMN-binding  37.8 
 
 
186 aa  100  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3234  flavin reductase-like, FMN-binding  33.77 
 
 
161 aa  101  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3262  flavin reductase-like, FMN-binding  36.73 
 
 
161 aa  101  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0281543 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  37.12 
 
 
313 aa  100  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3647  oxidoreductase, putative  35.1 
 
 
161 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0722443  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2672  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  34.46 
 
 
161 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  39.42 
 
 
169 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.26 
 
 
169 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  39.42 
 
 
169 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1841  flavin reductase-like, FMN-binding  39.74 
 
 
161 aa  100  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  36.73 
 
 
172 aa  100  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  42.96 
 
 
322 aa  100  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  39.42 
 
 
169 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  32.03 
 
 
188 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.13 
 
 
192 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  39.42 
 
 
169 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  36.94 
 
 
169 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  37.84 
 
 
393 aa  100  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  34.57 
 
 
187 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2215  nitrilotriacetate monooxygenase  42.42 
 
 
318 aa  99.8  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  39.16 
 
 
168 aa  99.8  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  41.22 
 
 
172 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.53 
 
 
192 aa  99.4  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  39.29 
 
 
172 aa  99.8  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  36.48 
 
 
191 aa  99.4  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.42 
 
 
160 aa  99  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  39.19 
 
 
202 aa  99  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3440  flavin reductase domain-containing protein  34.44 
 
 
161 aa  99  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540454  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1795  flavin reductase domain-containing protein  44.59 
 
 
164 aa  99  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629541  normal  0.120123 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>