More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4448 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 
165 aa  326  9e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  55.35 
 
 
393 aa  157  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  54.09 
 
 
207 aa  157  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  53.59 
 
 
170 aa  154  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2866  flavin reductase domain-containing protein  52.56 
 
 
175 aa  150  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567161  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  49.68 
 
 
162 aa  145  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  50 
 
 
172 aa  144  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4569  flavin reductase domain-containing protein  49.37 
 
 
168 aa  141  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.168404 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  50 
 
 
204 aa  139  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  41.88 
 
 
169 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  45.45 
 
 
188 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  48.39 
 
 
171 aa  135  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  45.51 
 
 
188 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  45.51 
 
 
188 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  47.37 
 
 
190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  45.51 
 
 
204 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  45.58 
 
 
179 aa  133  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  46.1 
 
 
190 aa  133  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  41.88 
 
 
193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  44.65 
 
 
166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  48 
 
 
191 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0515  flavin reductase-like, FMN-binding  44.3 
 
 
160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  44.94 
 
 
180 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  46.36 
 
 
172 aa  131  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  43.51 
 
 
188 aa  130  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  46.36 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  43.4 
 
 
169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.44 
 
 
169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  45.1 
 
 
170 aa  128  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7368  flavin reductase-like, FMN-binding  42.24 
 
 
169 aa  128  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3537  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.51 
 
 
404 aa  127  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  44.24 
 
 
202 aa  127  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  43.92 
 
 
172 aa  127  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  44.16 
 
 
187 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.95 
 
 
311 aa  127  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1841  flavin reductase-like, FMN-binding  44.87 
 
 
161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.98 
 
 
170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  44.37 
 
 
168 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  45 
 
 
226 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0576  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.21 
 
 
188 aa  125  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  44.59 
 
 
180 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3262  flavin reductase-like, FMN-binding  42.41 
 
 
161 aa  124  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0281543 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  44.81 
 
 
327 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  43.14 
 
 
186 aa  124  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1371  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  47.47 
 
 
169 aa  124  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361303  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  45.16 
 
 
169 aa  123  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  45.16 
 
 
169 aa  123  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  39.74 
 
 
161 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2144  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  51.32 
 
 
162 aa  123  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3523  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  45.39 
 
 
191 aa  123  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30752  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  46.62 
 
 
173 aa  122  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  39.1 
 
 
161 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  46.79 
 
 
162 aa  122  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  39.61 
 
 
167 aa  121  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  39.74 
 
 
161 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2672  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  36.31 
 
 
161 aa  120  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  41.29 
 
 
186 aa  120  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2406  flavin reductase-like  36.54 
 
 
161 aa  120  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.17627  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.57 
 
 
186 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  42.57 
 
 
186 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  43.24 
 
 
172 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  44.52 
 
 
169 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  44.52 
 
 
169 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  39.1 
 
 
161 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  44.52 
 
 
169 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  44.52 
 
 
169 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  43.59 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  43.75 
 
 
226 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  43.75 
 
 
226 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  43.59 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2283  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.62 
 
 
191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153986  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1607  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  43.67 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  43.59 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  43.59 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  43.59 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  43.59 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  42.59 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  43.59 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5008  flavin reductase domain-containing protein  45.27 
 
 
173 aa  118  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.16 
 
 
330 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  43.59 
 
 
171 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  42.31 
 
 
169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  43.42 
 
 
156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2668  flavin reductase domain-containing protein  48.1 
 
 
185 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179398  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  43.87 
 
 
169 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2876  flavin reductase domain-containing protein  48.72 
 
 
185 aa  117  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1498  putative flavin-dependent reductase  47.06 
 
 
174 aa  117  7e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  42.76 
 
 
156 aa  117  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5305  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.76 
 
 
184 aa  117  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1836  hypothetical protein  45.39 
 
 
183 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0567658  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3440  flavin reductase domain-containing protein  38.36 
 
 
161 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540454  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  41.36 
 
 
175 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  40.91 
 
 
322 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4363  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  48.68 
 
 
174 aa  115  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  41.72 
 
 
175 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  41.82 
 
 
175 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  41.82 
 
 
175 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  43.56 
 
 
204 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2261  flavin reductase domain-containing protein  37.82 
 
 
161 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3234  flavin reductase-like, FMN-binding  36.54 
 
 
161 aa  114  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>