More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5531 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5531  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 
183 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0259957  decreased coverage  0.00000136774 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5310  flavoprotein oxidoreductase  54.44 
 
 
181 aa  181  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00829883  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1836  hypothetical protein  37.43 
 
 
183 aa  109  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0567658  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  36.36 
 
 
161 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  36.36 
 
 
161 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  37.01 
 
 
161 aa  104  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  36.36 
 
 
161 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3492  flavin reductase domain-containing protein  36.71 
 
 
196 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  31.68 
 
 
170 aa  101  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  34.64 
 
 
156 aa  99  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.54 
 
 
186 aa  98.6  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  34.67 
 
 
156 aa  98.2  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.18 
 
 
160 aa  98.2  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  33.76 
 
 
186 aa  97.8  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3451  flavin reductase domain-containing protein  35.03 
 
 
161 aa  97.8  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.299495  normal  0.309521 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1795  flavin reductase domain-containing protein  37.75 
 
 
164 aa  97.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629541  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3523  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.5 
 
 
191 aa  96.3  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30752  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  35.29 
 
 
162 aa  96.3  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  34.18 
 
 
170 aa  95.9  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  39.06 
 
 
174 aa  95.5  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3262  flavin reductase-like, FMN-binding  33.12 
 
 
161 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0281543 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3440  flavin reductase domain-containing protein  36.11 
 
 
161 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540454  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.91 
 
 
155 aa  95.1  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  35.95 
 
 
172 aa  95.1  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3647  oxidoreductase, putative  35.06 
 
 
161 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0722443  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2261  flavin reductase domain-containing protein  34.42 
 
 
161 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  35.86 
 
 
175 aa  94.4  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2256  flavin reductase domain-containing protein  35.06 
 
 
161 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550172  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  36.92 
 
 
173 aa  93.6  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  32.68 
 
 
160 aa  92.8  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2083  flavin reductase domain-containing protein  35.06 
 
 
161 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2689  flavin reductase domain-containing protein  36.62 
 
 
181 aa  92.8  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  34.55 
 
 
172 aa  92  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  34.55 
 
 
172 aa  92  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1694  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.48 
 
 
166 aa  91.7  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0487183  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  35.66 
 
 
186 aa  91.7  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
172 aa  91.7  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4363  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.33 
 
 
174 aa  91.3  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  34.72 
 
 
186 aa  91.3  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  38.46 
 
 
175 aa  90.9  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  38.46 
 
 
175 aa  90.9  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  38.46 
 
 
175 aa  90.9  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  35.16 
 
 
306 aa  90.9  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  32.81 
 
 
171 aa  90.5  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2957  flavin reductase-like, FMN-binding  35.46 
 
 
171 aa  90.5  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  33.33 
 
 
191 aa  90.5  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  32.81 
 
 
226 aa  90.5  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  33.59 
 
 
171 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  33.59 
 
 
171 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  33.59 
 
 
171 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  33.59 
 
 
171 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  33.59 
 
 
171 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  38.46 
 
 
175 aa  90.1  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  28.85 
 
 
169 aa  90.1  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  29.56 
 
 
169 aa  89.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  33.59 
 
 
171 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.69 
 
 
311 aa  89.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  33.59 
 
 
171 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2406  flavin reductase-like  35.42 
 
 
161 aa  89  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.17627  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3234  flavin reductase-like, FMN-binding  34.72 
 
 
161 aa  89  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  32.81 
 
 
226 aa  89.4  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  35.16 
 
 
311 aa  89.4  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2124  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.1 
 
 
184 aa  89.4  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  32.81 
 
 
226 aa  89.4  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.85 
 
 
311 aa  89  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1498  putative flavin-dependent reductase  33.96 
 
 
174 aa  88.6  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.52 
 
 
169 aa  89  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.59 
 
 
311 aa  89  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 
165 aa  88.6  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  37.69 
 
 
175 aa  88.6  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2672  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  33.99 
 
 
161 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  37.21 
 
 
172 aa  88.2  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3318  flavin reductase-like, FMN-binding  34.62 
 
 
170 aa  88.2  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  34.53 
 
 
327 aa  88.2  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.88 
 
 
169 aa  88.2  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  35.16 
 
 
166 aa  88.2  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3691  flavin reductase domain-containing protein  32.24 
 
 
158 aa  87.8  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00123529  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  34.88 
 
 
168 aa  87.8  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  28.85 
 
 
169 aa  87.8  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  28.85 
 
 
169 aa  87.8  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  28.85 
 
 
169 aa  87.8  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3051  flavin reductase domain-containing protein  34.84 
 
 
166 aa  87.4  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  30.61 
 
 
182 aa  87.8  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  36.49 
 
 
167 aa  87.4  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1345  flavin reductase-like, FMN-binding  35.38 
 
 
174 aa  87.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000569792  hitchhiker  0.00000938161 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4939  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.05 
 
 
178 aa  87.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.372031  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  36.43 
 
 
311 aa  87.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  31.55 
 
 
408 aa  87.4  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  37.69 
 
 
175 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  28.21 
 
 
169 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  28.21 
 
 
169 aa  86.3  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0515  flavin reductase-like, FMN-binding  36.76 
 
 
160 aa  86.7  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  33.33 
 
 
180 aa  86.3  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  28.21 
 
 
169 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2517  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  37.18 
 
 
174 aa  86.7  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118991  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  34.59 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  36.5 
 
 
177 aa  85.5  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
393 aa  85.9  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  34.11 
 
 
172 aa  85.9  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  32.35 
 
 
202 aa  85.1  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>