More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6241 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
170 aa  345  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  51.95 
 
 
171 aa  159  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  53.59 
 
 
165 aa  154  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  51.01 
 
 
162 aa  154  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  50 
 
 
207 aa  153  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  53.64 
 
 
204 aa  153  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  46.88 
 
 
393 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  46.71 
 
 
172 aa  149  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  47.53 
 
 
408 aa  147  6e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3537  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.05 
 
 
404 aa  147  9e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  46.75 
 
 
179 aa  145  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  45.39 
 
 
169 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  47.71 
 
 
188 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  47.71 
 
 
188 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  47.71 
 
 
204 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2144  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  53.08 
 
 
162 aa  144  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7368  flavin reductase-like, FMN-binding  47.71 
 
 
169 aa  143  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  46.05 
 
 
187 aa  143  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  45.86 
 
 
169 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3523  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  47.02 
 
 
191 aa  142  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30752  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  46.98 
 
 
311 aa  142  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  44.74 
 
 
188 aa  140  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  46.98 
 
 
226 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  47.33 
 
 
190 aa  140  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2866  flavin reductase domain-containing protein  49.03 
 
 
175 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567161  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  45.1 
 
 
188 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  45.39 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.1 
 
 
190 aa  139  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  48.41 
 
 
322 aa  137  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  45.34 
 
 
202 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  45.64 
 
 
226 aa  136  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  45.64 
 
 
226 aa  136  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4569  flavin reductase domain-containing protein  47.68 
 
 
168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.168404 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  44.3 
 
 
306 aa  135  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  44.51 
 
 
168 aa  132  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.74 
 
 
170 aa  130  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  42.76 
 
 
311 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0576  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.38 
 
 
188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  44.74 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.21 
 
 
311 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  40.59 
 
 
169 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  41.18 
 
 
169 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  40.59 
 
 
169 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  41.18 
 
 
169 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  41.18 
 
 
169 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  42.42 
 
 
171 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  42.42 
 
 
171 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  42.42 
 
 
171 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.95 
 
 
311 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  42.42 
 
 
171 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  42.42 
 
 
171 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  42.42 
 
 
171 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  42.42 
 
 
171 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  41.18 
 
 
169 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1841  flavin reductase-like, FMN-binding  43.23 
 
 
161 aa  127  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  43.71 
 
 
172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  40.35 
 
 
174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  40.59 
 
 
169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2876  flavin reductase domain-containing protein  46.1 
 
 
185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  44.44 
 
 
186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.44 
 
 
186 aa  125  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1371  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  50 
 
 
169 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361303  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  41.21 
 
 
171 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  43.51 
 
 
166 aa  124  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2668  flavin reductase domain-containing protein  46.45 
 
 
185 aa  124  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179398  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  43.71 
 
 
182 aa  124  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6116  flavin reductase domain-containing protein  42.77 
 
 
320 aa  124  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.362693  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  41.88 
 
 
313 aa  123  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  40.85 
 
 
191 aa  122  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  44.52 
 
 
170 aa  122  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.05 
 
 
155 aa  122  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  43.04 
 
 
309 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0515  flavin reductase-like, FMN-binding  39.24 
 
 
160 aa  122  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  39.05 
 
 
169 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  39.07 
 
 
161 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2689  flavin reductase domain-containing protein  44.37 
 
 
181 aa  121  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  39.07 
 
 
161 aa  121  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  44.37 
 
 
172 aa  121  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  44.37 
 
 
172 aa  121  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  45.14 
 
 
173 aa  120  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.41 
 
 
166 aa  120  9e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  44.3 
 
 
174 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4939  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  45 
 
 
178 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.372031  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  38.41 
 
 
161 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.05 
 
 
169 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.21 
 
 
160 aa  119  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6310  flavin reductase-like, FMN-binding  42.11 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  40.14 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.21 
 
 
311 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  37.75 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  38.92 
 
 
327 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  42.28 
 
 
304 aa  119  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  44.44 
 
 
186 aa  118  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  43.75 
 
 
172 aa  118  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.36 
 
 
169 aa  118  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  42.57 
 
 
172 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  39.63 
 
 
204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.04 
 
 
174 aa  117  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  41.06 
 
 
156 aa  117  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.52 
 
 
192 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>