More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2266 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 		 161 aa  334  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  98.14 
 
 		 161 aa  330  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  97.52 
 
 		 161 aa  328  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  96.89 
 
 		 161 aa  327  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3262  flavin reductase-like, FMN-binding  82.61 
 
 		 161 aa  284  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281543 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3451  flavin reductase domain-containing protein  82.61 
 
 		 161 aa  283  5.999999999999999e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.299495  normal  0.309521 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3440  flavin reductase domain-containing protein  72.05 
 
 		 161 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2256  flavin reductase domain-containing protein  72.78 
 
 		 161 aa  247  6e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2261  flavin reductase domain-containing protein  72.15 
 
 		 161 aa  246  7e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3234  flavin reductase-like, FMN-binding  70.62 
 
 		 161 aa  244  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2083  flavin reductase domain-containing protein  70.89 
 
 		 161 aa  244  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3647  oxidoreductase, putative  70.25 
 
 		 161 aa  243  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0722443  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2406  flavin reductase-like  69.38 
 
 		 161 aa  242  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.17627  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2672  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  70.06 
 
 		 161 aa  239  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  40.76 
 
 		 188 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  40.76 
 
 		 188 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  40.76 
 
 		 204 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.58 
 
 		 190 aa  134  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  40.76 
 
 		 188 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.21 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  40.51 
 
 		 187 aa  130  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  40.13 
 
 		 188 aa  131  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  42.68 
 
 		 408 aa  128  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  39.62 
 
 		 169 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.45 
 
 		 190 aa  124  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  39.62 
 
 		 193 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  39.62 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  40.25 
 
 		 207 aa  120  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  40.74 
 
 		 306 aa  120  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.1 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  38.41 
 
 		 170 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  38.82 
 
 		 393 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0576  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.42 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.79 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  42 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7368  flavin reductase-like, FMN-binding  38.99 
 
 		 169 aa  117  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2517  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  40.25 
 
 		 174 aa  117  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  38.51 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  36.31 
 
 		 172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  39.07 
 
 		 179 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  39.74 
 
 		 204 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  37.18 
 
 		 327 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.89 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  35.26 
 
 		 302 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2215  nitrilotriacetate monooxygenase  42.38 
 
 		 318 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  38.46 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2957  flavin reductase-like, FMN-binding  37.34 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1795  flavin reductase domain-containing protein  44.9 
 
 		 164 aa  112  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629541  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.62 
 
 		 186 aa  111  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3537  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.13 
 
 		 404 aa  111  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  39.19 
 
 		 173 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  40.62 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.29 
 
 		 311 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  38.51 
 
 		 167 aa  109  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  37.33 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  38.06 
 
 		 226 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3492  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 		 196 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  37.66 
 
 		 304 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  39.22 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.4 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  39.86 
 
 		 322 aa  108  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  37.33 
 
 		 156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  36.54 
 
 		 168 aa  107  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 393 aa  107  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  37.91 
 
 		 162 aa  107  9.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  38.85 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.33 
 
 		 311 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1841  flavin reductase-like, FMN-binding  40.67 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  38.85 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  38.85 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  38.85 
 
 		 175 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  34.39 
 
 		 202 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  36.18 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  38.06 
 
 		 226 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.26 
 
 		 311 aa  106  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  38.06 
 
 		 226 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  37.34 
 
 		 169 aa  105  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  36.18 
 
 		 186 aa  104  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5531  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.36 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0259957  decreased coverage  0.00000136774 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  34.23 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  39.42 
 
 		 174 aa  104  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 		 175 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.25 
 
 		 192 aa  103  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  36.71 
 
 		 171 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  36.71 
 
 		 171 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  36.71 
 
 		 171 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  36.71 
 
 		 171 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  36.71 
 
 		 171 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  36.71 
 
 		 171 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  36.71 
 
 		 171 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  35.76 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.07 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  37.34 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6116  flavin reductase domain-containing protein  38.41 
 
 		 320 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.362693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4569  flavin reductase domain-containing protein  36.48 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.168404 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  37.74 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3558  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.18 
 
 		 182 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.62 
 
 		 192 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  37.34 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  37.34 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>